More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0762 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  98.38 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  94.59 
 
 		 185 aa  353  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  85.95 
 
 		 185 aa  322  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  57.06 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  54.6 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  55.83 
 
 		 168 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  55.09 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  54.82 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  53.57 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  57.76 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  55.11 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  55.21 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  55.62 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  53.7 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  53.55 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  56.33 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  56.79 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  52.38 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  56.79 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  56.79 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  52.66 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  52.73 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  51.04 
 
 		 193 aa  168  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  52.38 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  52.38 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  55.28 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  52.12 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  55.35 
 
 		 167 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  56.17 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  55.35 
 
 		 167 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  52.66 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  56.17 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  56.17 
 
 		 167 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  56.17 
 
 		 167 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  51.79 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  55.9 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  55.9 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  53.99 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  47.65 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  57.58 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  47.65 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  55.03 
 
 		 173 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  55.28 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  48.47 
 
 		 171 aa  164  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  55.9 
 
 		 167 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  55.7 
 
 		 167 aa  164  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  52.53 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  53.75 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  55.28 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  47.67 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  49.7 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  51.23 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  48.15 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  53.12 
 
 		 167 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  54.14 
 
 		 172 aa  161  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  49.1 
 
 		 169 aa  160  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  47.02 
 
 		 171 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  49.1 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  54.37 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  54.66 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  48.5 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  48.21 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  48.5 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  48.5 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  48.5 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  48.5 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  46.47 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  48.5 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  48.5 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  48.5 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  48.21 
 
 		 171 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  48.77 
 
 		 169 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  48.77 
 
 		 169 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  48.77 
 
 		 169 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  49.7 
 
 		 170 aa  158  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  48.77 
 
 		 169 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  48.77 
 
 		 169 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  54.9 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  53.01 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  49.08 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  51.72 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  50 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  49.1 
 
 		 169 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  47.2 
 
 		 169 aa  154  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  50 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  54.17 
 
 		 171 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  47.9 
 
 		 169 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  48.17 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  46.3 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  46.78 
 
 		 177 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  54.71 
 
 		 171 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  46.78 
 
 		 177 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  49.09 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  45.96 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>