More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0757 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  73.79 
 
 		 607 aa  812    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  96.92 
 
 		 647 aa  1071    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  99.03 
 
 		 647 aa  1198    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0757  DNA primase  100 
 
 		 617 aa  1210    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1138  DNA primase  49.31 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  45.85 
 
 		 452 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  39.47 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  38.6 
 
 		 582 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.57 
 
 		 626 aa  280  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  38.02 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.57 
 
 		 588 aa  277  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.42 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.57 
 
 		 604 aa  274  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 604 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.53 
 
 		 599 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  45.93 
 
 		 619 aa  270  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  36.67 
 
 		 613 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  40.99 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.4 
 
 		 598 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.4 
 
 		 598 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.3 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  37.79 
 
 		 587 aa  269  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.4 
 
 		 598 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.4 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.4 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.4 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  38.92 
 
 		 600 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.67 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.67 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  39.6 
 
 		 629 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  39.82 
 
 		 636 aa  261  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  39.01 
 
 		 598 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  34.29 
 
 		 577 aa  259  7e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.27 
 
 		 593 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.21 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.58 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  33.26 
 
 		 640 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.71 
 
 		 588 aa  257  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  40.51 
 
 		 605 aa  257  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  33.41 
 
 		 632 aa  256  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  36.88 
 
 		 640 aa  256  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  33.47 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  37.12 
 
 		 660 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  37.12 
 
 		 676 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  38.95 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.53 
 
 		 614 aa  252  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.59 
 
 		 595 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  40.46 
 
 		 572 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  33.05 
 
 		 704 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  38.69 
 
 		 636 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  34.71 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.59 
 
 		 595 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  34.12 
 
 		 657 aa  250  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  30.57 
 
 		 595 aa  250  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  35.25 
 
 		 578 aa  250  6e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  37.62 
 
 		 638 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.62 
 
 		 600 aa  250  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  37.85 
 
 		 622 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  32.71 
 
 		 544 aa  249  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  37.82 
 
 		 625 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  39.6 
 
 		 576 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  37.82 
 
 		 625 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  31.82 
 
 		 674 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  43.45 
 
 		 611 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  40.38 
 
 		 580 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  37.96 
 
 		 800 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  37.85 
 
 		 622 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  34.89 
 
 		 656 aa  249  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.97 
 
 		 599 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  44.84 
 
 		 655 aa  247  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  39.95 
 
 		 642 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.66 
 
 		 652 aa  247  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  33.98 
 
 		 636 aa  246  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  37.21 
 
 		 641 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  35.4 
 
 		 634 aa  246  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.15 
 
 		 584 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  39 
 
 		 604 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  37.35 
 
 		 571 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  37.33 
 
 		 630 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  34.03 
 
 		 660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  38.31 
 
 		 627 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  36.84 
 
 		 641 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  32.8 
 
 		 653 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  34.64 
 
 		 639 aa  244  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  39.04 
 
 		 656 aa  243  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  37.79 
 
 		 622 aa  243  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  38.46 
 
 		 623 aa  243  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  36.74 
 
 		 617 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  37.86 
 
 		 641 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  33.73 
 
 		 646 aa  242  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  40.25 
 
 		 604 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  39.38 
 
 		 629 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  39.43 
 
 		 669 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  32.95 
 
 		 581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  37.72 
 
 		 616 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  36.6 
 
 		 666 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  38.52 
 
 		 603 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  32.2 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  38.64 
 
 		 644 aa  241  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  36.38 
 
 		 599 aa  240  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>