More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0696 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 150 aa  306  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  100 
 
 		 150 aa  306  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  100 
 
 		 150 aa  306  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  83.89 
 
 		 152 aa  256  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  49.62 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.87 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  46.62 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  46.62 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  44.83 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  48.51 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  43.45 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  43.15 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  50.39 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  43.15 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  43.15 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  41.61 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.97 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  44.35 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.63 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  44.35 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.43 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  40.16 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.74 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.52 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  43.48 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  41.86 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  42.47 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  44.8 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.71 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  37.14 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  40.48 
 
 		 173 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  40.6 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.21 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  37.8 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.6 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.6 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  45.53 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  39.85 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  39.16 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.16 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  42.96 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.06 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  39.47 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  39.85 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  39.26 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  39.85 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.51 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  38.97 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  38.97 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.52 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  42.52 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.74 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.26 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  39.52 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  39.1 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  41.22 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  42.74 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.41 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  45.32 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  39.1 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  39.42 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  39.42 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.09 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  38.97 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  39.1 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  39.29 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  38.06 
 
 		 167 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  40.3 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  39.29 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.31 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  40.44 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  42.15 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  40.44 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  40.74 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  40.71 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  40.71 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  39.26 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  38.69 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  38.02 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  39.72 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  38.64 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>