More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0594 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  98.65 
 
 		 892 aa  1702    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  100 
 
 		 898 aa  1732    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  97.66 
 
 		 898 aa  1574    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  80.09 
 
 		 905 aa  1351    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  28.01 
 
 		 968 aa  229  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  29.35 
 
 		 982 aa  226  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  28.79 
 
 		 1028 aa  224  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  27.99 
 
 		 968 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  27.08 
 
 		 943 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  27.99 
 
 		 968 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  27.88 
 
 		 968 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  28.98 
 
 		 968 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  28.15 
 
 		 967 aa  217  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  28.92 
 
 		 968 aa  217  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  28.92 
 
 		 944 aa  217  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  28.92 
 
 		 968 aa  217  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  28.92 
 
 		 968 aa  217  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  28.92 
 
 		 968 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  28.21 
 
 		 968 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  28.37 
 
 		 968 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  29.13 
 
 		 967 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  28.22 
 
 		 969 aa  215  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  29.55 
 
 		 948 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  25.9 
 
 		 975 aa  213  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  28.05 
 
 		 919 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  28.05 
 
 		 968 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  28.05 
 
 		 968 aa  213  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  28.05 
 
 		 968 aa  212  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  29.63 
 
 		 948 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  28.05 
 
 		 968 aa  212  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  28.08 
 
 		 968 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  28.05 
 
 		 968 aa  213  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  27.94 
 
 		 968 aa  212  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  28.05 
 
 		 968 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  28.09 
 
 		 968 aa  212  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  27.84 
 
 		 967 aa  210  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  28.1 
 
 		 942 aa  210  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  29.47 
 
 		 968 aa  210  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  27.48 
 
 		 968 aa  210  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  26.02 
 
 		 947 aa  210  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  25.38 
 
 		 970 aa  209  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  28.4 
 
 		 966 aa  209  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  28.71 
 
 		 968 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  28.71 
 
 		 968 aa  208  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  28.71 
 
 		 968 aa  208  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  28.33 
 
 		 968 aa  207  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  29.42 
 
 		 947 aa  207  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  27.58 
 
 		 968 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  28.63 
 
 		 969 aa  207  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  27.56 
 
 		 968 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  27.27 
 
 		 968 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  27.56 
 
 		 968 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  30.57 
 
 		 950 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  24.83 
 
 		 958 aa  205  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  24.83 
 
 		 958 aa  205  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  29.16 
 
 		 948 aa  204  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  30.43 
 
 		 948 aa  204  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  29.48 
 
 		 948 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  29.61 
 
 		 948 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  27.73 
 
 		 968 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  29.66 
 
 		 949 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  33.58 
 
 		 953 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  29.05 
 
 		 948 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  27.82 
 
 		 968 aa  198  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  28.73 
 
 		 948 aa  197  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  27.62 
 
 		 967 aa  195  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  30.04 
 
 		 949 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  29.78 
 
 		 874 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  33.27 
 
 		 960 aa  187  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  30.8 
 
 		 578 aa  161  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  33.73 
 
 		 967 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.62 
 
 		 560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  27.79 
 
 		 560 aa  148  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  27.77 
 
 		 572 aa  147  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  28 
 
 		 560 aa  146  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  32.75 
 
 		 982 aa  146  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.79 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.58 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.58 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.58 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.58 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  32.29 
 
 		 969 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  27.58 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  29.05 
 
 		 555 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  28.96 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  30.69 
 
 		 969 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.76 
 
 		 584 aa  135  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.08 
 
 		 584 aa  131  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  26.49 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  35.03 
 
 		 980 aa  118  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.87 
 
 		 988 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.02 
 
 		 1129 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  26.59 
 
 		 1181 aa  102  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.07 
 
 		 972 aa  102  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 1116 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  34.72 
 
 		 669 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  31.94 
 
 		 1172 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  38.46 
 
 		 1194 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2642  type III restriction enzyme, res subunit  34.1 
 
 		 1044 aa  96.3  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  33.19 
 
 		 969 aa  96.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>