More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0548 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  94.23 
 
 		 220 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  93.75 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  34.2 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  33.85 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  34.02 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 220 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 248 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  33.68 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 270 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 222 aa  87.8  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.84 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.25 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.35 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  29.85 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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