More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0494 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0494  RNA polymerase sigma factor  100 
 
 		 228 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0499  RNA polymerase sigma factor  97.37 
 
 		 228 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.505271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0466  RNA polymerase sigma factor  84.72 
 
 		 229 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0489  RNA polymerase sigma factor  58.44 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1787  RNA polymerase sigma factor  49.28 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6380  RNA polymerase sigma factor  46.3 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3759  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.17 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2124  RNA polymerase sigma factor  43.07 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4879  RNA polymerase sigma factor  40.19 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4136  RNA polymerase sigma factor  40.91 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3390  RNA polymerase sigma factor  40.09 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00687646  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4790  RNA polymerase sigma factor  38.79 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2697  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.34 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3653  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.1 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4197  RNA polymerase sigma factor  42.29 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00284291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2963  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.64 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7492  RNA polymerase sigma factor  42.86 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.732651  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1441  RNA polymerase sigma factor  37.33 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6435  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.83 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6256  RNA polymerase sigma factor  42.2 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0213  RNA polymerase sigma factor  38.28 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1243  RNA polymerase sigma factor  36.49 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.077005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4850  RNA polymerase sigma factor  33.17 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0089  RNA polymerase sigma factor  42.38 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1567  RNA polymerase sigma factor  42.38 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0072  RNA polymerase sigma factor  42.38 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1500  RNA polymerase sigma factor  42.38 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0061  RNA polymerase sigma factor  42.38 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0073  RNA polymerase sigma factor  42.38 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1217  RNA polymerase sigma factor  42.38 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3195  RNA polymerase sigma factor  40.17 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5050  RNA polymerase sigma factor  40.54 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3811  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  38.42 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.98 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2693  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.56 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2791  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.6 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.080251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1055  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.08 
 
 		 199 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.607053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2095  RNA polymerase sigma factor RpoE  38.27 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2321  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.87 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2259  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.6 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2425  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.6 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0205284  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2226  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.57 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0525  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.82 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3616  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.15 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154069  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0985  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.46 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664585  normal  0.0675077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0920  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.46 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.776822  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1746  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.33 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.30228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2251  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.46 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015974  normal  0.140687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1920  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.44 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0798561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3426  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.55 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307484  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1438  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.8 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.389052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2848  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1723  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1369  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.8 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0484883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2906  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419523  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1078  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0536  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2901  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2786  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2808  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1007  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.16 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0834  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1003  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.16 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1796  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2473  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.72 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2177  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.16 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0856  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.57 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380767  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1000  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.57 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231343  normal  0.0259336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4239  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.16 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0647  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.16 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1127  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.16 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1327  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.11 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00289153  normal  0.01768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1085  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.16 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2569  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.22 
 
 		 193 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03970  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.22 
 
 		 195 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2022  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.59 
 
 		 199 aa  95.9  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000162889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4757  RNA polymerase sigma factor AlgU  33.15 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54430  RNA polymerase sigma factor AlgU  33.15 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000031272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  35.29 
 
 		 285 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0040  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.07 
 
 		 194 aa  95.1  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2571  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  44.44 
 
 		 200 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0890  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.51 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.29 
 
 		 288 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2772  RNA polymerase sigma factor AlgU  31.89 
 
 		 192 aa  94.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3155  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.72 
 
 		 192 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000329481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.29 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3068  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.13 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1644  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.42 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1189  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.87 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209698  normal  0.0286964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3246  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.68 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0104683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2150  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.69 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0635  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.16 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1467  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.6 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000401501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1427  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.04 
 
 		 193 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4380  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.04 
 
 		 193 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4294  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.04 
 
 		 193 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.55493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1067  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.04 
 
 		 193 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0360661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1395  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.92 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1793  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.83 
 
 		 189 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1362  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.04 
 
 		 193 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00625661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>