More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0396 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  86.29 
 
 		 372 aa  666    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 370 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  98.65 
 
 		 370 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  99.73 
 
 		 370 aa  753    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  54.17 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.57 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  56.89 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.28 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  53.94 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  52.41 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 359 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.96 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 357 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  52.19 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 361 aa  381  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  52.19 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  52.19 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  52.19 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  52.19 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  52.19 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  53.06 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 361 aa  381  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  51.88 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  52.06 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  51.6 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  51.17 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  48.55 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  48.84 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  51.72 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  52.02 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  48.82 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  48.04 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 361 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>