More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0218 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 		 301 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  99 
 
 		 302 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0195  pseudouridine synthase, RluD  95.68 
 
 		 299 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0653986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  79.05 
 
 		 298 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  35.52 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1878  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  37.94 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2719  RluA family pseudouridine synthase  40 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.344852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  37.15 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6830  pseudouridine synthase, RluA family  39.46 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  36.71 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  36.81 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  38.06 
 
 		 541 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0565  RluA family pseudouridine synthase  40.59 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.789528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  33.75 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0473  pseudouridine synthase, RluA family  37.62 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500273 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  37.75 
 
 		 578 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3178  pseudouridine synthase, RluA family  41 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2639  pseudouridine synthase  39.24 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3557  pseudouridine synthase, RluA family  38.55 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2207  pseudouridine synthase  39.37 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.754235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  31.01 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.87 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3623  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.02 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  42.31 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1123  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.71 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.095131  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  32.99 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22700  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.39 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.17143 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13500  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.22 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2911  pseudouridine synthase, RluA family  35.88 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000259384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2406  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.92 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0234677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10900  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.42 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.89 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0107  pseudouridine synthase, RluA family  35.62 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1813  pseudouridine synthase, RluA family  37.63 
 
 		 526 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000964916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  33.11 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  35.06 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.9 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  35.35 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  34.12 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16460  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.54 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.0163428 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1600  pseudouridine synthase, RluA family  38.61 
 
 		 525 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1390  pseudouridine synthase, RluA family  34.11 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0912  pseudouridine synthase, RluA family  37.74 
 
 		 558 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00634483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0047  pseudouridine synthase, RluD  38.93 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.85 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  36.36 
 
 		 226 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  33.54 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  34.88 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0912  pseudouridine synthase, RluA family  34.78 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  35.49 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.91 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  37.44 
 
 		 217 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.81 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  37.37 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  34.91 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  34.91 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  30.53 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1865  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  49.15 
 
 		 241 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2883  RluA family pseudouridine synthase  34.34 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2118  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.95 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4000  pseudouridine synthase RluA family  34.92 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782666 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1563  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.36 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.151804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.68 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2659  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.14 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  35.94 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7584  pseudouridine synthase, RluA family  38.08 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0816319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  42.36 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.94 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3012  RluA family pseudouridine synthase  36.16 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17598  normal  0.601739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  34.15 
 
 		 342 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2467  pseudouridine synthase, RluA family  37.7 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.235173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2524  pseudouridylate synthase  35.75 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  35.83 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1988  pseudouridylate synthase  35.23 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00771455  normal  0.0114075 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  35.53 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2102  pseudouridine synthase, RluD  35.35 
 
 		 405 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  38.56 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.24 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2896  pseudouridine synthase  35.96 
 
 		 218 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.76004  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3409  pseudouridine synthase  43.89 
 
 		 228 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.386946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  36.45 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5746  pseudouridine synthase, RluA family  34.11 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2710  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.94 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  30.85 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1506  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  43.06 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2551  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.68 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.682293  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  29.59 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0155  pseudouridine synthase  43.06 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3052  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.36 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2080  pseudouridine synthase  47.44 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3353  RNA pseudouridine synthase family protein  37.01 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2909  pseudouridine synthase  42.31 
 
 		 215 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0213  pseudouridine synthase  39.58 
 
 		 240 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1383  pseudouridine synthase, RluA family  33.11 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  35.53 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1209  pseudouridine synthase, RluA family  38.6 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3480  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.02 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0583016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2869  pseudouridine synthase, RluA family  30.98 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2706  pseudouridine synthase  34.98 
 
 		 217 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>