More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0158 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0158  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0147  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0140  TetR family transcriptional regulator  99.52 
 
 		 208 aa  403  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0144  TetR family transcriptional regulator  76.12 
 
 		 221 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0402139  normal  0.55129 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  29.2 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  28.5 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25.76 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  29 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  36.17 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>