228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0112 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
162 aa  322  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  99.38 
 
 
162 aa  320  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  98.15 
 
 
162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  80.86 
 
 
162 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
161 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  51.57 
 
 
164 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  52.47 
 
 
161 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
161 aa  158  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
161 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
160 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  154  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
161 aa  150  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  51.52 
 
 
161 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
161 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  51.52 
 
 
161 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
163 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  49.39 
 
 
164 aa  148  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
161 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  46.3 
 
 
161 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  46.3 
 
 
161 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  47.8 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
161 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
161 aa  143  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  48.47 
 
 
162 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
161 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
163 aa  140  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  46.95 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
160 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 
166 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  47.2 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  44.44 
 
 
161 aa  137  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  49.1 
 
 
161 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  137  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 
163 aa  137  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  45.91 
 
 
163 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  47.9 
 
 
161 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  48.12 
 
 
165 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  45.68 
 
 
163 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
160 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
165 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  47.9 
 
 
161 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
160 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
161 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  47.17 
 
 
165 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  45.34 
 
 
163 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
163 aa  135  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  43.83 
 
 
164 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  46.11 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
164 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
160 aa  134  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  43.21 
 
 
161 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
161 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  48.45 
 
 
163 aa  133  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
161 aa  133  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  51.2 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1080  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240554  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  45.68 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  46.01 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  43.56 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  47.31 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  46.67 
 
 
159 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1813  putative nucleotide-binding protein  43.98 
 
 
165 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0232218  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
165 aa  131  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>