More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0054 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  98.87 
 
 		 441 aa  887    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  82.09 
 
 		 446 aa  719    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  98.41 
 
 		 441 aa  889    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  70.55 
 
 		 444 aa  635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 441 aa  896    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  73.15 
 
 		 445 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  59.2 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  59.2 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  58.39 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  57.92 
 
 		 434 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  57.92 
 
 		 435 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  57.55 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  61.08 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  61.37 
 
 		 434 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  59.81 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  57.82 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  54.8 
 
 		 433 aa  511  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  57.14 
 
 		 432 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  56.37 
 
 		 433 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  54.4 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  56.97 
 
 		 433 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  55.66 
 
 		 433 aa  502  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  57.04 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  54.85 
 
 		 433 aa  502  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  56.64 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  55.79 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  55.56 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  55.08 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  57.07 
 
 		 432 aa  492  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  51.94 
 
 		 432 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  53.55 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  53.44 
 
 		 432 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  53.83 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  54.61 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  52.96 
 
 		 432 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  52.72 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  55.56 
 
 		 433 aa  490  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  54.12 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  54.95 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  53.41 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  54.61 
 
 		 441 aa  480  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  53.18 
 
 		 439 aa  478  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  53.18 
 
 		 439 aa  480  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  51.87 
 
 		 436 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  54.03 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  53.65 
 
 		 435 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  51.25 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  51.64 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  52.93 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  53.4 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  52.72 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  53.97 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  51.4 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  53.79 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.87 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  53.27 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  53.4 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  52.44 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  52.62 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  54.01 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  54.16 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  52.12 
 
 		 434 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  53.7 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  49.65 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  48.95 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  47.91 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  51.9 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  51.91 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  51.79 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  51.89 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  55.37 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  51.8 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  53.72 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  52.36 
 
 		 436 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  50.95 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  50.24 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  52.24 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  50.95 
 
 		 432 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  51.18 
 
 		 433 aa  431  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  52.05 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  48.58 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.74 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  51.67 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  48.59 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  52.01 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  51.65 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  50.24 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  50.36 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  50.95 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  50.95 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  48.46 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  53.97 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  50.57 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>