22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0048 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0036  hypothetical protein  98.68 
 
 
982 aa  1913    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0033  hypothetical protein  95.21 
 
 
982 aa  1812    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116472  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0048  hypothetical protein  100 
 
 
982 aa  1933    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0034  hypothetical protein  48.97 
 
 
975 aa  723    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272533  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  25.77 
 
 
827 aa  59.7  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  25.19 
 
 
866 aa  57.8  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  26.63 
 
 
832 aa  55.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  29.48 
 
 
828 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  28.65 
 
 
828 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  27.31 
 
 
939 aa  53.5  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  25 
 
 
828 aa  52.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  28.65 
 
 
827 aa  52  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  29.48 
 
 
827 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  29.48 
 
 
827 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  29.48 
 
 
827 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  29.48 
 
 
827 aa  51.2  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  24.21 
 
 
872 aa  51.2  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  26.53 
 
 
824 aa  50.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  29.71 
 
 
823 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4902  hypothetical protein  53.85 
 
 
680 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  28.74 
 
 
839 aa  47  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  27.38 
 
 
828 aa  44.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000331771  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>