More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0017 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  100 
 
 		 414 aa  843    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.62 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.62 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.07 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.71 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  25.44 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.15 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  25.61 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  27.92 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  30.04 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.77 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  29.56 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  25.94 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  30.11 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.39 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  29.41 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.34 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22.22 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  28.17 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  25.62 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.75 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  24.82 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  30.98 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  31.25 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.6 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  27.4 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  26.97 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  24.28 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  30.97 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.21 
 
 		 172 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  28.32 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.31 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.95 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  27.4 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  27.6 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  24.04 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.93 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  29.3 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.06 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  28.19 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  27.64 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.74 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.27 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.37 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.19 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.19 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 345 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 345 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.19 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.04 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  25.5 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0222  integrase family protein  30 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  23.9 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  32.91 
 
 		 330 aa  57  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.21 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.81 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  28.85 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.73 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.06 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  23.77 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  24.49 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.64 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  31.79 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.1 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  25.87 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.67 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  24.79 
 
 		 292 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  32.54 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  21.07 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  21.5 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  31.09 
 
 		 341 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.27 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  24.89 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.14 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  22.79 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.26 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  26.42 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.26 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  33.12 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  30.39 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  24.23 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.42 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  26.02 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.11 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>