More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0013 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
206 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
206 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  96.81 
 
 
206 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  79.8 
 
 
211 aa  334  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 
161 aa  97.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  33.89 
 
 
160 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  43.08 
 
 
162 aa  94.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  33.33 
 
 
180 aa  91.7  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.39 
 
 
164 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  34.74 
 
 
163 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.89 
 
 
161 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  28.88 
 
 
182 aa  85.5  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.62 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  42.4 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  29.41 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  30.95 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  29.41 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  37.4 
 
 
158 aa  79  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  28.34 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  38.39 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  28.93 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.84 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  31.71 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  30.4 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  29.84 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  40.98 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  42.16 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  34.96 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.21 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  30.89 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  30.23 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  35.94 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  35.88 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  40.18 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.2 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  33.62 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  38.94 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.51 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  32.58 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.12 
 
 
164 aa  72  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  39.37 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  29.92 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  34.4 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.06 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.06 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.06 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  38.33 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.3 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  38.68 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.5 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  32.97 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  37.6 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  34.82 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  31.33 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  30.3 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.96 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  42.86 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  39.25 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  27.91 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>