More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0001 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  99.78 
 
 
458 aa  930    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.642336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  79.18 
 
 
460 aa  697    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  97.38 
 
 
457 aa  852    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
458 aa  931    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  38.9 
 
 
457 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  42.15 
 
 
445 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.11 
 
 
454 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  38.9 
 
 
457 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  41.65 
 
 
450 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.44 
 
 
449 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.46 
 
 
453 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  41.85 
 
 
446 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  42.21 
 
 
446 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  42.63 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  42.63 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  42.63 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  42.63 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  42.63 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  41.69 
 
 
446 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  40.98 
 
 
450 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  42.19 
 
 
446 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.19 
 
 
446 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  41.86 
 
 
446 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  39.74 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.35 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  39.47 
 
 
458 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.11 
 
 
446 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  41.78 
 
 
443 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.15 
 
 
463 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  41.61 
 
 
442 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  42.49 
 
 
452 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  42.49 
 
 
452 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  40.09 
 
 
452 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  39.15 
 
 
459 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  42.89 
 
 
451 aa  343  5e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.89 
 
 
451 aa  343  5e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  38.36 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  39.55 
 
 
436 aa  342  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  41.13 
 
 
460 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  39.78 
 
 
441 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  41.13 
 
 
460 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.04 
 
 
444 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.13 
 
 
460 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  41.13 
 
 
460 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.39 
 
 
453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.86 
 
 
439 aa  339  7e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  43.06 
 
 
449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.7 
 
 
467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  40.56 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.58 
 
 
450 aa  336  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  40.69 
 
 
462 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  41.05 
 
 
462 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.16 
 
 
480 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  38.06 
 
 
443 aa  332  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  40.82 
 
 
461 aa  333  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  40.84 
 
 
470 aa  332  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 
462 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 
462 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.69 
 
 
461 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  40.61 
 
 
462 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 
462 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 
462 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
461 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  39.91 
 
 
457 aa  329  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.11 
 
 
449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.5 
 
 
455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  40.22 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  39.44 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  41.03 
 
 
445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 
495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  40.35 
 
 
472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  40.43 
 
 
462 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  40.43 
 
 
462 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.36 
 
 
506 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  41.31 
 
 
450 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  40.53 
 
 
468 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  40.31 
 
 
468 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.06 
 
 
439 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.52 
 
 
462 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.7 
 
 
528 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  37.42 
 
 
451 aa  322  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.29 
 
 
469 aa  322  8e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.78 
 
 
464 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.78 
 
 
483 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  39.83 
 
 
466 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  39.83 
 
 
466 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.41 
 
 
455 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 
467 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  39.83 
 
 
466 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  39.83 
 
 
466 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.52 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  39.52 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.32 
 
 
447 aa  320  5e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 
467 aa  319  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>