Gene UUR10_0592 details

Gene Information

• Locus tag: UUR10_0592
• ID: 6983822
• Type: CDS
• Is gene spliced: No
• Is pseudo gene: No
• Organism name: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699
• Kingdom: Bacteria
• Replicon accession: NC_011374
• Strand: +
• Start bp: 711468
• End bp: 713438
• Gene Length: 1971 bp
• Protein Length: 656 aa
• Translation table: 4
• GC content: 19%
• IMG OID: 643400148
• Product: ABC Transporter
• Protein accession: YP_002284957
• Protein GI: 209554188
• COG category: [V] Defense mechanisms
• COG ID: [COG2274] ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain

Plasmid Coverage information

• Num covering plasmid clones: 5
• Plasmid unclonability p-value: 0.187972
• Plasmid hitchhiking: No
• Plasmid clonability: normal

Fosmid Coverage information

• Num covering fosmid clones: n/a
• Fosmid unclonability p-value: n/a
• Fosmid Hitchhiker: n/a
• Fosmid clonability: n/a

Sequence

Gene sequence

ATGAAGATTG TTCAGCAAAC TTCTGATAAC GAATGTGGAG TATGTGTTAT TAATATGTTA 
GCAAATTATT ATCATAATAA AACAATCGAT AAAAACCTTG TATTACAAAA AGCTAATTTA 
ACAAAAAATG GTTTAAATTT ACAAGACCTT GAAAATTTAG CAAATGAATT TAGTTTAGAT 
GCTCAATCAT TTCAATGTAG TTTTCAAGAA TTAATAGATG AAAAAATTAA TGATTATTTT 
ATTGCTTTAA TTAACAGAAA TGGTTTGAAT CATTTTGTAA TTGTTAAATA TTTTAACAAA 
GGATTTTTTC GTATTTATGA TCCAGCTAAT CAAATATATG AGTTAAATAA TGAGCAATTT 
GAACATTTAT TTTTAAATGT TATTATACGT GTTTGCAAAA ATCATAAAAT TTTAAATTTT 
CCTATTTTTA AAGAACCTTA TTTAAAATAC ATCAAAGCAT CATCGTTAAT TATAATTTTG 
CTTTTAGAAT TATTAAATAT CCCTTTAAGT ATTTTTTTAA GCAAAACTGT TAATTTGTTA 
ATTGACTTAG TTTTAATAAA TGAACAAGTT AAAAATCTAA CATATTTATT CATTATCTTT 
AGTTTGTTTT ATATTAGTAG TGCTTTTAAA GATTTGCTAA TAACAGTGTA CGTAAATAAA 
ATTAGTAATC GTATTTTTTG TAGCATTAAT AATGAATTAA TTACAAATTT GACTAATAAA 
TTAATTCAAT TTTTTAATAA GACTAACTTA GGTGAATTAA GTTCAATTCA AATTCACTTA 
AATAATGTCA TTCATTTTTT ATTAGTTAGT CGTATTAAAT TATTGGTTAA TGTTTTATTT 
GGAATTTGTA TTATTTGCTT ATTAGGATTG CAAAATTGAA TTTTATTATT AGTAAGTTTA 
ACATTTGGTT TACTAAGCCT TCTTATAGGT TTAATGAATT GAAAATATTT TAAAAATCAA 
AGCTTAAAAA TGATTAATAT TGAAAATTCA CTATTTATTA AATACCAAAA TTTAATCAAA 
CTAATTAATT TTGAACATAA CACTGATAAA TATAACAATT ATATTCATTC TTATAAAGAA 
CAATTAGATG AATCAATAAT TTTTAGAAAC AAAATTACTA TCTTTAAATC AAATATCAAT 
TTTTATTTAT CAATTATTAA CAATATAGGG CTATTAGTTT TATTAGTTTG TTTAATTATT 
AATGCTAATT ATCAATATAA AATCGTTAGC ATCATTACTT ATATTGTCTT TTTACATCAA 
AATCTTAATA ATTTATCTTT TGGAATTTTT AATTTTTTTA ATGAATTATT AAATTTTAAA 
AATAGTAAGC AAATAATTGA AAAAATTTTA TATGTTAATA ATTGTGAAAA ACATGATGGT 
ATAGAAATTA ATAAAGTATT GGCATGCAAA ATTATTAAAG ATCAAAAAAC ATTTGAATTT 
CAAAAATCAT GTTTAATCAT CGGTAAAAGT GGAATTGGAA AAACAACATT ATTAAAAAAT 
TTTTTAGATT TTAATAATAA AAATCTATTT TTTAATGATT TAAATATAAG TAGTTTAAAT 
TTAAAACAAC TAAAAGAATT AATTATTTAT CATCCAACAA ATGCTTTAAT TAATGATTTT 
AATATTAATT GGTTTGTTAA TCAAAATCAA GAAATAACTA ATGCTTTAAA AATAGTGATT 
GCTACAGCTA AAATTGATTG GTCATTAAAT AGTAATTTTG AGCAAAACAT TAATTTATCA 
ACAGGCCAAC AACAAATTTT AGCTTTTTTA AATCTTTTAA AATATAAAAA TAAATTATTA 
CTACTTGATG AACCATTAGC CCACGTTGAC ACTGATAATA AAAAAATAAT TTTAGATTCA 
ATATTGCCAT TAGTACTTAA AAATAATTTT GTTATTTATG TTTCGCATGA TCATTATCTA 
AAAAACTATT TTGATCAAAT AATTAATTTG AATGATGAAA AAATGAATTA G 

 

Protein sequence

MKIVQQTSDN ECGVCVINML ANYYHNKTID KNLVLQKANL TKNGLNLQDL ENLANEFSLD 
AQSFQCSFQE LIDEKINDYF IALINRNGLN HFVIVKYFNK GFFRIYDPAN QIYELNNEQF 
EHLFLNVIIR VCKNHKILNF PIFKEPYLKY IKASSLIIIL LLELLNIPLS IFLSKTVNLL 
IDLVLINEQV KNLTYLFIIF SLFYISSAFK DLLITVYVNK ISNRIFCSIN NELITNLTNK 
LIQFFNKTNL GELSSIQIHL NNVIHFLLVS RIKLLVNVLF GICIICLLGL QNWILLLVSL 
TFGLLSLLIG LMNWKYFKNQ SLKMINIENS LFIKYQNLIK LINFEHNTDK YNNYIHSYKE 
QLDESIIFRN KITIFKSNIN FYLSIINNIG LLVLLVCLII NANYQYKIVS IITYIVFLHQ 
NLNNLSFGIF NFFNELLNFK NSKQIIEKIL YVNNCEKHDG IEINKVLACK IIKDQKTFEF 
QKSCLIIGKS GIGKTTLLKN FLDFNNKNLF FNDLNISSLN LKQLKELIIY HPTNALINDF 
NINWFVNQNQ EITNALKIVI ATAKIDWSLN SNFEQNINLS TGQQQILAFL NLLKYKNKLL 
LLDEPLAHVD TDNKKIILDS ILPLVLKNNF VIYVSHDHYL KNYFDQIINL NDEKMN