Gene UUR10_0514 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagUUR10_0514 
Symbol 
ID6984312 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameUreaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_011374 
Strand
Start bp563563 
End bp566130 
Gene Length2568 bp 
Protein Length855 aa 
Translation table
GC content26% 
IMG OID643400082 
ProductDNA topoisomerase IV, A subunit family protein 
Protein accessionYP_002284902 
Protein GI209554161 
COG category[L] Replication, recombination and repair 
COG ID[COG0188] Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit 
TIGRFAM ID[TIGR01061] DNA topoisomerase IV, A subunit, Gram-positive 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGAGTGTAA ATCAACAAAA AATTATTAAT ACACCATTAG ACAACATTGT TGGTGAAAGT 
TATGCTAAAT ATGCAAAATA TATTATTCAA GATCGTGCTT TACCAGATAT TCGTGATGGT
TTAAAACCCG TTCAACGACG TATTTTGTAT GCCATGAGCG AATTAGGAAT TTTTCATGAC
AAACCTTACA AAAAATCAGC ACGTACAGTT GGGGAAGTAA TTGGTAAATA CCACCCTCAT
GGTGATTCAT CAATTTATGA AGCTATGGTA AGAATGAGTC AAGATTGAAA AAATAATTTA
TGCTTATTAG ATATTCATGG TAATAAAGGT TCGATTGATG GTGATAACGC TGCTGCGATG
CGTTATACAG AAACACGTTT ATCAAAAATT GCTAGTGTAA TGCTAACTAA TTTAAAAAAA
GATGTAGTTA AATTTAGTCC AAACTTTGAT GATAGTGAAA AAGAACCATC AATTTTACCA
TCACTTTTTC CTAACTTATT AATTAATGGA GCAACAGGAA TTGCTTCAGG ATATGCAACA
AGTATTCCAC CTCATAATCC TAATGAAGTT TTTGATGCTT TAATTTATCG AATTGATCAT
CCAGATTGTA GTATTGAAAA ATTAATTAAA ATTTGTCCAG CGCCAGATTT CCCAACAGGG
GGAGAAATTC ATGATTTAAA TGGATGTGCA AATGCTCACA AAACTGGTGA AGGTAAATTT
GTAATCCGAG CTTCAATTGA ATTTAAAACA AGTGAAGCAA AAATTAATCA AATCATTATT
AATTCCATTC CTTATGAAAC AAATAAAGCT TTAATTATTA AAGAAATTGA AGATATTATT
TACAATAAAG AAGTTGCTGG TTTAATCGAA GTTCGTGATG AATCAGATGC TAAGGGTGTT
AGCATTATCA TTGATACTAA AAAAGATGTT AATTTAGAAA ATGTTAAAAA TTATTTATAC
AAAAAAACTA GTTTGGAAAT TAGTTATAAT ACAAAATTTA TTGCAATTGT TCATCGAACA
CCAACACTTG TAAGTTTATC AACGTATCTA GATGCGCAAA TCAACCATAG TCTTGATGTT
ATTAATAAAG TTGATTTATA TGATTTAAAT AAAGTTTTAT TACGTATTGA AATTGTTGAA
GGTTTAATTA AATGTGTTGA TTTAATCGAT GAAATTATTA AAATTATTCG GGCTAGTGAT
TCACGCCAAG ACGCAAAAAA TGCTTTAATT CAAACATTTG CTTTTACTAA TAATCAAGCT
GAAGCAATTA TTATGATGCG TTTGCATAAT TTAACACGCA CAGATATATT TGATTTAAGA
AATGAATGAG AAAGTCTTCA ACAACAAGCT AAAATACTAA AAGAGCGAAT TAAATCACTT
CAAGTTCGCA AAAATTATTT AAAACAAAAA ATGATTGAAT TCAAAAAAGA ATTTGGTTAT
CAACGTAAAA CAAAATTATT TGATGAGTTT ATAAAAGCTG AAGTTAATGA AGATCAAATG
ATTGAAAAAC AAAGTTTAAA TTTAGTTATT AGTCGTGATG GATATATTAA AATTGTTTCT
AAAAAATCAT TTGAATCTTC AAAATATGAT GAATTAGGAC TAAAAACTAA TGATCTTCTT
TTTTATCATA ATGTAATTAA TTCGCATGAT CGAATTTTAA TTATTACATC AAAAGCAAAA
TTAATTAATT TAATTGCACA TAAAATTAGT TGTATGCGTT GAAAAGATGT TGGTGAACAT
TTAAATAATT ATGCTAAATT TGATGCTAAT GAAAAAGTTG TAGCAGTTTA TGTATGCAAT
GAACAATTTA AAGTTGATGA ACACCAATTA GTTTTAGGTT CAAAACTAAA TTTAATTAAA
AGAATTGAAT TAAATGAGTT AGATTTAAAT AAAAATAGCA AACAAATTAG TATTATGAAA
CTAAATGAAA ATGATGGTTT AATTAGTGCT AATTTAATTA AAAAAGATCA TAATCAATTT
GTTGTTGCAA TTTCTAAACT AGGGTTAGTG TTAATGTTTT TAGTTCATGA AATTAATTGT
TTAAATCGTT TAGCAAAAGG GATTAAAATC ATGAAATTAA AACCAAATGA TGAAATTAGT
TCAATTCTAA TCGTTCCTAA TAATGGTTAT AGTATTCAAC TTTTTTTAGA TCAAGGTAAT
AAGTGTTTTA GTATTAGTGA GCTAAAATTA TCAAAACGTG CAATGACACC ATCACCACTT
TATTTACCAA CAAAAAAAGC ACAAAGCGTT TTAGCAGCAT TTTTAGTTGG TAATGAAAAT
GTTTTCTATT TATTAGATGA ACAACAAAAA ATAAATCCAT ACTATTTACC AAATCCAAAA
CCAATAAAAT TAAATTCTAA AATTAATAAA TACGAAAATG ATCTTATTAT AACTGATGTT
GTTAAAGATA GTTTTTTAAG TGATAGTGTT ATAAGTGATT TTAAAAAAAT TAGTATGTAT
GCAAATGAAT TTGATAGTGA ATTATTAAAA ACCAATGAAA ATCAAGAGCA AGATGATTTG
CAATTAGAAT TAATGAGAAA GAAGAAAATG ATTAATGATA ACAAATAA
 
Protein sequence
MSVNQQKIIN TPLDNIVGES YAKYAKYIIQ DRALPDIRDG LKPVQRRILY AMSELGIFHD 
KPYKKSARTV GEVIGKYHPH GDSSIYEAMV RMSQDWKNNL CLLDIHGNKG SIDGDNAAAM
RYTETRLSKI ASVMLTNLKK DVVKFSPNFD DSEKEPSILP SLFPNLLING ATGIASGYAT
SIPPHNPNEV FDALIYRIDH PDCSIEKLIK ICPAPDFPTG GEIHDLNGCA NAHKTGEGKF
VIRASIEFKT SEAKINQIII NSIPYETNKA LIIKEIEDII YNKEVAGLIE VRDESDAKGV
SIIIDTKKDV NLENVKNYLY KKTSLEISYN TKFIAIVHRT PTLVSLSTYL DAQINHSLDV
INKVDLYDLN KVLLRIEIVE GLIKCVDLID EIIKIIRASD SRQDAKNALI QTFAFTNNQA
EAIIMMRLHN LTRTDIFDLR NEWESLQQQA KILKERIKSL QVRKNYLKQK MIEFKKEFGY
QRKTKLFDEF IKAEVNEDQM IEKQSLNLVI SRDGYIKIVS KKSFESSKYD ELGLKTNDLL
FYHNVINSHD RILIITSKAK LINLIAHKIS CMRWKDVGEH LNNYAKFDAN EKVVAVYVCN
EQFKVDEHQL VLGSKLNLIK RIELNELDLN KNSKQISIMK LNENDGLISA NLIKKDHNQF
VVAISKLGLV LMFLVHEINC LNRLAKGIKI MKLKPNDEIS SILIVPNNGY SIQLFLDQGN
KCFSISELKL SKRAMTPSPL YLPTKKAQSV LAAFLVGNEN VFYLLDEQQK INPYYLPNPK
PIKLNSKINK YENDLIITDV VKDSFLSDSV ISDFKKISMY ANEFDSELLK TNENQEQDDL
QLELMRKKKM INDNK