| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | Sare_1249 |
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| Symbol | |
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| ID | 5704874 |
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| Type | CDS |
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| Is gene spliced | No |
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| Is pseudo gene | No |
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| Organism name | Salinispora arenicola CNS-205 |
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| Kingdom | Bacteria |
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| Replicon accession | NC_009953 |
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| Strand | + |
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| Start bp | 1432589 |
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| End bp | 1437958 |
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| Gene Length | 5370 bp |
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| Protein Length | 1789 aa |
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| Translation table | 11 |
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| GC content | 70% |
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| IMG OID | 641270764 |
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| Product | Beta-ketoacyl synthase |
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| Protein accession | YP_001536145 |
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| Protein GI | 159036892 |
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| COG category | [Q] Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism |
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| COG ID | [COG3321] Polyketide synthase modules and related proteins |
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| TIGRFAM ID | |
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Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 1 |
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| Plasmid unclonability p-value | 0.191618 |
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| Plasmid hitchhiking | No |
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| Plasmid clonability | normal |
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Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | 2 |
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| Fosmid unclonability p-value | 0.0000247366 |
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| Fosmid Hitchhiker | No |
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| Fosmid clonability | decreased coverage |
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Sequence |
| Gene sequence | TTGGCTGACG AGGTACAACT CCGCGACTAC CTCAAGAGGG CCATCGGAGA CGCCCGCGAC
GCCCGCAGGC GGCTGCGCGA GGTCGAGGAC CAGGCGCGGG AGCCGGTCGC CATCGTCGGG
ATGGCGTGTC GGTACCCGGG CGGCGTGTCC TCGCCGGAGG ACCTGTGGGA CGTGGTGGCG
AACGGGGTCG ACGCCGTCGC CGACTTTCCC ACCGACCGTG GCTGGGACCT GGTGGGTCTG
TTCGATCCGG ACCCCGATCG TCCGGGTACC TCGTATGTCA GCCAGGGCGG TTTCCTGTCC
GAGGCGGGGC TGTTTGATGC GGGGTTTTTC GGGATTTCGC CGCGGGAGGC GTTGGCGATG
GACCCGCAGC AGCGGCTGCT GCTGGAGACC TCCTGGGAGG CGATGGAACG GGCGGGCATC
GACCCGTCGT CCTGGAGCGG CAGCGACGTC GGCGTGTTCG CCGGGCTGTC CGGCCAGGGC
TACGGTGCCG GCTCCGGCCG CCAGGTCGCT CCGGAGCTGG AGGGTTTCGC GGGTACGGGT
GCTGCTCCGT GCATCGCGAC CGGCCGGGTG TCGTACGTGT TCGGGTTCGA GGGACCTGCG
GTGACGGTGG ACACGGGGTG TTCCTCGTCG TTGGTGGCGA TTCACCTGGC CATGCAGGCG
TTGCGGCAGG GTGAGTGCTC GTTGGCGCTG GCGGGCGGCG CGATGGTGAT GGCCCAGCCC
GGCTCCTTCC TGTCGTTCTC CCGGCAGCGG GGGTTGGCTG CCGATGGGCG GTGTAAGGCG
TATGCGGACG GTGCGGATGG GATGGGGTTG GCTGAGGGGG TTGGGTTGGT GTTGTTGGAG
CGGTTGTCGG TGGCTCGGGA GCGTGGGCAT CGGGTTTTGG CGGTGTTGCG GGGTAGTGCG
GTGAATCAGG ATGGTGCGTC GAATGGGTTG ACGGCGCCGA ATGGTCCGTC GCAGCAGCGG
GTGATTCGTG CGGCGTTGGC GAGTGCGGGG TTGGCGCCGT CCGAGGTGGA TGTTGTTGAG
GGGCATGGTA CGGGTACGTC GTTGGGTGAT CCGATCGAGG CGCAGGCGTT GCTGGCCACG
TATGGCCAGG GTCGTGACCA GGAGCGTCCG CTGTGGCTGG GATCGGTGAA GTCGAACATC
GGGCACACCC AGGCGGCGGC GGGTGTGGCC GGCGTGATCA AGATGGTGCA GGCGCTGCGT
CACGGCGTCC TCCCGGCGAC GCTGCACGTG CACCAGCCCA GCACCCAGGT GGACTGGTCC
ACGGGTGAGG TCGAGCTGCT CACGAGGGCA CGCGAGTGGC CACGGCGTGA GCTCCCGCGC
CGGGCGGGGG TGTCGTCGTT CGGGATCAGT GGCACCAATG CTCATCTGAT TCTCGAGGAG
GCGCCGGGGG AGCCCGAGGT GGCTGAGGTG CCGGCCGAGG AGGTTCCGGT TCAGGGTGTG
GTGCCGTTGG TGGTGTCGGC GCGTAGTGCC GGGGCGTTGG CGGGGCAGGC GGATCGGCTG
ACGGGGTTCG TCAGGTCGGG GGCGGCGCCC ATGTCGGATG TGGCGGGTGC GTTGGTTTCT
CGTCGGGCGG TGTTTGGTGA GCGGGCCGTG GTGGTGGCGG GTTCGGGTGA TGAAGCGTTG
GTTGGGCTTG GTGAGCTTGC TCGTGGGCAG GCTGGTGCTG GCGTGGTGGC TGGTAGCGCC
GGGGCGGTGG GTGGGGTGGT GTGGGTGTTT CCGGGTCAGG GGACGCAGTG GTTGGGGATG
GGTCGGGAGT TGTTGGATTC GTCGTCGGTG TTTGCGGGGC GGGTTGCTGA GTGTGCGGTG
GCGTTGGGGC GGTGGGTGGA TTGGTCGTTG GTGGATGTGT TGCGTGGTGA GGTTGGTGGT
GGGTTGTTGG AGCGGGTTGA TGTGGTGCAG CCGGCGTGTT TTGCGGTGAT GGTTGGTTTG
GCGGCGGTGT GGGAGTCGGT GGGTGTGCGG CCTGATGTGG TGGTGGGTCA TTCGCAGGGT
GAGATTGCGG CGGCGTGTGT GGCGGGTGCG TTGTCGCTTG AGGATGCGGC GCGGGTGGTG
GCGTTGCGTA GTCGGGCGAT TGGTTCGGTG TTGTCTGGTC GGGGTGGTAT GGCGTCGGTG
GCGTTGGGTG AGGAGGAGGT GGTGGCGCGG TTGGGTCCGT GGGGGGGTCG GGTGGAGGTG
GCTGCGGTTA ATGGTCCTTC TTCGGTGGTG GTTGCGGGTG ATGGTGGGGC GTTGGATGAG
GTGTTGGGGT TGTTGGTGGG TGAGGGTGTT CGGGTGCGGC GGGTGGCGGT GGATTATGGG
TCGCATTCGA GTCAGGTGGA GGCGCTTGAG GGTGTGCTTG CTGAGGCGTT GGTGGATGTG
CGGGGGTTGG CGCCGAGGGT GCCGTTGTAT TCGACGGTGA CGGGTGAGTG GGTTCGGGAT
GCGGGGGTTG TGGATGGTGG GTATTGGTAT CGGAATTTGC GTGGGCAGGT GCGGTTTGGG
TCGGCGGTGG CGGATTTGGT TGGGTTGGGG TATCGGACGT TTGTGGAGGT GAGTGCTCAT
CCGGTGTTGG TTCAGCCGAT CAGTGAGGTT GTTGAGGGTT CTGAGGTGGT GGTTACGGGG
ACGTTGCGTC GGGATGAGGG TGGTTTGCGG CGGTTGTTTA TGTCGATGGC TGAGTTGTTT
GTTCGGGGTG TGTCGGTGGA TTGGGCTGCG GTGGTGCCGT CGGTGGGTCC GCGGGTGGAG
TTACCGACGT ATGCCTTTGA CCATCAGCAC TACTGGCTGC AGACCGAGGA GTCGACCGAT
GCGGCCTCGC TGGGTCTGTC GGCGGTGGAC CACCCGCTGT TGACGGCAGC GGTCCCCCTG
CCCCGATCCG ACGGCCAGGT GTTCACCACA CGCCTGTCGC CACGATCGCA CCCCTGGCTG
GCCGATCACG TCGTCGACGG GGTTGTGCTC CTGCCCGGCA GCGCACTTGT GGAGTTGGTG
GTGCGGGCCG GCGACGAGGT GGGATGTCCG GTACTGGACG AACTCACGAC GGAGGCGCCG
CTGGTGGTGC CCGAGCACGG CGCCGTCCGC GTCCAGGTGG CCCTGAGCGG ACCCGGGGAG
AACGGCGCCC GGACGGTGGA CGTGTACGCC CAGCGGGAGG ACGCGCACGG GTGGACGCGG
CACGCCACCG GTGTCCTCTC CGCCGCCCAG CCGCCGGCTT CCGACTTCGA CTTCACGGCG
TGGCCACCAC CGGGCGCCCG GCCGGTCGAG GTGGCGGACT TCTATCCAGG CCTGACCGAT
CGGGGGTACG CCCACGGGCC CGCACTCCAG GCCCTGGGCG CGCTGTGGCA GCGCGGTGAG
GAGGTGTTCG CCGAGGTCGT CCTGTCGGAC GACACGGATA CGGCGGGCAG CTTCGGGGTG
CATCCCGCAT TGCTGGACGC GGCCCTGCAG CCGATGCTGC GCCGCGCCGG AGACGACCAG
GACGAGCCGT GGCTGCCGCT CGACTGGGCG AGGCTGACGC TGCACCGCTT CGGCGCCGCG
ACGCTGCGGG TGCGGCTGGT GCCCGGAGCG GCCGGCACCG TCTCACTGGA GGCGGCCGAC
GGGACCGGTG GCCTGGTGGT CACGGCCGAC TCGGTCGTCT TCCGGCCGGT GTCCGTCGAG
AAGCTCGCGA CGACGACGGG TATCCACGAC TCGCTGTTCC AGGTGGAGTG GACCCGGTTG
ACGGCGGCGG AGCCGGTCGA TGCTCGGCCC GACGTCGAGA TCCTGGAGGT AGCCGGCGGG
CAGGACGTCC TGGCTGCTGT CTCGCGCGTG CTGGCCGCGC TGCAGGCCGG GCTGACCAGG
TCGGAGGAGT CGCGACTGGT GGTCGTGACC CGGGCCGCGG TGGCCGTCGG GGATCAGGCG
GCTGCTGACC CGGCCGGGGC GGCCGTGTGG GGCCTGACGC GCTCCGCCCA GGCCGAGAAC
CCGGGCCGGA TCACCCTGCT GGATCTCGAG CCCGACAGTC CCGTCGAGCA GGTGCTGGGA
TCGGTGCTGA CCAGCGCGGA ACCGCAGGTG GCGACCCGCG GAGGCGCACT GTTCGCCCCG
CGTCTGGCCC GCGCCGACGA GCAGCAGACG CGGAAGGCCC GCGCCGGGTT CGGTCCGCAC
GGGGCGGTGC TGGTCTCCGG CGCGGGCGTG CTCGGCGCCG TGGTGGCCCG GCACCTCGTG
ATCCGGCACG GTGTGCGGCG TCTCGTGCTG GCCAGCCGGC GGGGTCCGGA CGCCGACGGC
AGCGCGGACC TGGTCGCGGA GCTGACGCAG CTCGGCGCCG AGGTGTCGGT CGTCGCCTGT
GACCTGTCCG ACCGGGACCA GGTGTCAGCG CTGCTGGCGG TGCACCGTCC AACCGGTGTC
GTACACACGG CGGGTGTTCT CGACGACGGT GTGACCGCGG CGCTGACTCC GGAGCGGTTG
GCTCGGGTGT TCGCGCCCAA GGTCGACGCC GTGCGGCATC TCGACGAGTT GACCCGTGAC
CTGGACCTCG ACGCGTTCGT GGTGTTCTCG TCCGGGTCGG GTGTGTTCGG CTCCCCCGGG
CAGGGCAACT ACGCGGCGGC GAACGCCTTC CTCGACGCGG TGATGGCGAA CCGCCGGGCG
GACGGCCTAC CGGGGTTGTC GTTGGCGTGG GGGCTGTGGG AGCAGACCAC GGGCCTGACC
GCGCACCTCG GCGGAGCTGA TCAGGCACGC ATGAGCCGCG GCGGTGTGCG GGCCATGACA
GTGGTGGAGG GCATGGACCT GTTCGACGCC GCGCTGGCGT CTGAGCAGGC CCTGCTGGTA
CCGGTCAAGC TTGACCTCCG GGAGGTGCGT GCCGGCGGCA CGGTGCCACA CCTGCTGCGC
GGTCTGGTGC GGCCAGGACG GCAGCAGTCG CGGGCCGCGG TCGACGGGGA CGGTGGGCTG
GCGAGGCGGC TCGCCGAACT GGCTCCGGCG GACCAGGAGT CGCTGCTGCT GGACCTGGTA
CGCGGCCAGG TCGCGGTCGT GCTCGGGTAC TCCGGCGCGA CTGCCGTCCG GGCGGACGGG
GCGTTCAAGG ACGCCGGTTT CGACTCGTTG ACGTCGCTGG AGCTGCGCAA CCGGTTGCGT
GCGGCGACCG GTCTGAAGCT GCCGGCCACG ATGGCTTTCG ACTACCCGAC CCCGTACCTC
CTGGCGCGTC ACCTGCGTGA CGAGTTCGAT ACCGATGGTG ATGTGGTCAC CCAGGTCACC
ACCCGGATCG AGGAGCTCGA GGCACTGGTC GGCGACCTCG CCCTCGACAA ATCCACGAAA
ACCGCCCTCA CGCTTCGACT GCAAGGGCTG GTGGCCAGGT GCAACGGAAT CGGCGAGCAG
GCGGACACGG CCTCGGTGGC GGAGCAGCTC GAATCGGCGT CCGCCGATGA CGTCCTTGAC
TTCATCGACG CGGAACTCGG CCTCACCTGA
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| Protein sequence | MADEVQLRDY LKRAIGDARD ARRRLREVED QAREPVAIVG MACRYPGGVS SPEDLWDVVA
NGVDAVADFP TDRGWDLVGL FDPDPDRPGT SYVSQGGFLS EAGLFDAGFF GISPREALAM
DPQQRLLLET SWEAMERAGI DPSSWSGSDV GVFAGLSGQG YGAGSGRQVA PELEGFAGTG
AAPCIATGRV SYVFGFEGPA VTVDTGCSSS LVAIHLAMQA LRQGECSLAL AGGAMVMAQP
GSFLSFSRQR GLAADGRCKA YADGADGMGL AEGVGLVLLE RLSVARERGH RVLAVLRGSA
VNQDGASNGL TAPNGPSQQR VIRAALASAG LAPSEVDVVE GHGTGTSLGD PIEAQALLAT
YGQGRDQERP LWLGSVKSNI GHTQAAAGVA GVIKMVQALR HGVLPATLHV HQPSTQVDWS
TGEVELLTRA REWPRRELPR RAGVSSFGIS GTNAHLILEE APGEPEVAEV PAEEVPVQGV
VPLVVSARSA GALAGQADRL TGFVRSGAAP MSDVAGALVS RRAVFGERAV VVAGSGDEAL
VGLGELARGQ AGAGVVAGSA GAVGGVVWVF PGQGTQWLGM GRELLDSSSV FAGRVAECAV
ALGRWVDWSL VDVLRGEVGG GLLERVDVVQ PACFAVMVGL AAVWESVGVR PDVVVGHSQG
EIAAACVAGA LSLEDAARVV ALRSRAIGSV LSGRGGMASV ALGEEEVVAR LGPWGGRVEV
AAVNGPSSVV VAGDGGALDE VLGLLVGEGV RVRRVAVDYG SHSSQVEALE GVLAEALVDV
RGLAPRVPLY STVTGEWVRD AGVVDGGYWY RNLRGQVRFG SAVADLVGLG YRTFVEVSAH
PVLVQPISEV VEGSEVVVTG TLRRDEGGLR RLFMSMAELF VRGVSVDWAA VVPSVGPRVE
LPTYAFDHQH YWLQTEESTD AASLGLSAVD HPLLTAAVPL PRSDGQVFTT RLSPRSHPWL
ADHVVDGVVL LPGSALVELV VRAGDEVGCP VLDELTTEAP LVVPEHGAVR VQVALSGPGE
NGARTVDVYA QREDAHGWTR HATGVLSAAQ PPASDFDFTA WPPPGARPVE VADFYPGLTD
RGYAHGPALQ ALGALWQRGE EVFAEVVLSD DTDTAGSFGV HPALLDAALQ PMLRRAGDDQ
DEPWLPLDWA RLTLHRFGAA TLRVRLVPGA AGTVSLEAAD GTGGLVVTAD SVVFRPVSVE
KLATTTGIHD SLFQVEWTRL TAAEPVDARP DVEILEVAGG QDVLAAVSRV LAALQAGLTR
SEESRLVVVT RAAVAVGDQA AADPAGAAVW GLTRSAQAEN PGRITLLDLE PDSPVEQVLG
SVLTSAEPQV ATRGGALFAP RLARADEQQT RKARAGFGPH GAVLVSGAGV LGAVVARHLV
IRHGVRRLVL ASRRGPDADG SADLVAELTQ LGAEVSVVAC DLSDRDQVSA LLAVHRPTGV
VHTAGVLDDG VTAALTPERL ARVFAPKVDA VRHLDELTRD LDLDAFVVFS SGSGVFGSPG
QGNYAAANAF LDAVMANRRA DGLPGLSLAW GLWEQTTGLT AHLGGADQAR MSRGGVRAMT
VVEGMDLFDA ALASEQALLV PVKLDLREVR AGGTVPHLLR GLVRPGRQQS RAAVDGDGGL
ARRLAELAPA DQESLLLDLV RGQVAVVLGY SGATAVRADG AFKDAGFDSL TSLELRNRLR
AATGLKLPAT MAFDYPTPYL LARHLRDEFD TDGDVVTQVT TRIEELEALV GDLALDKSTK
TALTLRLQGL VARCNGIGEQ ADTASVAEQL ESASADDVLD FIDAELGLT
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