Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Pnuc_1095 |
Symbol | |
ID | 5052091 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_009379 |
Strand | - |
Start bp | 1102872 |
End bp | 1134161 |
Gene Length | 31290 bp |
Protein Length | 10429 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 45% |
IMG OID | 640471265 |
Product | outer membrane autotransporter |
Protein accession | YP_001155875 |
Protein GI | 145589278 |
COG category | [S] Function unknown |
COG ID | [COG4625] Uncharacterized protein with a C-terminal OMP (outer membrane protein) domain |
TIGRFAM ID | [TIGR01414] outer membrane autotransporter barrel domain |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | n/a |
Fosmid unclonability p-value | n/a |
Fosmid Hitchhiker | n/a |
Fosmid clonability | n/a |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGAATCGCG TTTATCGCAT CGTCTGGAGC AAAAGATTGG GGGCGCTCGT TGTCGTCTCC GAAATTACGC ATGGACAAGG TAAATCGAGC AGTAAATCAA CCCAAGTAGG TTCAGTTTTA GTTGGATCTT TGTTGATGGC TGGAGGTATC GGGGCTGCCT TACCTCAAGT GGTTGACCCC TCTGCAGGAC CCATCACTGC TGACGGAGTA TTTAATAGTT CAAGCCATCT CATTTCAACG AGTTCCAGCC CTGCTGCACT TTATGTTCCA AGTTTGAATA TTGCAGGATC TGTTACCAAT ATGGGAACCA TTGCCGGTGA AGGCGGCTCA CCTGCAAACG GAATCAAGGT TAATTCAAAT GCCACCTTAA GTGGCAACAT TAACAATGCT GGCACCATCA TTAGTGGTGT TACCGCAATC GCGGTTGGAC CTAACGGCAA GATTACTGGC AGCATCAGCA ACACCGGATT GATTGTCGGC TCTTCTGCCT CTGGTATCGC CGTTCAACGT GGCACGGTTC TAGGCGGTAT TACAAACTCT GGTTTGATTG CCGGCACTTC TGGTGATGGA GGTATCTCCG TAAATAATTA CGGTTACATT GGCTCCATCA ATAACCAAAG CTTAAGTGGA TCACAGGTAG GTACCATTGC TGGTCGTCTA TACGGTATTG TTATCCAAAC TGGCGGAACA ATTGGCTCTA TTAATAATGC GGGATCAATA CTTGGTGGCA CTGCAATCAA GGTGGATGCT AGTAGCACGG CTGGTAGCAC CATTGCAGGC AGCATTATCA ATAGCGGTCT AATTGCAGGC TCTAATACCG GTATCTCTGT CATAAGCGGC TCAAGTCTTC TTGGCGGAAT TAATAATTCA GGAACCATAA TAGGCAATGG 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