Gene Mjls_3011 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMjls_3011 
Symbol 
ID4878724 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycobacterium sp. JLS 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_009077 
Strand
Start bp3144636 
End bp3147476 
Gene Length2841 bp 
Protein Length946 aa 
Translation table11 
GC content77% 
IMG OID640140309 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_001071281 
Protein GI126435590 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value0.259741 
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clones
Fosmid unclonability p-value0.00619992 
Fosmid HitchhikerNo 
Fosmid clonabilitydecreased coverage 
 

Sequence

Gene sequence
ATGTCGCGGA CCACGAACCG ATTGGGCTTC ACCGCCCTCG CTACCGCAGG GGCCTGCTGG 
ATCGTTCAGC TGTTCAACCC TGCGACTGCG ATCGCTGACC CCGGGGCAGT GAGCCCCGGC
GTTCCGTGCG TGAACATCAT GCAGCAGCTG CTCACCGTTC CGGGGCGGCT GCCCCAGACG
CTGCCGGGAG CGAACTCCGC TCTGACCAAC ACCGCGCCGC CGTCGGGTCC GATCCCGCCG
GCCGGGTCGA CCAACGGAAT CGCCTCTGCG ACACCGCCGT CGGTGGGAAT TCCACCGGCC
GGCTCGCTCA ACGGCACCGC CTCTGCGACC CCGCCGTCGG TGGCCATCCC CCCCGCCGGC
TCGCTCAACG GCACCGCCGC CGCGACCCCT CCTCGGCCGC CCGTTCCCAG TGCGCCCGTG
ACGTCGTCCT CGCAGAGCGT CACTCCGCCC TCCGGCCCGC TTCCGCCGAC CGCCCGTGTC
GACACGGCCA GCGGCGCGAC ACCGCCGGCA CCCGGCGCGC CGGGCGTGCC CGCGGCGGGC
GCCGGTGGCG GCGCGGTTCC TCCGGCCCCT GCTGCGCCGG GTGCGCCGGT GGGCGCTTCG
GGTGGAGTCG GCGCACCGGC CGCTCCGCCT GCCGTGCCTG CCGGTGTCGT CGACTCGTCG
AGCGGTGTGA CGCCGCCTGC GCCCGCAGCC CCGCCGGCCG GCGTCGTTCA GCCTGCGGCC
GGTGCGGTAC CGCCCGCGCC GCGCGCGGTG GGTGCCCCGG CTGGTGGTTC GGGCGGAGCG
GGAGCTCCTG CTGCGCCTCC GGCTCCGCCT GCGGCTGTGG TTGAGCCCGC CGCCGGTGCG
ACGCCGCCTG CTCCTCCGGC CCCGCCCGCG GCGGTGGTCG AGCCGGCCGC CGGTGCGACG
CCGCCTGCTC CGCCGGCCCC GCCTGCGGCA GTGGTTGAGC CGGCTTCGGG AGTGACTCCG
CCTGCGCCTC CGGCGCCGGG TGGTCCGGCG GGTGGTTCGG GTGGTGCGGT GACGCCTCCG
GGTCCGCCGG CTCCGCCTGC GGCGGTGGTT GAGCCGGCCG CCGGTGCGAC GCCTCCGGGT
CCGCCGGCCC CGCCTGCGGC GGTGGTTGAG CCGGCTTCGG GAGTGACTCC GCCTGCGCCT
CCGGCTCCGG GTGGTCCGTC CGTGAGTTCG GTGGAGAACG TGTCGCCTCC GGGTCCGCCG
GCTCCGCCTG CGGCCATCGT GGATTCCGCG AGTGGTGCGA CGCCGCCTGC GCCTCCGGCT
CCGGGTGGTC CGTCCGTGAG TTCGGTGGAG AACGTGTCGC CGCCGGCTCC GCCGGCTCCG
GGTGGTGGTT CGTCGAGCAC GGTGGAGCGG TTCTCGCCGC CGGCCCCGCC TGCACCAGCT
GTACCGGCTG CCAATTCCGT TGAGGCCGTT ACGCCTCCGG CTCCTCCGGC CCCGGGTGGT
CCGTCCGTTA GTTCGGTGGA GAACGTGTCG CCGCCGGCTC CGCCGGCTCC GGGTGGTGGT
TCGTCAAGCA CGGTGGAGCG GTTCTCGCCG CCGGCCCCGC CTGCACCAGC CGTACCGGCT
GCCAATTCTG TTGAGGCCGT GACGCCTCCG GCGCCTCCCG CGCCGCCTGC TGCGGTGGTG
GAACCTGCTG GCGCGGTGAC GCCTCCGGCG CCTCCTGCGC CGCCTGCTGC GGTGGTGGAG
CCTGCTGGTG CGGTGACGCC TCCGGCGCCT CCTGCGCCGC CTGCTGCGGT GGTGGAGCCT
GCTGGTGCGG TGACGCCTCC GGCGCCTCCT GCGCCGCCTG CTGCGGTGGT GGAGCCTGCT
GGTGCGGTGA CGCCTCCGGC TCCTCCTGCG CCGCCTGCTG CGGTGGTGGA GCCTGCTGGT
GCGGTGACGC CTCCGGCTCC TCCTGCGCCG CCTGCTGCGG TGGTGGAACC TGCTGGCGCA
GCGACCCCTC CGGCTCCGGC TGGTCCTCCG GCGGGTGTGG TTGAGCCTGC TGCGGGTGCT
GTGCCTCCGG CTCCGGCTGG TCCTCCGGCG GGTGTGGTTG AACCCGCTGC AGGTGCTGCA
CCTGCCGCTC CGGCTGGTCC CGGCGCACCG GGTGGTGGCT CCGGTGGAGC GGGCGCCCCG
CCTGCACCGC CCGCGCCACC GGCCGCCGCG GTCCAGCCCG CCGCCGCTGC AGTGCCTCCG
GCTCCGCCTG CGCCGCCTGC TGCGGTGGTG CAACCCGCCG CCGGGGTCGC TCCGCCTGCA
CCTCCGGCCC CGCCGGCTGC CGTGGTTCAG CCTGCTGCCG CTGTTGCGCC GCCTGCGCCG
CCTGCACCGC CAGCCGCGGT GGTGGAACCG GCTGCCGCCG TCGCCCCGCC GGCGCCTCCG
GCTCCGGGTG TCCCGGCAGC CAGTTCGGTG CCCGCCGTGA CGCCGCCCGC TCCGCCCGCG
CCTCCTGGCG GTGGTTCGGC CACGGTGAAC GTGGGCACGC CGCCGGCCCC TCCGGCACCG
CCGGCAGGTG GTTCGACTGC GGTGAACATC CCAACGCCTC CGTACCCCGC GGCGCCCGGT
GCGTCGGCCA GTGGTTCGGG CGTTACGCCT CCCGGGGTGT TCCCGCCGCT CGAGGGTGCA
GCAGCAGTGT TCGACCGGCT GCTGCCGGGG GCTCCGACGC CCGGTGCGCC GGGTGCCGCG
GCCAACGGTC CGTGGGACTT CATCCCGACG ATCCAGGTTC CGCAGATCCC GGGTCTGCCG
GTTCCGCTGC CCACGGAGAT CGGGCCGCCC AGTGACGGCA TCTGCGCCGG AACCGGTGGG
CTGTGGTCGG CAAGCGCCGC TCCCGGCGCC ACGCCGGCCA CGGCACCGGC CAGCCCGGTC
TCGGACCGTC GCGATTGGTG A
 
Protein sequence
MSRTTNRLGF TALATAGACW IVQLFNPATA IADPGAVSPG VPCVNIMQQL LTVPGRLPQT 
LPGANSALTN TAPPSGPIPP AGSTNGIASA TPPSVGIPPA GSLNGTASAT PPSVAIPPAG
SLNGTAAATP PRPPVPSAPV TSSSQSVTPP SGPLPPTARV DTASGATPPA PGAPGVPAAG
AGGGAVPPAP AAPGAPVGAS GGVGAPAAPP AVPAGVVDSS SGVTPPAPAA PPAGVVQPAA
GAVPPAPRAV GAPAGGSGGA GAPAAPPAPP AAVVEPAAGA TPPAPPAPPA AVVEPAAGAT
PPAPPAPPAA VVEPASGVTP PAPPAPGGPA GGSGGAVTPP GPPAPPAAVV EPAAGATPPG
PPAPPAAVVE PASGVTPPAP PAPGGPSVSS VENVSPPGPP APPAAIVDSA SGATPPAPPA
PGGPSVSSVE NVSPPAPPAP GGGSSSTVER FSPPAPPAPA VPAANSVEAV TPPAPPAPGG
PSVSSVENVS PPAPPAPGGG SSSTVERFSP PAPPAPAVPA ANSVEAVTPP APPAPPAAVV
EPAGAVTPPA PPAPPAAVVE PAGAVTPPAP PAPPAAVVEP AGAVTPPAPP APPAAVVEPA
GAVTPPAPPA PPAAVVEPAG AVTPPAPPAP PAAVVEPAGA ATPPAPAGPP AGVVEPAAGA
VPPAPAGPPA GVVEPAAGAA PAAPAGPGAP GGGSGGAGAP PAPPAPPAAA VQPAAAAVPP
APPAPPAAVV QPAAGVAPPA PPAPPAAVVQ PAAAVAPPAP PAPPAAVVEP AAAVAPPAPP
APGVPAASSV PAVTPPAPPA PPGGGSATVN VGTPPAPPAP PAGGSTAVNI PTPPYPAAPG
ASASGSGVTP PGVFPPLEGA AAVFDRLLPG APTPGAPGAA ANGPWDFIPT IQVPQIPGLP
VPLPTEIGPP SDGICAGTGG LWSASAAPGA TPATAPASPV SDRRDW