Gene MCAP_0509 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMCAP_0509 
Symbol 
ID3828702 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007633 
Strand
Start bp607118 
End bp609007 
Gene Length1890 bp 
Protein Length629 aa 
Translation table
GC content15% 
IMG OID637823665 
Productpeptidase C39 family protein 
Protein accessionYP_424482 
Protein GI83319878 
COG category[V] Defense mechanisms 
COG ID[COG2274] ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value0.00292307 
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitydecreased coverage 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
TTGGTTAATT TTTTAAAATC ACCTCTAATA CATATATGAG AGGTGATTTT TATTAAACTG 
ATTAAACAAA GAGAATATAA TGACTGTTCA ATAGCTTGTC TAGTTATGAT TATTAATTAT
TATTATAATC AAAATTATGA TTTAGATAGA TTAAAATTAG AAATTAATTA TTCAGAAGAA
ATATTAAGTT TTTATGATAT AACTCAAATT TGTCAAAAAT ATTTTTTAAC TACTAAAGCT
TTACAAATCC AAAATGATTT AGAACAAATA AATAAAAAGG TTTATTTAGC TCAAGTTGTT
AATCAAGTTG GATTATTACA TTTTGTAGTT GTTGAAAAGC AAAATAATCA TTTAATAATT
TATGATCCTT TAAAAGATAA AAAAGAAAAA ATTACTTATA AAGACTTTTA TCAAATTTTT
ACTGGATATG TTTTAATTTT TAATTCTAAT TATAAAAAGT TTAAAGCCAA TTATACTAGT
CTTTTTAAGT TATTTAATTT TTATTTAGGT TATTGTTTTT ATATTATTTT AAATGTTTTT
AGTATATCAT TAACAATTTT AGAAATGAGA TTTTTATATG TTTATTCTTT ATCTATAACA
AATCAAAATA ATTCTTATTT TTTATATTTA TATTTTTTAT GTATTTTTTT AATAAATATT
TTTTTAAATG AAATATCTAA ATTTTTATTA AATAAGTACT ATCAAAAAAC TAAAACTAAA
AAATTAGAAA TCTTTTATTA TTATTTAGTT GAAAATAATA TTAAATTAGA TGTTATAAAT
AGTTATTCTG AAATTGAGTT TATAAGTAGT TTTCAAACTT ATGTTTTATT AAACACAATA
AGTGGATTAA TTAATAGTTT AGTGATTCTT TTTGTAATTT TTTATATTAA TAAAATTATT
TTTCTAGTCT TATTTAGTTT TGATATTTTT TGATTATTAA TTAGTTTAGT TCATAACTTT
TTTATTAATA AAAATAAAAA AACTAGCAAA GCTAGTATAA ATTTATTAAC TCATTTTATT
GATAAGAATA AATTAATTGA TGAAAAACTT ACTTTAAAAA TAATTAATAA AGATATTTTT
AAAAATCAAG TTGACTATTT AAGTATTTTA TTTAATGTAT TAGAAAAAAT TAGTATGTTA
TTAATTTATT ATTTAAGTTG AGATTTATTA AAGTTTAATT ATATAGAATT TAGCATTTTA
TTAATTATTA TTTTATTTAA AGCAATTCAC ACAAGTGATT TAAAAAAGCT TGTTTACTTT
TTACAAAATT TTATTAAATA CAAACAACTA TTAATTAAAT TTAATAATTA CAAAATAACT
AATAATCATT TAAGATTAAA TGAAATTAAT AATATTCAAA TTAAAAATCT TTTAACTAAT
TGTCAAATTA ATTTAGATCA AAAAATCAAT TATTTATCTA GTGATTATGA TCTTAAAACT
TTTATTAAAA ATAAAAATAG TTCAGAAGAT ATTTTGATTT TAATAAACAA TGTAAATATT
AAAGATATTT CTAAGTTTAG TTTAAATAAA CATATTTGTC ATTTAGATAA TCTTGAAATT
AAATACACAA CAATTTTACA AAACATTATT ATTAATCAAT CTGAACTAAA TGTTTTTAAT
CATGAATTAA TTCAAACTAT TATAAAAAAA TATCAAATTA ATTTAGTTAA AGTCATTAAT
TTAGAAAATG TTAGTAAACT TGAACAAGAA TTTATTAAAC TATTAAGAAT CTTTTATTTA
GATTATAAAT ATTTATTATT TAATGATAAT TTTGAAATTA TAGATAAAAA AGATATTGGT
TTAGTTTTAG ATTTATTTAG AAGTTATTCA AATAGTTCAC TAATACTAAC AAGTAATGAT
ATCAAGTATA ATCTAATTAG TAAGGATTAA
 
Protein sequence
MVNFLKSPLI HIWEVIFIKL IKQREYNDCS IACLVMIINY YYNQNYDLDR LKLEINYSEE 
ILSFYDITQI CQKYFLTTKA LQIQNDLEQI NKKVYLAQVV NQVGLLHFVV VEKQNNHLII
YDPLKDKKEK ITYKDFYQIF TGYVLIFNSN YKKFKANYTS LFKLFNFYLG YCFYIILNVF
SISLTILEMR FLYVYSLSIT NQNNSYFLYL YFLCIFLINI FLNEISKFLL NKYYQKTKTK
KLEIFYYYLV ENNIKLDVIN SYSEIEFISS FQTYVLLNTI SGLINSLVIL FVIFYINKII
FLVLFSFDIF WLLISLVHNF FINKNKKTSK ASINLLTHFI DKNKLIDEKL TLKIINKDIF
KNQVDYLSIL FNVLEKISML LIYYLSWDLL KFNYIEFSIL LIIILFKAIH TSDLKKLVYF
LQNFIKYKQL LIKFNNYKIT NNHLRLNEIN NIQIKNLLTN CQINLDQKIN YLSSDYDLKT
FIKNKNSSED ILILINNVNI KDISKFSLNK HICHLDNLEI KYTTILQNII INQSELNVFN
HELIQTIIKK YQINLVKVIN LENVSKLEQE FIKLLRIFYL DYKYLLFNDN FEIIDKKDIG
LVLDLFRSYS NSSLILTSND IKYNLISKD