Gene MCAP_0038 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMCAP_0038 
Symbol 
ID3828692 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007633 
Strand
Start bp45211 
End bp47769 
Gene Length2559 bp 
Protein Length852 aa 
Translation table
GC content23% 
IMG OID637823206 
ProductABC transporter, permease protein 
Protein accessionYP_424035 
Protein GI83319467 
COG category[R] General function prediction only 
COG ID[COG4603] ABC-type uncharacterized transport system, permease component 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones14 
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGAAATCTA GAATATTGTG AACATTGAAT AAAAAAGCAA AATATTTATT TAGTTCAGAT 
CAAACAAAAA CTAAGTTAAA GTTTATAAAA GGTTCTTTGT TTTCGATTAT TATGGGGTTT
ATTGTTTCTG GTGTTTTTCT TTCATTTTTA AAAATAAATC CTTTTACATA TTTTGCTCTT
TTGTTTGGGA TTAACTTTGA TAAAAATTTT TATCAAATAA GTTTAAACTG AATGGCAGTA
TATATTGTTG CAGGATTATC AATGGCTGTT GCTTTTAAAT CGGGAGTATT TAATATTGGA
GCACCCGGTC AAATACTAAC AGCCACAAGT GTTTCAACTA TTTTATTTTT CTATATAAAA
GGTTCAAAAG CAGCAACAAT AGATGGTTCA ATGATTATTT TAATGTTAAT AACTTGTATT
GTTTCAGCTA GTTTTTTAGC ACTTATTGCA GGAGCATTAA AAGCCTTGTT TAACATACAC
GAAGTTGTTT CAACTATCTT ATTAAATTGA TCAGTATTTT ATATATTTAA ATGATTTTTT
AACAGATTTA AAGACTTTTC GGGTGGTTTA TCATTTACAT CAAAAAATAT TCCATCAGAT
CAATTAGTTA TTGGTTCAAA TACTGTAATT GTTCCTTTAT TAATAGCTTT AATTTGTGTA
ATTTTAGTTT GAATATTATT TTCAAAAACA ACTTTAGGTT TTAAGTTAAA AGCTGTTGGT
TCATCAATAA CTGGTTCTAA ATATATTGGA ATTAATGTTA AAACCCAAAT TATAAGTTCA
TCAGCTTTAT CAGGAGCAAT AGCAGGAATT GCAGGATTCA TTTTAATATT TACAGTTACA
CCAAACAACT TTTTTGCTTC TAATAGTTTA CCAACTGTTG GATTTGATGC AATTGCGGTT
TCATTAGTTG CTTTTAATAA CCCTATAGGA ATTATTCCAA TTGGTTGACT ATGAGCGGTG
ATCAAAACTG GAGGTGGTCC TGTTTCTTCG CTGTATGGTA TTTCAACACA AATAAGTGGA
TTAATTTCAG GAGTTCTTAT TTACTTTACA GCAATTGTTT CTATATTTAT TGTTTTTAAA
CCTTGAGAGT TGTTAAAAAA CAAATTTAAT CTACTAACAT CACCTATATG TAGAGAAATT
TTTTGAAAGT TATATTTATA TCTTTTAAAA TTAAGATTTA AAAAAATCTT TTTAATTTTT
ATAAAAGAGT ATAAACAACA AGTAAATGAT AGTTATAAAA ATTATGTTGT TAAAAATAAA
ATTAAAAAAC AAATGCAATT ACCTCACTTG TTTTGAAATG GTAGAAAAAA TATTAAACTA
GAATTTAAAA AAGATATTAA CCAGTTAATC TATTTAATTA AAAATAAAAT TGTTGATATT
AAAGCATTTG TTAAAGAAGA TAAAACAAGA CTTAGTGTTA ATGGATTAAA AACCAATTTA
AAAGAACAAT TAAATTTAAT AACAACTAAA TTTGTTTTAA AATCTTATGA TTTAGATTTA
AAGTTAGCTG ATCATAAATA TAAAATCACA CAAGTCAAAC AAAATATTTT AAATAAATAT
CAATCAGATA TAAAACAAAT TAAAAAAGAA CATAAGTTAA AAATTCAAGA AATTAAAGTT
TTTAAAGAAG CACAAATAGG AGTTTTATTT CACGAATTTC AATATCGTGA TAATATAATT
GAAATTAAAG CTAATAAACT AAAAACTATT GCATTGCTTA ATGAACAAAT TAAAAATATT
AAGTCTAAGT TTAATTTACA AAAAGAAAAT TTAAAATTGA ATAAAAATTT ATATGATAAT
AAACATTTAG AACAAATTAA TAAGATTAAA GAAGAAATTA AAGAAGTTAA AAAGCAAACT
AGTGTTAAGC TTTTAGAAGA AAAAAATAAA TTTAAAACTC AAAAAGAGAA TGTTAAAAAA
GAAAAGGTTC AATTACAAAC TATTTTAGAA CAATATAAAA CTTATCTTAA AGAAGAAAAA
CAACGCTTTA TACAAGCTAA AAAACAAGCT CTTGTTAATA AACATAAACG CTTAGAATTT
ATTGATATGA ATCGTTCTAA ATTAGAAGTT AATAAGACTA TTGTTTTATT AAATGATCTA
AAGACATTAG TTATGACTAA TATAGATAAA AACTTAAATA GACAAGCAAT AAAATCTAAT
GATAAGACTT TAATAAAGGC TTTAAAAATA AAGTCACAAA TAGATGAAAT ATTTGGTTCT
AATATTATTA GTGAATATGA TGCACCTGAA TATATTAAGC AAAAAGTAAA AATAAGTTTA
AAAACATTTA AATTAATAAT CATTTTAGAA AAGCAAATTT CTTATACTAA TTGTAGAGTT
GAAGAACAAG AACTAATTAA TAACTATAAA ACTTGAATCG ATAAAGCAAA TCAAATTATT
GATAAAGATA AACAACAATA TTTATTAGCA ATTAAGCAAC AACCAAGAGA AACACTAACT
GATTTAGAGC AATTATTTAA CTTAGAAAAA ACATTAAAGC AACAAACTAA TTTAAAGATC
ATGAATTTAG AAAAATCAGT ACTAAAGGAG GTTAAGTAA
 
Protein sequence
MKSRILWTLN KKAKYLFSSD QTKTKLKFIK GSLFSIIMGF IVSGVFLSFL KINPFTYFAL 
LFGINFDKNF YQISLNWMAV YIVAGLSMAV AFKSGVFNIG APGQILTATS VSTILFFYIK
GSKAATIDGS MIILMLITCI VSASFLALIA GALKALFNIH EVVSTILLNW SVFYIFKWFF
NRFKDFSGGL SFTSKNIPSD QLVIGSNTVI VPLLIALICV ILVWILFSKT TLGFKLKAVG
SSITGSKYIG INVKTQIISS SALSGAIAGI AGFILIFTVT PNNFFASNSL PTVGFDAIAV
SLVAFNNPIG IIPIGWLWAV IKTGGGPVSS LYGISTQISG LISGVLIYFT AIVSIFIVFK
PWELLKNKFN LLTSPICREI FWKLYLYLLK LRFKKIFLIF IKEYKQQVND SYKNYVVKNK
IKKQMQLPHL FWNGRKNIKL EFKKDINQLI YLIKNKIVDI KAFVKEDKTR LSVNGLKTNL
KEQLNLITTK FVLKSYDLDL KLADHKYKIT QVKQNILNKY QSDIKQIKKE HKLKIQEIKV
FKEAQIGVLF HEFQYRDNII EIKANKLKTI ALLNEQIKNI KSKFNLQKEN LKLNKNLYDN
KHLEQINKIK EEIKEVKKQT SVKLLEEKNK FKTQKENVKK EKVQLQTILE QYKTYLKEEK
QRFIQAKKQA LVNKHKRLEF IDMNRSKLEV NKTIVLLNDL KTLVMTNIDK NLNRQAIKSN
DKTLIKALKI KSQIDEIFGS NIISEYDAPE YIKQKVKISL KTFKLIIILE KQISYTNCRV
EEQELINNYK TWIDKANQII DKDKQQYLLA IKQQPRETLT DLEQLFNLEK TLKQQTNLKI
MNLEKSVLKE VK