Gene PMN2A_0734 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagPMN2A_0734 
Symbol 
ID3606112 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameProchlorococcus marinus str. NATL2A 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007335 
Strand
Start bp1226784 
End bp1232249 
Gene Length5466 bp 
Protein Length1821 aa 
Translation table11 
GC content46% 
IMG OID637687597 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_291928 
Protein GI72382573 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGACTGGTA CACCTGAAAA TATTTCACCA CCACCATCAG GAGATCCAGG ATATATGCCA 
CCACCATCAG GAGATCCAGG ATATGTGCCA CCACCATCAG GAGATCCAGG ATATGTGCCA
CCACCATCAG GAGATTCAGG ATATACGCCA CCACCATCAG GAGATGCAGG ATATACGCCA
CCATCAGGTA ATTCCGGACA ACCACATGGA GATCCCGGAT ATGTACCACC ATCTGAAATC
CCAGGATATG TACCACCACA TGGAGATCCC GGATATGTAC CACCATCTGA AATCCCAGGA
TATGTACCAC CAGATCTAAG TGAGCGAGAT CTAGCTGCCA GAAACGAGAG CCAGGCAGCA
GCGGCAGCAG CAGGTCTTAG TGAAGCTGAC TGGGCAATGA CTGAAGAGGG TATGGCGTTT
GCAGATAGGC AGGAGGCTAT GGATATAGCT TCAGGAGAAT ATGTTCCTGG AGAAGCAGAA
AATGATTTTG ATAGAAATCA TCGAAGAGAA GAGCCACCAG GACTATCTGC TGAAGCTTTA
GCTGATATAG CAGAGTTAGA AGCAGCAGCA GCAGCAGCAG GCCTCGCTTT AGAGGACTAC
TCGGATACTC CTGAAGGCAG GGCTAGAGCT GAGGAGATGG GTAGAAGGGC AGAAGAAAGG
GACATAGCCG CAGGACTAAT ACTCCCTTCA CCGGGCAATA ATCTAGGTCA GCAAGCCAGC
CAAAGTGAAA TTGATGGATG GCAAAGAGGT GAAGATGGAT CCTTAATGCC CCCAGCAAAT
TGGGCTGTTG ATGGTCAAGG TGGATATGTT TTCTCTCCTC CTGACCCTTC TCCTTCTGGT
CTATTGAGCC CAGATCAGCA AGCAGCTGCA GCAGGGCTTA GTGTTGCGGA CTGGGCAAAC
ACTGCAGAAG GACGAGCACA TTCTCAAGCA GTAGAAGAGG AAGCTTTAGC CCAAATGACA
TTGGCTGGAG AAGGACAAGG CATTTATGGA TTTGAACCTC CTGAAGGACC AAGTGCTCAA
GATTTAGCTG AAAGAGATGA GTTTGAGGCA GCAGCAGCAG CAGCAGGCCT AGCACCTGAA
GACTACTCAG ATACCCCAGA AGGTAGAGCT AGGGCGGAAG AGATGGGGAG AAGGGCAGAA
GCTAGGGCAA AAGCTGAACT TATAGGTGGA ATAAGACCAG ATTCCTTTAG TGAAGAAGAT
ATTTCCAATC TTGAGTTTTC TTTGGTTAGC GATTTTGATA GAGATCAATT TGCCTCGTTT
GCTCCAACGG CAGTCGCCGG TTTTGGAAAA GATCACTTTG CCGCTTTTGA CCCAACCGCA
GTCGCCGGTT TTGGTAGAGA TCACTTTGCC GCTTTTGACC CAACCGCAGT CGCCGGTTTT
GGTAAAGACC ATGTTGCTGC TTTTGATACT GCAGCCATGG CTGGTTTTGA TTACCAGCAC
ATGGGTGCTT TTGATACTGA AGCGATGGCT GGATTTAAAG CTGACCATGT CGCTGCCTTA
GATGCACAAG CTATAGCAGG TTTAGATCAA GATCAATTTG CTGCATTTGA TCCAACAGCG
ATGGCTGGGT TTAATGCGGA TCATTTTGCG GCGATTGATT ACGGCTACAT GGCAGGTCTA
GGTAAAGACC ATGTTGCTGC TTTTGATCCA ATGGCCATGG CTGGTTTTGA TTACCAGCAC
ATGGGTGCTT TTGATACTGA AGCGATGGCT GGATTTAAAG CTGACCATGT CGCTGCCTTA
GATGCACAAG CTATAGCAGG TTTAGATCAA GATCAATTTG CTGCATTTGA TCCAACAGCG
ATGGCTGGGT TTAATGCGGA TCATTTTGCG GCGATTGATT ACGGCTACAT GGCAGGTCTA
GGTAAAGACC ATGTTGCTGC TTTTGATCCA ATGGCCATGG CTGGTTTTGA TTACCAGCAC
ATGGGTGCTT TTGATACTGA AGCGATGGCT GGATTTAAAG CTGACCATGT CGCTGCCTTA
GATGCACAAG CTATAGCAGG TTTAGATCAA GATCAATTTG CTGCATTTGA TCCAACAGCG
ATGGCTGGGT TTAATGCGGA TCATTTTGCG GCGATTGATT ACGGCTACAT GGCAGGTCTA
GGTAAAGACC ATGTTGCTGC TTTTGATCCA ATGGCCATGG CTGGTTTTGA TTACCAGCAC
ATGGGTGCTT TTGATACTGA AGCGATGGCT GGATTTAAAG CTGACCATGT CGCTGCCTTA
GATGCACAAG CTATAGCAGG TTTAGATCAA GATCAATTTG CTGCATTTGA TCCAACAGCG
ATGGCTGGGT TTAATGCGGA TCATTTTGCG GCGATTGATT ACGGCTACAT GGCAGGTCTA
GGTAAAGACC ATGTTGCTGC TTTTGATCCA ATGGCCATGG CTGGTTTTGA TTACCAGCAC
ATGGGTGCTT TTGATACTGA AGCGATGGCT GGATTTAAAG CTGACCATGT CGCTGCCTTA
GATGCACAAG CTATAGCAGG TTTAGATCAA GATCAATTTG CTGCATTTGA TCCAACAGCG
ATGGCTGGGT TTAATGCGGA TCATTTTGCG GCGATTGATT ACGGCTACAT GGCAGGTCTA
GGTAAAGACC ATGTTGCTGC TTTTGATCCA ATGGCCATGG CTGGTTTTGA TCCCGAGCAT
GTTGCTGCGT TTGACCCGAT GGCAGTTGCA GGGTTCGATC ATACGCATTT TGCAGCCTTT
GACCCGATGG CAGTTGCAGG GTTTGATCAC ACGCATTTTG CAGCCTTTGA TCCAATGGCA
ATGGCTGGAT TTGATCCCGA GCATGTTGCT GCGTTTGACC CAATGGCAGT CGCTGGATTT
GATCCCGATC ATGTTGCCGC GTTTGACCCA ATGGCAGTTG CTGGATTTGA TCACACGCAT
TTTGCAGCCT TTGATCCAAT GGCAGTTGCT GGATTTGATC ACACGCATGC TGCGGCGTTT
GACCCAATGG CAGTTGCTGG ATTTGATCAC ACGCATTTTG CAGCCTTTGA TCCAATGGCA
GTTGCTGGAT TTGATCACAC GCATGCTGCG GCGTTTGACC CAATGGCAGT TGCTGGATTT
GATCACACGC ATTTTGCAGC CTTTGACCCA ATGGCAGTCG CTGGATTTGA TCCCGAGCAT
GTTGCTGCGT TTGACCCAAT GGCAGTTGCT GGATTTGATC ACACGCATTT TGCAGCCTTT
GATCCAATGG CAGTTGCTGG ATTTGATCAC ACGCATGCTG CGGCGTTTGA CCCAATGGCA
GTTGCTGGAT TTGATCACAC GCATGCTGCG GCGTTTGATC CAATGGCAGT TGCTGGATTT
GATCACACGC ATGCTGCGGC GTTTGATCCA ATGGCGATGG CCGGTTTTGA TAAAGATCAT
TTTGCAGCGT TTGCCCCAAC TGCAGTAGCA GGCTTTGGAA AAGATCAGAT TGCAGCGTTT
GATCCCTTGG CGATGGAGGG ATTTGATCCA ACGCACATTG CAGCGTTTGA CGCAGAAGCA
ATGGCTGGAT TTAAAGGTCA GACCTTAAAA GAACTTGATC CAGAATCATT TGCTGCGGTT
ACTCCGGATC AATTAGCAAA AATGGCACCT GATGCTGCGG CAGCAGTTAA AAATTGGGTG
CTTCCAAAAG ACGAGATCAT TCGCTGGGAA GGCGGTCTAC GGGGACCTGA TGGTGAATGG
ATGACAGCAG ATTCTTTCTT TGGCAAACGA ACAACTGGAG ATAAACCAGC AGAAACGACT
GTTTGGACTC CACCAGAAGC AGATGCAATT GCTAAATCAG GAGGCTTTAC AAAATCTGAT
GGAACGTTTG TTAAAGAAGA CGATTATTTC AAAGATCCAT CATCAGCTGG ATGGACTGTC
CCTCCAGATG AATTGATTAA AAAAGATGGT GGTTTTAGAA ACCCCAATGG TAAGTGGGTC
ACATCCAAGG AGTTTTTGAA TAACACGGGA ACTGTTCCTG AAACCGATGA AATTAAAAAG
AACGGTGGAT ATTTTGATGC CGATAAAAAA TGGGTTTCTT CCGTAGCTCA TTTTGGAGAA
GGAAGCGCGG ATGCTCAAAC TGTTGCCTGG GCACCACCTG CAGCGACGGA TATTAAAACT
GATGGAGGTT TTTGGGATCC ATTTGGCCAA TGGGTGAAAT CAGAAGATTT TGAGAAAGAT
GGATGGAAAG CACCAGAAGG AGAAGTAAAG CCTGCAATTC CAGAAGGGAT TACAGCGGAA
GAAATCAAAT CAGCAGGAGG GTATCAGGCT ACTAATGGTG CTTGGGTGAC AGATGCCAAG
CATTTTGATA CGTCACTAGA TAATGAGGCG AATAAAACAG CGGGTTACTG GGGAGCGACT
ACGGATCCCA TTAAAGAGGC AGCAAACTTA GCAAATTCCC TTCTTACTTC AAATGAAGTG
AGTCTGATAC CTGAAGAAGC AGCATTAGCT GCAGGACTAA GTGTTGCTGA TTGGGCATTG
ACTGATGAAG GTAGAGCTCA TGCCGAAGCA GTAGAAGCAG ATGCACTTGC TGTGATTTCA
TTAGCGAATC TAGATCCAAC GGCAGTTGCT TTAGATAAAA AACCCATTAG TGAAGTCGCT
TATCCATGGC AAGAAATTGA TGATTTAAAG AAACCCCAAG GAGATGGAGC TGAATTGGAT
TCGACAAGCC ATTGGGCGTC GCTAGTAAAG AGTAAAGATG ACGGTGATGA CAGATTGGAA
GGAGGCGAGA CTTCTGACAA GATTTTTGGT GGCTTGGGGT CAGACTTTAT TGATGGAGGA
GAAGGAGAAG ATGTTGCGTT CTATGCCGGA AATTTTGCTG ATTATAAGTT TGATCGAACA
AAAGATACAG TTGCGATTCA AGATCAAAGA GAGGGACTGA ATGATGGAAA TGACACTTTA
AAGAATGTCG AATATATTCA ATTCGCCGAT CAGAAGGTAG ACGTTTCTAA ACTAGATGTT
GTTAAAACAT ATACGGGTGA TAGTAAAGAC TTTAAATTCT TTAAAAGAGA AGATGGAACA
ATAGAAGTTA AGACTGAGGA TGGATTCGAT GATATTACTG GCGTTCCAAA ACTGGAGTTT
AATGATAAAT CTTTTAGTGG AATTAGCGAT ATTAAAGAGA CGTTTGATCA GGTGAAATCG
AAAGATGATT CAACGGGACA AATGTTTAGG GTTTACAACG CTGCTTTTGC AAGATTCCCT
GATTCTGATG GACTTGAATA TTGGATTGAT AAAAACTCGT CTGGTGAAAA TAGTAACCGT
CAAGTAGCTG ATTCTTTCTT AGGTTCTGAA GAGTTTAAAT CTACTTATGG AGCTGATGTT
GACACAGGAA CGTATGTGAA CAATCTATAT AAAAATATTC TTGGTAGAGA TGCAGATCAA
GGTGGTTATG ATTATTGGGT TGAGCAGTTA GACAGTGGGC AAGAAAATAG AGGAGAATTG
TTATTAGGTT TTGCTGAGTC GTTAGAGAAT AAGGCTTTAT TTAGTGAGGT AACTGGTTTG
TTCTAA
 
Protein sequence
MTGTPENISP PPSGDPGYMP PPSGDPGYVP PPSGDPGYVP PPSGDSGYTP PPSGDAGYTP 
PSGNSGQPHG DPGYVPPSEI PGYVPPHGDP GYVPPSEIPG YVPPDLSERD LAARNESQAA
AAAAGLSEAD WAMTEEGMAF ADRQEAMDIA SGEYVPGEAE NDFDRNHRRE EPPGLSAEAL
ADIAELEAAA AAAGLALEDY SDTPEGRARA EEMGRRAEER DIAAGLILPS PGNNLGQQAS
QSEIDGWQRG EDGSLMPPAN WAVDGQGGYV FSPPDPSPSG LLSPDQQAAA AGLSVADWAN
TAEGRAHSQA VEEEALAQMT LAGEGQGIYG FEPPEGPSAQ DLAERDEFEA AAAAAGLAPE
DYSDTPEGRA RAEEMGRRAE ARAKAELIGG IRPDSFSEED ISNLEFSLVS DFDRDQFASF
APTAVAGFGK DHFAAFDPTA VAGFGRDHFA AFDPTAVAGF GKDHVAAFDT AAMAGFDYQH
MGAFDTEAMA GFKADHVAAL DAQAIAGLDQ DQFAAFDPTA MAGFNADHFA AIDYGYMAGL
GKDHVAAFDP MAMAGFDYQH MGAFDTEAMA GFKADHVAAL DAQAIAGLDQ DQFAAFDPTA
MAGFNADHFA AIDYGYMAGL GKDHVAAFDP MAMAGFDYQH MGAFDTEAMA GFKADHVAAL
DAQAIAGLDQ DQFAAFDPTA MAGFNADHFA AIDYGYMAGL GKDHVAAFDP MAMAGFDYQH
MGAFDTEAMA GFKADHVAAL DAQAIAGLDQ DQFAAFDPTA MAGFNADHFA AIDYGYMAGL
GKDHVAAFDP MAMAGFDYQH MGAFDTEAMA GFKADHVAAL DAQAIAGLDQ DQFAAFDPTA
MAGFNADHFA AIDYGYMAGL GKDHVAAFDP MAMAGFDPEH VAAFDPMAVA GFDHTHFAAF
DPMAVAGFDH THFAAFDPMA MAGFDPEHVA AFDPMAVAGF DPDHVAAFDP MAVAGFDHTH
FAAFDPMAVA GFDHTHAAAF DPMAVAGFDH THFAAFDPMA VAGFDHTHAA AFDPMAVAGF
DHTHFAAFDP MAVAGFDPEH VAAFDPMAVA GFDHTHFAAF DPMAVAGFDH THAAAFDPMA
VAGFDHTHAA AFDPMAVAGF DHTHAAAFDP MAMAGFDKDH FAAFAPTAVA GFGKDQIAAF
DPLAMEGFDP THIAAFDAEA MAGFKGQTLK ELDPESFAAV TPDQLAKMAP DAAAAVKNWV
LPKDEIIRWE GGLRGPDGEW MTADSFFGKR TTGDKPAETT VWTPPEADAI AKSGGFTKSD
GTFVKEDDYF KDPSSAGWTV PPDELIKKDG GFRNPNGKWV TSKEFLNNTG TVPETDEIKK
NGGYFDADKK WVSSVAHFGE GSADAQTVAW APPAATDIKT DGGFWDPFGQ WVKSEDFEKD
GWKAPEGEVK PAIPEGITAE EIKSAGGYQA TNGAWVTDAK HFDTSLDNEA NKTAGYWGAT
TDPIKEAANL ANSLLTSNEV SLIPEEAALA AGLSVADWAL TDEGRAHAEA VEADALAVIS
LANLDPTAVA LDKKPISEVA YPWQEIDDLK KPQGDGAELD STSHWASLVK SKDDGDDRLE
GGETSDKIFG GLGSDFIDGG EGEDVAFYAG NFADYKFDRT KDTVAIQDQR EGLNDGNDTL
KNVEYIQFAD QKVDVSKLDV VKTYTGDSKD FKFFKREDGT IEVKTEDGFD DITGVPKLEF
NDKSFSGISD IKETFDQVKS KDDSTGQMFR VYNAAFARFP DSDGLEYWID KNSSGENSNR
QVADSFLGSE EFKSTYGADV DTGTYVNNLY KNILGRDADQ GGYDYWVEQL DSGQENRGEL
LLGFAESLEN KALFSEVTGL F