28 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PMT9312_0040  CDS  NC_007577  39139  39747  609  hypothetical protein  YP_396537  decreased coverage  0.00582045  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_0737  CDS  NC_007577  688660  689979  1320  hypothetical protein  YP_397233  decreased coverage  0.00875447  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_0738  CDS  NC_007577  690112  690480  369  CopG family protein  YP_397234  decreased coverage  0.00629319  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_0767  CDS  NC_007577  713121  715283  2163  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  YP_397263  decreased coverage  0.00745719  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_0839  CDS  NC_007577  776625  777422  798  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  YP_397335  decreased coverage  0.00773079  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_0916  CDS  NC_007577  849191  849664  474  phosphopantetheine adenylyltransferase  YP_397412  decreased coverage  0.00182252  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_0917  CDS  NC_007577  849724  850212  489  hypothetical protein  YP_397413  decreased coverage  0.00504908  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_0924  CDS  NC_007577  861792  862010  219  hypothetical protein  YP_397420  decreased coverage  0.0038619  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_0997  CDS  NC_007577  926135  926932  798  amphipathic helix repeat-containing protein  YP_397493  decreased coverage  0.00375349  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1084  CDS  NC_007577  994703  996004  1302  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  YP_397579  decreased coverage  0.00820533  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1115  CDS  NC_007577  1031622  1032095  474  hypothetical protein  YP_397610  decreased coverage  5.4458e-06  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1131  CDS  NC_007577  1045860  1046975  1116  porin precursor-like  YP_397626  decreased coverage  0.00125322  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1179  CDS  NC_007577  1093815  1094933  1119  adhesin-like protein  YP_397674  decreased coverage  0.00551453  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1197  CDS  NC_007577  1117860  1118444  585  hypothetical protein  YP_397692  decreased coverage  0.00250603  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1212  CDS  NC_007577  1132493  1133026  534  hypothetical protein  YP_397707  decreased coverage  0.00298845  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1214  CDS  NC_007577  1133271  1133534  264  fumarate reductase subunit D-like  YP_397709  decreased coverage  0.00307678  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1325  CDS  NC_007577  1238771  1240066  1296  hypothetical protein  YP_397820  decreased coverage  0.00779571  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1332  CDS  NC_007577  1245822  1247552  1731  ATPase  YP_397828  decreased coverage  0.00148661  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1341  CDS  NC_007577  1256857  1257900  1044  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase-like  YP_397837  decreased coverage  0.00519164  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1345  CDS  NC_007577  1261049  1262092  1044  hypothetical protein  YP_397841  decreased coverage  0.00146702  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1372  CDS  NC_007577  1286988  1287644  657  putative circadian phase modifier CpmA  YP_397868  decreased coverage  0.00469178  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1373  CDS  NC_007577  1287641  1288087  447  hypothetical protein  YP_397869  decreased coverage  0.00663063  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1465  CDS  NC_007577  1374612  1375097  486  hypothetical protein  YP_397961  decreased coverage  0.00433461  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1470  CDS  NC_007577  1381193  1381555  363  hypothetical protein  YP_397966  decreased coverage  0.00332173  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1471  CDS  NC_007577  1381683  1382036  354  type I restriction modification DNA-like  YP_397967  decreased coverage  0.00678808  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1487  CDS  NC_007577  1394770  1394967  198  regulatory proteins, DeoR-like  YP_397983  decreased coverage  0.00901363  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1673  CDS  NC_007577  1562795  1563865  1071  MRP protein-like  YP_398170  decreased coverage  0.0087484  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
PMT9312_1750  CDS  NC_007577  1641066  1642805  1740  DNA polymerase III, tau subunit  YP_398247  decreased coverage  0.00401811  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>