58 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Aazo_0306  CDS  NC_014248  305321  306526  1206  HtrA2 peptidase  YP_003720013  decreased coverage  0.00230132  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0519    NC_014248  536750  538156  1407      decreased coverage  6.00877e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0520    NC_014248  538484  541359  2876      decreased coverage  0.000604478  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0521    NC_014248  538949  540364  1416      decreased coverage  5.73609e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0779  CDS  NC_014248  826745  828031  1287  phosphoribosylamine/glycine ligase  YP_003720334  decreased coverage  0.00193673  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0830  CDS  NC_014248  879395  880477  1083  photosystem q(b) protein  YP_003720376  decreased coverage  0.00028698  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0868  CDS  NC_014248  926963  927598  636  rod shape-determining protein MreD  YP_003720406  decreased coverage  0.000649677  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0889  CDS  NC_014248  944286  944879  594  nuclease  YP_003720419  decreased coverage  0.000805707  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0890  CDS  NC_014248  944889  945257  369  (2Fe-2S) ferredoxin  YP_003720420  decreased coverage  0.00054006  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0891  CDS  NC_014248  945978  946202  225  hypothetical protein  YP_003720421  decreased coverage  0.000394024  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0892  CDS  NC_014248  946504  947538  1035  hypothetical protein  YP_003720422  decreased coverage  0.00107222  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0922  CDS  NC_014248  980871  981749  879  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_003720447  decreased coverage  4.02813e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1060  CDS  NC_014248  1132942  1134327  1386  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  YP_003720540  decreased coverage  3.66993e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1518    NC_014248  1590397  1591259  863      decreased coverage  2.82763e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1747  CDS  NC_014248  1811399  1811632  234  hypothetical protein  YP_003721004  decreased coverage  0.00929805  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1748    NC_014248  1811621  1811761  141      decreased coverage  0.00813162  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2085  CDS  NC_014248  2170983  2171372  390  hypothetical protein  YP_003721253  decreased coverage  0.00513635  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2117    NC_014248  2201327  2201763  437      decreased coverage  0.00222872  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2118  CDS  NC_014248  2201822  2202205  384  transposase  YP_003721268  decreased coverage  0.00219544  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2119    NC_014248  2202175  2202630  456      decreased coverage  0.00250691  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2120  CDS  NC_014248  2203136  2203582  447  hypothetical protein  YP_003721269  decreased coverage  0.00258166  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2122  CDS  NC_014248  2205053  2205493  441  transposase IS4 family protein  YP_003721270  decreased coverage  0.00205429  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2123  CDS  NC_014248  2205463  2205846  384  transposase  YP_003721271  decreased coverage  0.00183636  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2125  CDS  NC_014248  2206257  2206406  150  hypothetical protein  YP_003721273  decreased coverage  0.00143591  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2126  CDS  NC_014248  2206910  2207140  231  hypothetical protein  YP_003721274  decreased coverage  0.00135221  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2133  CDS  NC_014248  2212987  2215698  2712  hypothetical protein  YP_003721277  decreased coverage  0.0029443  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2339  CDS  NC_014248  2430073  2430675  603  GCN5-like N-acetyltransferase  YP_003721421  decreased coverage  0.00797251  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2450    NC_014248  2549320  2552868  3549      decreased coverage  0.00689064  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2473  CDS  NC_014248  2573725  2574894  1170  8-amino-7-oxononanoate synthase  YP_003721507  decreased coverage  0.00670549  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2474  CDS  NC_014248  2574978  2575862  885  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_003721508  decreased coverage  0.00522516  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2475    NC_014248  2576000  2578061  2062      decreased coverage  0.00175888  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2737  CDS  NC_014248  2823554  2825182  1629  carbohydrate-selective porin OprB  YP_003721728  decreased coverage  0.000147214  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2738    NC_014248  2825333  2825935  603      decreased coverage  2.93524e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2817  CDS  NC_014248  2901901  2903073  1173  RpoD subfamily RNA polymerase sigma 70 subunit  YP_003721786  decreased coverage  0.00156659  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2897  CDS  NC_014248  2984397  2984855  459  50S ribosomal protein L9  YP_003721847  decreased coverage  0.000174347  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2898  CDS  NC_014248  2985027  2985800  774  hydroxyacylglutathione hydrolase  YP_003721848  decreased coverage  0.00113363  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2899  CDS  NC_014248  2986089  2987261  1173  group 1 glycosyl transferase  YP_003721849  decreased coverage  0.00186189  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3184    NC_014248  3281046  3281303  258      decreased coverage  0.00459993  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3185    NC_014248  3281310  3281918  609      decreased coverage  0.00730837  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3186  CDS  NC_014248  3282486  3282644  159  acetolactate synthase  YP_003722027  decreased coverage  0.00463399  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3187  CDS  NC_014248  3282748  3282906  159  hypothetical protein  YP_003722028  decreased coverage  0.00459993  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3188  CDS  NC_014248  3282996  3283352  357  translation initiation factor SUI1  YP_003722029  decreased coverage  0.00588203  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3379  CDS  NC_014248  3443890  3444144  255  photosystem I reaction center subunit PsaK  YP_003722157  decreased coverage  1.07099e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3380  CDS  NC_014248  3444450  3444725  276  photosystem I reaction center subunit PsaK  YP_003722158  decreased coverage  1.08124e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3381  CDS  NC_014248  3444918  3446108  1191  peptidase M50  YP_003722159  decreased coverage  3.9902e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4164    NC_014248  4235964  4237230  1267      decreased coverage  0.00670549  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4165    NC_014248  4237264  4237752  489      decreased coverage  0.002818  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4294  CDS  NC_014248  4366025  4368748  2724  polynucleotide adenylyltransferase region  YP_003722778  decreased coverage  0.00498072  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4295  CDS  NC_014248  4369026  4369172  147  photosystem II core protein PsbZ  YP_003722779  decreased coverage  0.0078659  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4296  CDS  NC_014248  4369073  4369285  213  hypothetical protein  YP_003722780  decreased coverage  0.00870047  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4474    NC_014248  4567275  4568961  1687      decreased coverage  6.41299e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4506    NC_014248  4598123  4599827  1705      decreased coverage  0.000131786  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4692    NC_014248  4794962  4795754  793      decreased coverage  0.000922531  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_5025    NC_014248  5143116  5144808  1693      decreased coverage  0.00410262  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_5122  CDS  NC_014248  5252789  5253124  336  hypothetical protein  YP_003723318  decreased coverage  9.2192e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_5123    NC_014248  5253240  5254939  1700      decreased coverage  8.94724e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0011  tRNA  NC_014248  945365  945451  87  tRNA-Ser    decreased coverage  0.000337805  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0012  tRNA  NC_014248  945682  945754  73  tRNA-Ala    decreased coverage  0.000301607  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>