86 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
B21_00094  CDS  NC_012892  106787  108049  1263  hypothetical protein  YP_002997961  decreased coverage  2.13686e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00095  CDS  NC_012892  108110  109261  1152  hypothetical protein  YP_002997962  decreased coverage  1.62497e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00110  CDS  NC_012892  122983  124356  1374  hypothetical protein  YP_002997977  decreased coverage  0.00481643  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00117  CDS  NC_012892  137193  137555  363  hypothetical protein  YP_002997983  decreased coverage  3.69224e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00141  CDS  NC_012892  160582  161979  1398  hypothetical protein  YP_002998007  decreased coverage  1.70376e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00142  CDS  NC_012892  162039  162965  927  hypothetical protein  YP_002998008  decreased coverage  7.3692e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00150  CDS  NC_012892  173413  174303  891  hypothetical protein  YP_002998016  decreased coverage  8.17605e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00151  CDS  NC_012892  174300  176282  1983  hypothetical protein  YP_002998017  decreased coverage  4.92106e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00166  CDS  NC_012892  192712  193437  726  hypothetical protein  YP_002998032  decreased coverage  0.00754113  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00196  CDS  NC_012892  223804  224457  654  hypothetical protein  YP_002998061  decreased coverage  0.000400781  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00197  CDS  NC_012892  224450  225481  1032  hypothetical protein  YP_002998062  decreased coverage  0.000135351  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00198  CDS  NC_012892  225669  226241  573  hypothetical protein  YP_002998063  decreased coverage  0.000245492  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00426  CDS  NC_012892  461040  462971  1932  hypothetical protein  YP_002998283  decreased coverage  0.00196297  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00427  CDS  NC_012892  463024  463353  330  hypothetical protein  YP_002998284  decreased coverage  0.000717849  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00480  CDS  NC_012892  522829  523323  495  hypothetical protein  YP_002998335  decreased coverage  5.6268e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00704  CDS  NC_012892  749830  752481  2652  hypothetical protein  YP_002998547  decreased coverage  0.000228625  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00725  CDS  NC_012892  763267  763890  624  hypothetical protein  YP_002998566  decreased coverage  0.00315899  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00932  CDS  NC_012892  978038  978823  786  hypothetical protein  YP_002998767  decreased coverage  0.00185326  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00933  CDS  NC_012892  978820  980142  1323  hypothetical protein  YP_002998768  decreased coverage  0.00336906  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_00941  CDS  NC_012892  992084  993484  1401  hypothetical protein  YP_002998776  decreased coverage  2.72828e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01269  CDS  NC_012892  1327697  1328434  738  hypothetical protein  YP_002999092  decreased coverage  1.23646e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01270  CDS  NC_012892  1328434  1328760  327  hypothetical protein  YP_002999093  decreased coverage  5.44894e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01310  CDS  NC_012892  1371284  1372345  1062  hypothetical protein  YP_002999131  decreased coverage  1.579e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01421  CDS  NC_012892  1477955  1479454  1500  hypothetical protein  YP_002999237  decreased coverage  0.00419609  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01449  CDS  NC_012892  1508849  1510546  1698  hypothetical protein  YP_002999262  decreased coverage  0.0044137  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01534  CDS  NC_012892  1594691  1594966  276  hypothetical protein  YP_002999338  decreased coverage  0.00010823  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01535  CDS  NC_012892  1594830  1595018  189  hypothetical protein  YP_002999339  decreased coverage  8.93711e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01536  CDS  NC_012892  1595015  1595206  192  hypothetical protein  YP_002999340  decreased coverage  9.87506e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01586  CDS  NC_012892  1649854  1650294  441  hypothetical protein  YP_002999388  decreased coverage  0.00103868  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01587  CDS  NC_012892  1650371  1650952  582  hypothetical protein  YP_002999389  decreased coverage  0.00127642  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01588  CDS  NC_012892  1650952  1651530  579  hypothetical protein  YP_002999390  decreased coverage  0.00124747  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01608  CDS  NC_012892  1670191  1670430  240  hypothetical protein  YP_002999409  decreased coverage  3.23192e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01609  CDS  NC_012892  1670617  1671132  516  hypothetical protein  YP_002999410  decreased coverage  4.76829e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01670  CDS  NC_012892  1738983  1739282  300  hypothetical protein  YP_002999466  decreased coverage  0.00452626  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01719  CDS  NC_012892  1787522  1788562  1041  hypothetical protein  YP_002999514  decreased coverage  0.000724895  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01720  CDS  NC_012892  1788690  1790651  1962  hypothetical protein  YP_002999515  decreased coverage  0.00317357  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01780  CDS  NC_012892  1851295  1852104  810  hypothetical protein  YP_002999573  decreased coverage  0.000118677  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01812  CDS  NC_012892  1881691  1882560  870  hypothetical protein  YP_002999605  decreased coverage  0.000387969  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01813  CDS  NC_012892  1882688  1884130  1443  hypothetical protein  YP_002999606  decreased coverage  0.000183599  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01814  CDS  NC_012892  1884261  1885232  972  hypothetical protein  YP_002999607  decreased coverage  0.000463941  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01815  CDS  NC_012892  1885352  1886674  1323  hypothetical protein  YP_002999608  decreased coverage  0.000786117  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01886  CDS  NC_012892  1964425  1965375  951  hypothetical protein  YP_002999675  decreased coverage  0.000554591  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01887  CDS  NC_012892  1965477  1966394  918  hypothetical protein  YP_002999676  decreased coverage  0.0017445  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01941  CDS  NC_012892  2016913  2018391  1479  hypothetical protein  YP_002999729  decreased coverage  0.0074842  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_01942  CDS  NC_012892  2018393  2019787  1395  hypothetical protein  YP_002999730  decreased coverage  0.0026544  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_02046  CDS  NC_012892  2143928  2144977  1050  hypothetical protein  YP_002999829  decreased coverage  0.00703548  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_02057  CDS  NC_012892  2156526  2157656  1131  hypothetical protein  YP_002999840  decreased coverage  0.00882544  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_02183  CDS  NC_012892  2303644  2305164  1521  hypothetical protein  YP_002999962  decreased coverage  2.57833e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_02466  CDS  NC_012892  2615725  2616318  594  hypothetical protein  YP_003000239  decreased coverage  5.87917e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_02467  CDS  NC_012892  2616441  2617319  879  hypothetical protein  YP_003000240  decreased coverage  0.000137745  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_02876  CDS  NC_012892  3067194  3068432  1239  hypothetical protein  YP_003000637  decreased coverage  0.000142694  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_02884  CDS  NC_012892  3074816  3075829  1014  hypothetical protein  YP_003000645  decreased coverage  1.64099e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_02885  CDS  NC_012892  3076067  3076282  216  hypothetical protein  YP_003000646  decreased coverage  3.39059e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03014  CDS  NC_012892  3209980  3210546  567  hypothetical protein  YP_003000772  decreased coverage  0.000471574  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03015  CDS  NC_012892  3210543  3211118  576  hypothetical protein  YP_003000773  decreased coverage  0.000479332  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03016  CDS  NC_012892  3211087  3211644  558  hypothetical protein  YP_003000774  decreased coverage  0.000479332  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03018  CDS  NC_012892  3212424  3213857  1434  hypothetical protein  YP_003000776  decreased coverage  0.0014618  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03041  CDS  NC_012892  3238185  3238577  393  hypothetical protein  YP_003000799  decreased coverage  2.87646e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03042  CDS  NC_012892  3238593  3239021  429  hypothetical protein  YP_003000800  decreased coverage  3.11613e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03061  CDS  NC_012892  3260410  3261453  1044  hypothetical protein  YP_003000817  decreased coverage  1.54905e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03108  CDS  NC_012892  3306533  3306925  393  hypothetical protein  YP_003000864  decreased coverage  1.88552e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03109  CDS  NC_012892  3306959  3307264  306  hypothetical protein  YP_003000865  decreased coverage  1.39286e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03110  CDS  NC_012892  3307279  3307818  540  hypothetical protein  YP_003000866  decreased coverage  2.80639e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03194  CDS  NC_012892  3378133  3378654  522  hypothetical protein  YP_003000947  decreased coverage  0.000404125  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03247  CDS  NC_012892  3445401  3445787  387  hypothetical protein  YP_003000997  decreased coverage  0.000940234  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03320  CDS  NC_012892  3529992  3531641  1650  hypothetical protein  YP_003001069  decreased coverage  0.000901964  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03321  CDS  NC_012892  3531692  3532294  603  hypothetical protein  YP_003001070  decreased coverage  0.00023179  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03428  CDS  NC_012892  3660984  3662030  1047  hypothetical protein  YP_003001174  decreased coverage  1.23646e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03448  CDS  NC_012892  3677597  3678817  1221  hypothetical protein  YP_003001194  decreased coverage  2.17755e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03529  CDS  NC_012892  3769200  3770603  1404  hypothetical protein  YP_003001272  decreased coverage  0.00951486  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03586  CDS  NC_012892  3828959  3829651  693  hypothetical protein  YP_003001326  decreased coverage  4.43765e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03598  CDS  NC_012892  3841797  3843647  1851  hypothetical protein  YP_003001335  decreased coverage  4.82952e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03623  CDS  NC_012892  3869204  3870589  1386  hypothetical protein  YP_003001360  decreased coverage  3.82279e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03690  CDS  NC_012892  3939499  3940044  546  hypothetical protein  YP_003001424  decreased coverage  0.000962205  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03698  CDS  NC_012892  3951781  3954567  2787  hypothetical protein  YP_003001432  decreased coverage  0.000500829  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03799  CDS  NC_012892  4068551  4069651  1101  hypothetical protein  YP_003001532  decreased coverage  0.000143968  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03800  misc_feature  NC_012892  4070020  4071864  1845      decreased coverage  8.21459e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03809  CDS  NC_012892  4082083  4083267  1185  hypothetical protein  YP_003001541  decreased coverage  2.41403e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03810  CDS  NC_012892  4083497  4083880  384  hypothetical protein  YP_003001542  decreased coverage  5.44894e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03811  CDS  NC_012892  4083882  4084427  546  hypothetical protein  YP_003001543  decreased coverage  7.94784e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_03835  CDS  NC_012892  4110755  4112044  1290  hypothetical protein  YP_003001567  decreased coverage  0.000931477  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_04041  CDS  NC_012892  4339534  4340172  639  hypothetical protein  YP_003001764  decreased coverage  8.49189e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_04042  CDS  NC_012892  4340391  4341011  621  hypothetical protein  YP_003001765  decreased coverage  8.98857e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_04091  CDS  NC_012892  4395901  4397001  1101  hypothetical protein  YP_003001812  decreased coverage  2.67736e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_04164  CDS  NC_012892  4468865  4470043  1179  hypothetical protein  YP_003001880  decreased coverage  1.2722e-05  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
B21_04205  CDS  NC_012892  4517442  4517981  540  hypothetical protein  YP_003001917  decreased coverage  3.23192e-06  n/a    Escherichia coli BL21  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>