46 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
OSTLU_14946  CDS  NC_009358  241541  243544  2004  predicted protein  XP_001417186  decreased coverage  0.000739979  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_14961  CDS  NC_009358  267338  268558  1221  predicted protein  XP_001417199  decreased coverage  0.000165599  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15042  CDS  NC_009358  458852  459511  660  predicted protein  XP_001417512  decreased coverage  0.0000136841  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15083  CDS  NC_009358  557540  558430  891  predicted protein  XP_001417537  decreased coverage  0.00145719  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15108  CDS  NC_009358  611534  614497  2964  predicted protein  XP_001417297  decreased coverage  0.000868125  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15121  CDS  NC_009358  648183  649631  1449  predicted protein  XP_001417305  decreased coverage  0.00108043  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15138  CDS  NC_009358  678121  679183  1063  predicted protein  XP_001417319  decreased coverage  0.000140284  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15174  CDS  NC_009358  760377  761138  762  predicted protein  XP_001417594  decreased coverage  0.000235527  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24349  CDS  NC_009358  71230  74169  2940  predicted protein  XP_001417134  decreased coverage  0.000638431  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24369  CDS  NC_009358  210797  212011  1215  predicted protein  XP_001417179  decreased coverage  0.00384318  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24424  CDS  NC_009358  487955  492279  4325  predicted protein  XP_001417521  decreased coverage  0.000584172  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24477  CDS  NC_009358  885979  887942  1964  TRP-containing protein  XP_001417631  decreased coverage  0.000106986  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_30949  CDS  NC_009358  34336  35217  882  predicted protein  XP_001417411  decreased coverage  0.000000023879  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31014  CDS  NC_009358  158607  160368  1762  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  XP_001417438  decreased coverage  0.00547148  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31028  CDS  NC_009358  183457  183834  378  predicted protein  XP_001417443  decreased coverage  0.00359848  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31034  CDS  NC_009358  191927  192781  855  predicted protein  XP_001417445  decreased coverage  0.00229474  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31107  CDS  NC_009358  310819  311292  474  predicted protein  XP_001417476  decreased coverage  0.0000137744  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31108  CDS  NC_009358  311858  313180  1323  psaF, PSI-F, subunit III, photosystem I polypeptide  XP_001417212  decreased coverage  0.000169321  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31158  CDS  NC_009358  411158  413562  2405  predicted protein  XP_001417235  decreased coverage  0.000507428  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31172  CDS  NC_009358  432407  433135  729  predicted protein  XP_001417501  decreased coverage  0.000244405  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31263  CDS  NC_009358  579544  581865  2322  predicted protein  XP_001417290  decreased coverage  0.00499244  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31307  CDS  NC_009358  665207  667684  2478  H+-PPase family transporter: proton  XP_001417314  decreased coverage  0.0000955532  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31322  CDS  NC_009358  690774  692707  1934  Ornithine decarboxylase  XP_001417323  decreased coverage  0.0025491  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31344  CDS  NC_009358  727625  727942  318  predicted protein  XP_001417335  decreased coverage  0.000472195  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31385  CDS  NC_009358  781786  783493  1708  predicted protein  XP_001417356  decreased coverage  0.000357166  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_31405  CDS  NC_009358  827124  827567  444  predicted protein  XP_001417613  decreased coverage  0.0000503834  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_36889  CDS  NC_009358  137557  138183  627  predicted protein  XP_001417432  decreased coverage  0.00688126  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_36933  CDS  NC_009358  558885  561683  2799  predicted protein  XP_001417281  decreased coverage  0.00575996  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_36955  CDS  NC_009358  268648  269904  1257  predicted protein  XP_001417200  decreased coverage  0.000048809  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_37187  CDS  NC_009358  768794  770785  1992  predicted protein  XP_001417597  decreased coverage  0.00858148  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_37212  CDS  NC_009358  191083  191523  441  predicted protein  XP_001417444  decreased coverage  0.00115186  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_37252  CDS  NC_009358  601402  603471  2070  predicted protein  XP_001417548  decreased coverage  0.000000758174  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_45384  CDS  NC_009358  381115  385191  4077  predicted protein  XP_001417229  decreased coverage  0.00403917  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_45389  CDS  NC_009358  51171  54144  2974  predicted protein  XP_001417128  decreased coverage  0.000425012  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_49296  CDS  NC_009358  56145  57620  1476  predicted protein  XP_001417130  decreased coverage  0.000330507  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_49454  CDS  NC_009358  155694  157655  1962  ABC(ATP-binding) family transporter  XP_001417437  decreased coverage  0.00209815  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_5419  CDS  NC_009358  209988  210656  669  predicted protein  XP_001417178  decreased coverage  0.00130876  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_710  CDS  NC_009358  308156  310777  2622  predicted protein  XP_001417211  decreased coverage  0.000103935  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_87011  CDS  NC_009358  457810  458808  999  predicted protein  XP_001417249  decreased coverage  0.000139497  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_87099  CDS  NC_009358  748742  751234  2493  predicted protein  XP_001417342  decreased coverage  0.000037034  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_87130  CDS  NC_009358  841605  842696  1092  predicted protein  XP_001417619  decreased coverage  0.0000907307  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_9151  CDS  NC_009358  252567  252926  360  predicted protein  XP_001417457  decreased coverage  0.00609094  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_92549  CDS  NC_009358  54282  55139  858  predicted protein  XP_001417129  decreased coverage  0.000196383  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_92649  CDS  NC_009358  709475  710167  693  predicted protein  XP_001417574  decreased coverage  0.000198654  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_92650  CDS  NC_009358  710271  710891  621  predicted protein  XP_001417328  decreased coverage  0.000152936  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_92667  CDS  NC_009358  840709  841563  855  predicted protein  XP_001417367  decreased coverage  0.0000121698  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>