358 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
OSTLU_10245  CDS  NC_009357  177372  178226  855  predicted protein  XP_001416576  decreased coverage  0.00334407  normal  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_10321  CDS  NC_009355  202230  202931  702  predicted protein  XP_001415764  decreased coverage  3.76906e-05  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_10510  CDS  NC_009359  106339  106584  246  predicted protein  XP_001417675  decreased coverage  0.00150742  normal  0.745145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_119465  CDS  NC_009356  339054  341447  2394  DodoPi transposase-like protein  XP_001416135  decreased coverage  0.00345853  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_119474  CDS  NC_009356  408886  410646  1761  Glucokinase  XP_001416380  decreased coverage  0.00149194  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_119527  CDS  NC_009356  489201  492320  3120  transcription & nuclear export THO-TREX component protein Tho2-like protein  XP_001416161  decreased coverage  0.00206134  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_119537  CDS  NC_009356  508815  509222  408  Conserved protein of Unknown function  XP_001416167  decreased coverage  0.00583552  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_119551  CDS  NC_009356  532626  537878  5253  Separase, putative  XP_001416421  decreased coverage  0.000936243  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_119579  CDS  NC_009356  598915  601415  2501  Novel AAA ATPase  XP_001416188  decreased coverage  0.00226042  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_119580  CDS  NC_009356  601639  603216  1578  predicted protein  XP_001416189  decreased coverage  0.00236859  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_119625  CDS  NC_009356  665912  666578  667  predicted protein  XP_001416210  decreased coverage  0.000684517  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_1251  CDS  NC_009360  275647  277470  1824  predicted protein  XP_001418199  decreased coverage  1.55257e-05  normal  0.0305242  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_12740  CDS  NC_009361  565270  565926  657  predicted protein  XP_001418746  decreased coverage  0.00112187  normal  0.06368  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_12783  CDS  NC_009362  129127  130680  1554  predicted protein  XP_001419078  normal  decreased coverage  0.00554714  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_13090  CDS  NC_009366  47925  49079  1155  dihydroorotate dehydrogenase  XP_001420736  normal  decreased coverage  0.00338155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_13210  CDS  NC_009367  383838  384530  693  predicted protein  XP_001421135  normal  decreased coverage  0.00422519  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_13359  CDS  NC_009370  239999  240820  822  predicted protein  XP_001421887  normal  0.0111661  decreased coverage  0.000118629  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_13360  CDS  NC_009370  243965  245440  1476  predicted protein  XP_001421889  normal  decreased coverage  0.000134973  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_14186  CDS  NC_009356  300186  300581  396  predicted protein  XP_001416362  decreased coverage  0.000410242  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_14486  CDS  NC_009357  187075  192423  5349  predicted protein  XP_001416870  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_14505  CDS  NC_009357  235845  236684  840  predicted protein  XP_001416592  decreased coverage  0.00133095  normal  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_14671  CDS  NC_009357  571347  572870  1524  predicted protein  XP_001416985  decreased coverage  0.000514062  normal  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_14769  CDS  NC_009357  783474  786191  2718  predicted protein  XP_001416761  decreased coverage  0.00506073  normal  0.208503  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_14946  CDS  NC_009358  241541  243544  2004  predicted protein  XP_001417186  decreased coverage  0.000739979  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_14961  CDS  NC_009358  267338  268558  1221  predicted protein  XP_001417199  decreased coverage  0.000165599  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15042  CDS  NC_009358  458852  459511  660  predicted protein  XP_001417512  decreased coverage  1.36841e-05  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15083  CDS  NC_009358  557540  558430  891  predicted protein  XP_001417537  decreased coverage  0.00145719  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15108  CDS  NC_009358  611534  614497  2964  predicted protein  XP_001417297  decreased coverage  0.000868125  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15121  CDS  NC_009358  648183  649631  1449  predicted protein  XP_001417305  decreased coverage  0.00108043  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15138  CDS  NC_009358  678121  679183  1063  predicted protein  XP_001417319  decreased coverage  0.000140284  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15174  CDS  NC_009358  760377  761138  762  predicted protein  XP_001417594  decreased coverage  0.000235527  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15487  CDS  NC_009359  520307  521287  981  predicted protein  XP_001418033  normal  0.320595  decreased coverage  0.000298049  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15488  CDS  NC_009359  521505  522977  1473  predicted protein  XP_001417799  normal  0.427459  decreased coverage  0.000333218  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_15675  CDS  NC_009360  154752  157310  2559  predicted protein  XP_001418392  normal  0.391705  decreased coverage  0.00350407  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_1568  CDS  NC_009365  210974  212233  1260  predicted protein  XP_001420275  decreased coverage  8.80884e-06  normal  0.122051  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16090  CDS  NC_009361  285360  286934  1575  predicted protein  XP_001418891  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16112  CDS  NC_009361  337329  338219  891  predicted protein  XP_001418905  decreased coverage  6.64084e-06  normal  0.0559638  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16425  CDS  NC_009362  282165  283331  1167  predicted protein  XP_001419118  decreased coverage  0.00115978  normal  0.534008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16435  CDS  NC_009362  307207  309241  2035  predicted protein  XP_001419124  decreased coverage  0.00839991  normal  0.138693  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16531  CDS  NC_009362  520172  522238  2067  predicted protein  XP_001419408  decreased coverage  0.00789069  normal  0.505528  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16557  CDS  NC_009362  583302  583862  561  predicted protein  XP_001419208  decreased coverage  0.000407873  normal  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16756  CDS  NC_009363  276679  278313  1635  predicted protein  XP_001419763  decreased coverage  0.000381378  normal  0.128355  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16772  CDS  NC_009363  314827  315879  1053  predicted protein  XP_001419554  normal  decreased coverage  0.00903198  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16816  CDS  NC_009363  399237  401554  2318  predicted protein  XP_001419586  normal  decreased coverage  0.000655212  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_16903  CDS  NC_009363  604954  607908  2955  predicted protein  XP_001419852  normal  0.500288  decreased coverage  0.00972481  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17059  CDS  NC_009364  272264  273232  969  predicted protein  XP_001419956  decreased coverage  0.00244851  normal  0.106822  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17263  CDS  NC_009365  164644  165027  384  Plastid ribosomal protein L24 large ribosomal subunit  XP_001420431  hitchhiker  0.00177842  decreased coverage  0.00283524  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17340  CDS  NC_009365  336638  337396  759  Putative mitochondrial ribosomal protein L4  XP_001420312  decreased coverage  0.000952824  normal  0.0986734  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17489  CDS  NC_009366  45075  45602  528  predicted protein  XP_001420735  normal  decreased coverage  0.0026418  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17567  CDS  NC_009366  212109  213395  1287  predicted protein  XP_001420621  normal  decreased coverage  0.00168802  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17568  CDS  NC_009366  215234  217681  2448  predicted protein  XP_001420622  normal  0.180274  decreased coverage  0.00230003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17621  CDS  NC_009366  328612  330087  1476  predicted protein  XP_001420818  normal  0.0110477  decreased coverage  7.23215e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17622  CDS  NC_009366  330196  330972  777  predicted protein  XP_001420819  normal  0.100559  decreased coverage  5.63301e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17765  CDS  NC_009367  102675  104882  2208  VIC family transporter: potassium ion channel, potassium voltage-gated channel, subfamily H (Eag-related)  XP_001421053  decreased coverage  5.0158e-07  hitchhiker  0.00697656  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17805  CDS  NC_009367  190126  191916  1791  predicted protein  XP_001420929  decreased coverage  0.000346932  hitchhiker  0.00435019  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17852  CDS  NC_009367  281039  282190  1152  predicted protein  XP_001420956  decreased coverage  0.00377109  normal  0.168751  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_17975  CDS  NC_009368  44201  46233  2033  predicted protein  XP_001421374  normal  0.796717  decreased coverage  0.000290426  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18007  CDS  NC_009368  125527  127209  1683  predicted protein  XP_001421212  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18085  CDS  NC_009368  324011  325306  1296  predicted protein  XP_001421263  normal  0.0963143  decreased coverage  0.000212922  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18135  CDS  NC_009368  463262  463759  498  predicted protein  XP_001421474  decreased coverage  0.000129475  normal  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18182  CDS  NC_009368  582870  585119  2250  predicted protein  XP_001421509  normal  0.28956  decreased coverage  0.00382688  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18191  CDS  NC_009368  606731  607912  1182  predicted protein  XP_001421337  decreased coverage  1.01363e-13  normal  0.119889  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18539  CDS  NC_009370  235333  237474  2142  predicted protein  XP_001421885  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18543  CDS  NC_009370  242217  243662  1446  predicted protein  XP_001422015  normal  decreased coverage  0.000142314  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18580  CDS  NC_009370  330367  333000  2634  predicted protein  XP_001421910  decreased coverage  5.66018e-05  normal  0.0108768  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18694  CDS  NC_009371  186403  188796  2394  predicted protein  XP_001422120  normal  0.0344474  decreased coverage  0.000276573  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18813  CDS  NC_009372  80757  81407  651  predicted protein  XP_001422335  decreased coverage  4.75797e-05  hitchhiker  0.00108843  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_1885  CDS  NC_009366  43393  44571  1179  CaCA family transporter: sodium ion/potassium ion/calcium ion  XP_001420734  normal  decreased coverage  0.00320098  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18862  CDS  NC_009373  45309  47375  2067  predicted protein  XP_001422371  normal  decreased coverage  7.2012e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18874  CDS  NC_009373  76254  78515  2262  predicted protein  XP_001422431  decreased coverage  5.00904e-06  hitchhiker  1.9569e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_19091  CDS  NC_009374  415524  415856  333  Putative mitochondrial ribosomal protein L20  XP_001422740  normal  decreased coverage  0.00623751  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_19197  CDS  NC_009375  109392  110423  1032  predicted protein  XP_001422809  normal  0.256456  decreased coverage  8.51287e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_19257  CDS  NC_009375  246279  247430  1152  predicted protein  XP_001422938  decreased coverage  1.6644e-05  hitchhiker  0.0048219  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_19561  CDS  NC_009360  405746  407607  1862  predicted protein  XP_001418241  decreased coverage  3.68339e-10  normal  0.864068  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_2073  misc_feature  NC_009365  560289  562223  1935      decreased coverage  0.00822763  normal  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_2179  CDS  NC_009374  204534  205805  1272  predicted protein  XP_001422684  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_2257  CDS  NC_009368  154771  156225  1455  predicted protein  XP_001421402  normal  decreased coverage  0.00414592  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_2338  CDS  NC_009371  182036  183232  1197  predicted protein  XP_001422119  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_23881  CDS  NC_009355  383537  385176  1640  predicted protein  XP_001415477  decreased coverage  0.000447262  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24022  CDS  NC_009356  175983  180551  4569  predicted protein  XP_001416093  decreased coverage  8.88169e-05  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24208  CDS  NC_009357  297448  299678  2231  predicted protein  XP_001416615  decreased coverage  0.00311242  normal  0.163312  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24245  CDS  NC_009357  520899  528035  7137  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  XP_001416972  normal  0.175257  decreased coverage  0.00602767  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24349  CDS  NC_009358  71230  74169  2940  predicted protein  XP_001417134  decreased coverage  0.000638431  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24369  CDS  NC_009358  210797  212011  1215  predicted protein  XP_001417179  decreased coverage  0.00384318  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24424  CDS  NC_009358  487955  492279  4325  predicted protein  XP_001417521  decreased coverage  0.000584172  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24477  CDS  NC_009358  885979  887942  1964  TRP-containing protein  XP_001417631  decreased coverage  0.000106986  n/a    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24530  CDS  NC_009359  256992  258346  1355  predicted protein  XP_001417969  decreased coverage  0.00133033  normal  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24646  CDS  NC_009360  146635  148439  1805  predicted protein  XP_001418166  normal  decreased coverage  0.00339297  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24762  CDS  NC_009361  140708  142406  1699  predicted protein  XP_001418620  decreased coverage  0.00131529  normal  0.027105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24784  CDS  NC_009361  295611  296992  1382  predicted protein  XP_001418895  decreased coverage  3.05391e-05  decreased coverage  0.000652774  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24854  CDS  NC_009361  649526  652333  2808  predicted protein  XP_001419001  normal  decreased coverage  0.0065395  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_2491  CDS  NC_009365  300818  302086  1269  predicted protein  XP_001420302  decreased coverage  0.000443928  normal  0.292142  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_24915  CDS  NC_009362  236800  238741  1942  predicted protein  XP_001419102  decreased coverage  0.00696995  normal  0.487842  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25153  CDS  NC_009364  330923  331997  1075  predicted protein  XP_001419974  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25372  CDS  NC_009367  49373  50510  1138  predicted protein  XP_001421037  decreased coverage  7.39171e-05  normal  0.202683  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25463  CDS  NC_009368  42063  44097  2035  predicted protein  XP_001421192  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25476  CDS  NC_009368  149511  151665  2155  predicted protein  XP_001421400  normal  0.102353  decreased coverage  0.00487339  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25726  CDS  NC_009371  189310  192558  3249  predicted protein  XP_001422121  normal  0.779434  decreased coverage  0.000347416  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25808  CDS  NC_009373  104969  106023  1055  predicted protein  XP_001422437  normal  0.0578872  decreased coverage  1.57897e-09  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25869  CDS  NC_009374  324884  325990  1107  predicted protein  XP_001422714  normal  0.374008  decreased coverage  0.00267315  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>