95 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BCB4264_A0001  CDS  NC_011725  407  1747  1341  chromosomal replication initiation protein  YP_002364856  decreased coverage  0.000585905  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0050  CDS  NC_011725  47998  48867  870  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  YP_002364895  decreased coverage  0.000499132  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0052  CDS  NC_011725  49891  50265  375  putative endoribonuclease L-PSP  YP_002364897  decreased coverage  0.000180566  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0065  CDS  NC_011725  63221  63580  360  cell division protein DivIC  YP_002364910  decreased coverage  0.000127257  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0069  CDS  NC_011725  64730  67201  2472  stage II sporulation protein E  YP_002364912  decreased coverage  0.00552781  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0101  CDS  NC_011725  94225  95289  1065  ATP:guanido phosphotransferase  YP_002364930  decreased coverage  0.000569587  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0185  CDS  NC_011725  157029  158174  1146  glycerate kinase  YP_002365001  decreased coverage  0.000580262  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0300  CDS  NC_011725  259457  260995  1539  GMP synthase  YP_002365095  decreased coverage  0.00113361  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0308  CDS  NC_011725  271548  272279  732  FrnE protein  YP_002365100  decreased coverage  0.00686429  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0503  CDS  NC_011725  488007  489509  1503  putative PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  YP_002365281  decreased coverage  0.000842328  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0707  CDS  NC_011725  699023  699874  852  phospholipase C  YP_002365467  decreased coverage  0.000293533  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A0914  CDS  NC_011725  879032  880084  1053  hypothetical protein  YP_002365647  decreased coverage  0.000538183  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1016  CDS  NC_011725  996623  997963  1341  NlpC/P60 family protein  YP_002365749  decreased coverage  0.000775164  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1017  CDS  NC_011725  998055  998576  522  transposase  YP_002365750  decreased coverage  0.000209599  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1169  CDS  NC_011725  1138317  1138802  486  RNA polymerase sigma factor  YP_002365902  decreased coverage  0.00105347  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1184  CDS  NC_011725  1154591  1155085  495  hypothetical protein  YP_002365917  decreased coverage  0.000211652  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1272  CDS  NC_011725  1237128  1237898  771  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  YP_002366004  decreased coverage  0.00654977  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1510  CDS  NC_011725  1443990  1446032  2043  penicillin-binding protein  YP_002366236  decreased coverage  0.00148274  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1598  CDS  NC_011725  1522965  1525769  2805  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  YP_002366323  decreased coverage  0.00523268  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1674  CDS  NC_011725  1598566  1598844  279  hypothetical protein  YP_002366393  decreased coverage  0.000499245  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1960  CDS  NC_011725  1871422  1872186  765  hydrolase, alpha/beta fold family  YP_002366677  decreased coverage  0.000316355  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A1979  CDS  NC_011725  1892918  1893739  822  putative polysaccharide deacetylase  YP_002366696  decreased coverage  0.00191884  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A2119  CDS  NC_011725  2020225  2021394  1170  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  YP_002366836  decreased coverage  0.00322854  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A2615  CDS  NC_011725  2526616  2526795  180  hypothetical protein  YP_002367324  decreased coverage  0.000714121  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A2742  CDS  NC_011725  2647123  2648826  1704  metalloendopeptidase  YP_002367450  decreased coverage  0.00888041  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A2799  CDS  NC_011725  2694786  2695472  687  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002367507  decreased coverage  0.00156279  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A2852  CDS  NC_011725  2739298  2739606  309  hypothetical protein  YP_002367560  decreased coverage  0.000902075  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A2853  CDS  NC_011725  2739594  2740043  450  hypothetical protein  YP_002367561  decreased coverage  0.00127312  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A2854  CDS  NC_011725  2740302  2741066  765  hypothetical protein  YP_002367562  decreased coverage  0.00218141  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A2897  CDS  NC_011725  2778931  2779554  624  hypothetical protein  YP_002367605  decreased coverage  0.00124034  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3276  CDS  NC_011725  3166133  3166750  618  hypothetical protein  YP_002367982  decreased coverage  0.000180566  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3459  CDS  NC_011725  3340888  3342279  1392  amino acid permease family protein  YP_002368163  decreased coverage  0.00571455  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3899  CDS  NC_011725  3818538  3819584  1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_002368602  decreased coverage  0.00229604  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3955  CDS  NC_011725  3876704  3878380  1677  putative phosphatase  YP_002368657  decreased coverage  0.00126746  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3956  CDS  NC_011725  3878403  3878765  363  hypothetical protein  YP_002368658  decreased coverage  0.000150921  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3957  CDS  NC_011725  3879142  3879330  189  50S ribosomal protein L28  YP_002368659  decreased coverage  0.000128459  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3971  CDS  NC_011725  3893315  3893578  264  hypothetical protein  YP_002368673  decreased coverage  0.00678821  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3989  CDS  NC_011725  3913341  3914624  1284  uracil permease  YP_002368690  decreased coverage  0.000553719  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3991  CDS  NC_011725  3914771  3915313  543  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  YP_002368691  decreased coverage  0.000159752  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A3993  CDS  NC_011725  3915517  3916425  909  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  YP_002368692  decreased coverage  0.000288046  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4077  CDS  NC_011725  3993053  3993607  555  peptide deformylase  YP_002368775  decreased coverage  0.000234645  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4078  CDS  NC_011725  3993668  3994441  774  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  YP_002368776  decreased coverage  0.00227623  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4105  CDS  NC_011725  4016707  4018248  1542  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  YP_002368803  decreased coverage  0.00176585  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4142  CDS  NC_011725  4050242  4051021  780  hydrolase, carbon-nitrogen family  YP_002368838  decreased coverage  0.00675499  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4181  CDS  NC_011725  4082930  4084456  1527  sodium-dependent symporter family protein  YP_002368876  decreased coverage  0.000726069  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4195  CDS  NC_011725  4095475  4096779  1305  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  YP_002368890  decreased coverage  0.00109232  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4197  CDS  NC_011725  4097621  4098805  1185  phosphopentomutase  YP_002368892  decreased coverage  0.00100464  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4262  CDS  NC_011725  4155551  4156273  723  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  YP_002368955  decreased coverage  0.00783268  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4263  CDS  NC_011725  4156266  4156925  660  amino acid ABC transporter, permease protein  YP_002368956  decreased coverage  0.00620505  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4264  CDS  NC_011725  4156962  4157741  780  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  YP_002368957  decreased coverage  0.000272293  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4545  CDS  NC_011725  4403583  4405397  1815  spore coat assembly protein SafA  YP_002369235  decreased coverage  0.00085857  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4549  CDS  NC_011725  4409294  4410436  1143  cysteine desulfurase  YP_002369239  decreased coverage  0.000288046  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4550  CDS  NC_011725  4410436  4410978  543  hypothetical protein  YP_002369240  decreased coverage  0.000106281  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4631  CDS  NC_011725  4487469  4488242  774  electron transfer flavoprotein, beta subunit  YP_002369318  decreased coverage  0.00479771  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4663  CDS  NC_011725  4519805  4521526  1722  hypothetical protein  YP_002369350  decreased coverage  0.00758489  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4739  CDS  NC_011725  4594388  4594705  318  hypothetical protein  YP_002369425  decreased coverage  0.000113534  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4764  CDS  NC_011725  4617856  4618458  603  30S ribosomal protein S4  YP_002369450  decreased coverage  0.0013865  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4840  CDS  NC_011725  4685995  4686219  225  hypothetical protein  YP_002369526  decreased coverage  0.000595004  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4841  CDS  NC_011725  4686298  4686603  306  rhodanese-like domain protein  YP_002369527  decreased coverage  0.000626615  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4877  CDS  NC_011725  4718605  4719804  1200  S-adenosylmethionine synthetase  YP_002369563  decreased coverage  0.000842328  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A4987  CDS  NC_011725  4813196  4814590  1395  menaquinone-specific isochorismate synthase  YP_002369671  decreased coverage  0.00107234  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5115  CDS  NC_011725  4923884  4924363  480  hypothetical protein  YP_002369775  decreased coverage  0.00109943  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5132  CDS  NC_011725  4939420  4939719  300  putative thioredoxin  YP_002369791  decreased coverage  0.000123697  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5138  CDS  NC_011725  4942325  4942972  648  PAP2 family protein  YP_002369797  decreased coverage  0.000319321  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5139  CDS  NC_011725  4943036  4944049  1014  hypothetical protein  YP_002369798  decreased coverage  0.000642874  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5185  CDS  NC_011725  4985645  4987339  1695  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_002369844  decreased coverage  0.00149704  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5235  CDS  NC_011725  5037843  5038505  663  DNA-binding response regulator  YP_002369894  decreased coverage  0.0048741  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5252  CDS  NC_011725  5053049  5054233  1185  phosphoglycerate kinase  YP_002369909  decreased coverage  0.00039947  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5272  CDS  NC_011725  5069685  5070635  951  hypothetical protein  YP_002369928  decreased coverage  0.00634924  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5313  CDS  NC_011725  5109045  5109176  132  hypothetical protein  YP_002369968  decreased coverage  0.00949337  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5314  CDS  NC_011725  5109294  5110715  1422  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  YP_002369969  decreased coverage  0.00085857  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5424  CDS  NC_011725  5222729  5223514  786  group-specific protein  YP_002370078  decreased coverage  0.00185358  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5628  tRNA  NC_011725  64312  64390  79  tRNA-Met    decreased coverage  0.00010832  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5629  tRNA  NC_011725  64400  64474  75  tRNA-Glu    decreased coverage  9.7671e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5651  tRNA  NC_011725  156177  156252  76  tRNA-Thr    decreased coverage  7.01056e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5652  tRNA  NC_011725  156273  156349  77  tRNA-Glu    decreased coverage  7.48883e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5653  tRNA  NC_011725  156353  156430  78  tRNA-Val    decreased coverage  7.41856e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5654  tRNA  NC_011725  156447  156530  84  tRNA-Tyr    decreased coverage  7.70795e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5655  tRNA  NC_011725  156596  156670  75  tRNA-Gln    decreased coverage  7.92898e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5656  tRNA  NC_011725  156676  156751  76  tRNA-Lys    decreased coverage  7.63421e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5657  tRNA  NC_011725  156757  156831  75  tRNA-Gly    decreased coverage  7.92898e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5658  tRNA  NC_011725  156839  156914  76  tRNA-Ala    decreased coverage  8.63381e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5705  rRNA  NC_011725  531614  531729  116  5S ribosomal RNA    decreased coverage  9.40087e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5706  tRNA  NC_011725  531737  531813  77  tRNA-Asn    decreased coverage  9.05345e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5707  tRNA  NC_011725  531814  531907  94  tRNA-Ser    decreased coverage  9.58315e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5708  tRNA  NC_011725  531923  531999  77  tRNA-Glu    decreased coverage  9.1391e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5709  tRNA  NC_011725  532002  532079  78  tRNA-Val    decreased coverage  9.49158e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5710  tRNA  NC_011725  532104  532182  79  tRNA-Met    decreased coverage  9.1391e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5711  tRNA  NC_011725  532184  532261  78  tRNA-Asp    decreased coverage  8.63381e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5713  tRNA  NC_011725  532364  532439  76  tRNA-Thr    decreased coverage  8.38851e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5815  tRNA  NC_011725  4836638  4836712  75  tRNA-Gly    decreased coverage  6.50347e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5816  tRNA  NC_011725  4836738  4836823  86  tRNA-Leu    decreased coverage  6.14665e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5817  tRNA  NC_011725  4836844  4836921  78  tRNA-His    decreased coverage  6.94475e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5819  tRNA  NC_011725  4837009  4837086  78  tRNA-Val    decreased coverage  6.75228e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
BCB4264_A5820  rRNA  NC_011725  4837090  4837205  116  5S ribosomal RNA    decreased coverage  7.21033e-05  n/a    Bacillus cereus B4264  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>