33 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tpen_0114  CDS  NC_008698  89300  90499  1200  FAD dependent oxidoreductase  YP_919527  decreased coverage  0.00154267  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0291  CDS  NC_008698  258656  260293  1638  thermosome  YP_919704  decreased coverage  0.00322261  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0292  CDS  NC_008698  260514  260903  390  putative phage repressor  YP_919705  decreased coverage  3.55656e-05  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0293  CDS  NC_008698  261177  261605  429  TATA-box binding  YP_919706  decreased coverage  7.61553e-06  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0294  CDS  NC_008698  261738  262190  453  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  YP_919707  decreased coverage  6.61425e-06  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0381  CDS  NC_008698  345980  346570  591  hypothetical protein  YP_919793  decreased coverage  2.32223e-06  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0382  CDS  NC_008698  346597  347193  597  hypothetical protein  YP_919794  decreased coverage  0.000152974  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0609    NC_008698  562965  563237  273      decreased coverage  0.00114934  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0644  CDS  NC_008698  595068  595355  288  50S ribosomal protein L44e  YP_920049  decreased coverage  4.50289e-09  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0651  CDS  NC_008698  601410  602117  708  DNA polymerase beta superfamily nucleotidyltransferase  YP_920056  decreased coverage  4.44232e-07  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0842  CDS  NC_008698  792367  792537  171  hypothetical protein  YP_920246  decreased coverage  0.00591324  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0976  CDS  NC_008698  923204  925234  2031  ferrous iron transport protein B  YP_920379  decreased coverage  0.00114707  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_0987  CDS  NC_008698  938824  939723  900  partition protein, ParA-like  YP_920390  decreased coverage  0.000325119  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1077  CDS  NC_008698  1014789  1016081  1293  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_920479  decreased coverage  0.00864791  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1097  CDS  NC_008698  1035674  1036177  504  PTS system sorbose subfamily IIB component  YP_920499  decreased coverage  0.00631969  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1154  CDS  NC_008698  1093176  1094210  1035  transcriptional regulator, TrmB  YP_920555  decreased coverage  0.00116341  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1318  CDS  NC_008698  1265808  1267571  1764  hypothetical protein  YP_920718  decreased coverage  0.00353025  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1382  CDS  NC_008698  1336331  1337248  918  spermine synthase  YP_920782  decreased coverage  0.00501465  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1391  CDS  NC_008698  1345078  1345965  888  beta-lactamase domain-containing protein  YP_920791  decreased coverage  0.00324967  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1452  CDS  NC_008698  1402887  1403789  903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_920852  decreased coverage  0.00399019  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1486  CDS  NC_008698  1436294  1437370  1077  ABC transporter related  YP_920886  decreased coverage  0.00353537  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1505  CDS  NC_008698  1453078  1454268  1191  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  YP_920905  decreased coverage  0.00635225  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1553  CDS  NC_008698  1503235  1504323  1089  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  YP_920952  decreased coverage  0.00925156  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1611  CDS  NC_008698  1556223  1557989  1767  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_921009  decreased coverage  0.000292918  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1648  CDS  NC_008698  1596378  1597196  819  fructose-bisphosphate aldolase  YP_921046  decreased coverage  0.00227658  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1685  CDS  NC_008698  1634106  1635266  1161  hypothetical protein  YP_921083  decreased coverage  1.83285e-06  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1697  CDS  NC_008698  1640584  1640862  279  DNA polymerase beta subunit  YP_921095  decreased coverage  5.99045e-06  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1768  CDS  NC_008698  1709176  1709703  528  NUDIX hydrolase  YP_921166  decreased coverage  0.00835912  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1802  CDS  NC_008698  1741983  1743161  1179  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_921200  decreased coverage  0.00556002  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1803  CDS  NC_008698  1743186  1743422  237  hypothetical protein  YP_921201  decreased coverage  0.00452697  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1804  CDS  NC_008698  1743432  1743839  408  hypothetical protein  YP_921202  decreased coverage  0.0031996  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1813  CDS  NC_008698  1755730  1756830  1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_921211  decreased coverage  0.00420003  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Tpen_1827  CDS  NC_008698  1770227  1770886  660  hypothetical protein  YP_921225  decreased coverage  0.00475891  n/a    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>