31 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bamb_0091  CDS  NC_008390  102009  102857  +  849  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_771986  decreased coverage  0.000844383  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0252  CDS  NC_008390  298436  299626  +  1191  elongation factor Tu  YP_772146  decreased coverage  0.0000268752  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0277  CDS  NC_008390  324632  325000  +  369  50S ribosomal protein L14  YP_772171  decreased coverage  0.00000632835  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0278  CDS  NC_008390  325010  325318  +  309  50S ribosomal protein L24  YP_772172  decreased coverage  0.00000698437  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0381  CDS  NC_008390  425833  426348  +  516  hypothetical protein  YP_772274  decreased coverage  0.00433333  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0382  CDS  NC_008390  426364  427854  +  1491  hypothetical protein  YP_772275  decreased coverage  0.000637648  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0828  CDS  NC_008390  914140  915387  +  1248  extracellular solute-binding protein  YP_772721  decreased coverage  0.00532301  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1165  CDS  NC_008390  1272540  1274129  +  1590  lytic transglycosylase, catalytic  YP_773057  decreased coverage  0.00000346061  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1193  CDS  NC_008390  1307685  1309355  +  1671  hypothetical protein  YP_773085  decreased coverage  0.000362542  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1639  CDS  NC_008390  1813303  1814643  +  1341  amino acid permease-associated region  YP_773530  decreased coverage  0.00236467  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1848  CDS  NC_008390  2032541  2032909  +  369  hypothetical protein  YP_773738  decreased coverage  0.0017944  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1884  CDS  NC_008390  2064803  2065165  +  363  hypothetical protein  YP_773774  decreased coverage  0.00000188167  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1885  CDS  NC_008390  2065165  2066763  +  1599  hypothetical protein  YP_773775  decreased coverage  0.0000551377  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1887  CDS  NC_008390  2070253  2070744  +  492  hypothetical protein  YP_773777  decreased coverage  0.000134466  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1888  CDS  NC_008390  2070856  2071785  +  930  HvnB; halovibrin  YP_773778  decreased coverage  0.000699147  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1927  CDS  NC_008390  2122178  2123539  +  1362  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_773817  decreased coverage  0.000286797  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2088  CDS  NC_008390  2291929  2293338  -  1410  glutamyl-tRNA synthetase  YP_773978  decreased coverage  0.00000151116  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2128  CDS  NC_008390  2340970  2341215  +  246  hypothetical protein  YP_774018  decreased coverage  0.00480031  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2153  CDS  NC_008390  2364956  2366653  +  1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  YP_774043  decreased coverage  0.000147893  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2404  CDS  NC_008390  2651886  2652149  +  264  hypothetical protein  YP_774294  decreased coverage  0.00107608  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2673  CDS  NC_008390  2944325  2945389  -  1065  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  YP_774563  decreased coverage  0.000776519  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2702  CDS  NC_008390  2976681  2978339  +  1659  major facilitator transporter  YP_774592  decreased coverage  0.00241693  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2862  CDS  NC_008390  3156491  3157453  +  963  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_774752  decreased coverage  0.0000366656  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3167  CDS  NC_008390  3501124  3501636  +  513  rod shape-determining protein MreD  YP_775057  decreased coverage  0.00609809  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0003  rRNA  NC_008390  14918  16443  -  1526  16S ribosomal RNA    decreased coverage  0.00000145483  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0014  tRNA  NC_008390  298297  298371  +  75  tRNA-Thr    decreased coverage  0.00000027785  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0035  tRNA  NC_008390  1110837  1110912  +  76  tRNA-Gly    decreased coverage  0.000173498  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0057  tRNA  NC_008390  2291510  2291585  -  76  tRNA-Glu    decreased coverage  0.00000000345066  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0058  tRNA  NC_008390  2291725  2291800  -  76  tRNA-Ala    decreased coverage  0.00000000348439  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0073  tRNA  NC_008390  2978457  2978533  +  77  tRNA-Met    decreased coverage  0.0000840179  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0076  tRNA  NC_008390  3526870  3526945  +  76  tRNA-Lys    decreased coverage  0.0000822229  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>