21 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bcen_3217  CDS  NC_008061  280877  281176  +  300  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  YP_623085  decreased coverage  0.00204366  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3230  CDS  NC_008061  294653  295498  +  846  hypothetical protein  YP_623098  decreased coverage  0.00477768  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3243  CDS  NC_008061  317648  319981  +  2334  TonB-dependent receptor  YP_623111  decreased coverage  0.00716389  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3487  CDS  NC_008061  599865  600488  -  624  haloacid dehalogenase-like hydrolase  YP_623354  decreased coverage  0.00401487  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3489  CDS  NC_008061  600801  601061  -  261  prevent-host-death protein  YP_623356  decreased coverage  0.00502392  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3518  CDS  NC_008061  629410  630039  +  630  Type III secretion system HrpE/YscL  YP_623385  decreased coverage  0.00253777  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3647  CDS  NC_008061  773747  774796  -  1050  multidrug resistance protein MdtN  YP_623512  decreased coverage  0.00582079  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3908  CDS  NC_008061  1066464  1066712  +  249  hypothetical protein  YP_623770  decreased coverage  0.0064026  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3909  CDS  NC_008061  1066924  1067223  +  300  hypothetical protein  YP_623771  decreased coverage  0.00657063  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3933  CDS  NC_008061  1098490  1099584  +  1095  alkanesulfonate monooxygenase  YP_623795  decreased coverage  0.00336425  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_4142  CDS  NC_008061  1325190  1326968  -  1779  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_624004  decreased coverage  0.00267636  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_4143  CDS  NC_008061  1326968  1327759  -  792  hypothetical protein  YP_624005  decreased coverage  0.00393741  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_4334  CDS  NC_008061  1557328  1557879  -  552  hypothetical protein  YP_624193  decreased coverage  0.00217512  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_4806  CDS  NC_008061  2074734  2075603  +  870  hypothetical protein  YP_624658  decreased coverage  0.000591229  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_4972  CDS  NC_008061  2240172  2240660  -  489  hypothetical protein  YP_624820  decreased coverage  0.00226838  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5136  CDS  NC_008061  2420039  2422276  -  2238  hypothetical protein  YP_624983  decreased coverage  0.00343987  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5210  CDS  NC_008061  2503040  2503978  +  939  outer membrane protein (porin)  YP_625057  decreased coverage  0.00719172  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5315  CDS  NC_008061  2612508  2612819  -  312  hypothetical protein  YP_625162  decreased coverage  0.00430753  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5361  CDS  NC_008061  2663907  2665094  -  1188  N-acylglucosamine 2-epimerase  YP_625207  decreased coverage  0.00978655  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5435  CDS  NC_008061  2739655  2740812  -  1158  porin  YP_625281  decreased coverage  0.00368116  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5468  CDS  NC_008061  2772508  2773659  +  1152  porin  YP_625314  decreased coverage  0.00161783  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>