236 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BCZK0011  CDS  NC_006274  18518  19405  888  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_081629  decreased coverage  1.35608e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0014  CDS  NC_006274  21874  22425  552  group-specific protein  YP_081632  decreased coverage  2.58008e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0023  CDS  NC_006274  28620  28889  270  sigma-K factor processing regulatory protein  YP_081641  decreased coverage  0.000703976  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0036  CDS  NC_006274  44734  45291  558  ribonuclease M5  YP_081653  decreased coverage  7.47887e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0037  CDS  NC_006274  45288  46166  879  dimethyladenosine transferase  YP_081654  decreased coverage  0.00019411  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0063  CDS  NC_006274  73511  74434  924  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  YP_081680  decreased coverage  0.0051359  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0136  CDS  NC_006274  139145  139582  438  50S ribosomal protein L13  YP_081753  decreased coverage  9.86136e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0204  CDS  NC_006274  215178  216827  1650  hypothetical protein  YP_081819  decreased coverage  1.6319e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0239  CDS  NC_006274  261708  261992  285  co-chaperonin GroES  YP_081853  decreased coverage  4.42423e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0304  CDS  NC_006274  355963  357159  1197  nucleoside transporter  YP_081913  decreased coverage  8.25173e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0308  CDS  NC_006274  362457  362975  519  hypothetical protein  YP_081917  decreased coverage  0.00327546  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0313  CDS  NC_006274  367151  368572  1422  Na+/H+ antiporter  YP_081922  decreased coverage  8.68354e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0322  CDS  NC_006274  377472  378488  1017  ferrichrome transport system permease  YP_081931  decreased coverage  4.09712e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0337  CDS  NC_006274  393253  394338  1086  fatty acid desaturase  YP_081946  decreased coverage  6.37477e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0367  CDS  NC_006274  429117  430400  1284  major facilitator superfamily permease  YP_081976  decreased coverage  7.14912e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0368  CDS  NC_006274  430509  431822  1314  type I phosphodiesterase  YP_081977  decreased coverage  5.00368e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0375  CDS  NC_006274  437677  438255  579  TerD family tellurium resistance protein  YP_081984  decreased coverage  6.76641e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0376  CDS  NC_006274  438329  439120  792  TerC family integral membrane protein  YP_081985  decreased coverage  4.99103e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0411  CDS  NC_006274  475506  476999  1494  PTS system, N-acetylglucosamine-specific EIIBC component  YP_082020  decreased coverage  4.0679e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0465  CDS  NC_006274  541957  543507  1551  glycine betaine transporter  YP_082072  decreased coverage  1.0169e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0512  CDS  NC_006274  602696  603244  549  hypothetical protein  YP_082118  decreased coverage  1.66734e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0532  CDS  NC_006274  624153  624695  543  orotate phosphoribosyltransferase  YP_082138  decreased coverage  0.00117498  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0540  CDS  NC_006274  632461  633858  1398  arginine/ornithine antiporter protein  YP_082146  decreased coverage  0.00650316  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0564  CDS  NC_006274  658405  659856  1452  sulfate transporter  YP_082170  decreased coverage  0.0031948  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0604  CDS  NC_006274  702656  704047  1392  amino acid permease; proline-specific permease  YP_082210  decreased coverage  1.7445e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0646  CDS  NC_006274  751815  753482  1668  potassium-transporting ATPase subunit A  YP_082251  decreased coverage  0.000509464  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0654  CDS  NC_006274  760612  761913  1302  xanthine/uracil permease family protein  YP_082259  decreased coverage  5.06416e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0672  CDS  NC_006274  776909  777469  561  hypothetical protein  YP_082277  decreased coverage  0.00074605  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0673  CDS  NC_006274  777508  778638  1131  metallo-beta-lactamase family protein  YP_082278  decreased coverage  0.00215478  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0722  CDS  NC_006274  824192  824596  405  hypothetical protein  YP_082326  decreased coverage  5.40501e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0727  CDS  NC_006274  827411  827866  456  acetyltransferase  YP_082331  decreased coverage  6.86887e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0737  CDS  NC_006274  837215  838450  1236  cytochrome P450  YP_082341  decreased coverage  0.000124677  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0753  CDS  NC_006274  858246  859043  798  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  YP_082357  decreased coverage  0.00539884  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0760  CDS  NC_006274  864023  865168  1146  hypothetical protein  YP_082364  decreased coverage  2.76584e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0777  CDS  NC_006274  885484  887223  1740  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_082381  decreased coverage  0.00112193  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0784  CDS  NC_006274  893902  894276  375  group-specific protein  YP_082388  decreased coverage  0.000277795  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0807  CDS  NC_006274  924547  926133  1587  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  YP_082411  decreased coverage  1.07652e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0858  CDS  NC_006274  982180  983028  849  BglG family transcriptional antiterminator  YP_082462  decreased coverage  7.53628e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0875  CDS  NC_006274  996688  997038  351  hypothetical protein  YP_082478  decreased coverage  5.56125e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0923  CDS  NC_006274  1036331  1036864  534  ankyrin repeat-containing protein  YP_082525  decreased coverage  2.69942e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0930  CDS  NC_006274  1041930  1042238  309  phosphatase rapA inhibitor (phosphatase regulator A)  YP_082532  decreased coverage  4.12647e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0988  CDS  NC_006274  1093903  1095324  1422  protoporphyrinogen oxidase  YP_082589  decreased coverage  0.000269776  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0989  CDS  NC_006274  1095364  1096716  1353  group-specific protein  YP_082590  decreased coverage  0.000631677  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1032  CDS  NC_006274  1140464  1140667  204  cold shock protein  YP_082633  decreased coverage  6.08124e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1051  CDS  NC_006274  1156786  1157148  363  hypothetical protein  YP_082652  decreased coverage  0.0043622  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1071  CDS  NC_006274  1178468  1179400  933  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  YP_082672  decreased coverage  0.000173774  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1094  CDS  NC_006274  1204724  1205095  372  hypothetical protein  YP_082695  decreased coverage  2.55516e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1095  CDS  NC_006274  1205126  1205764  639  GTP pyrophosphokinase  YP_082696  decreased coverage  6.91421e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1113  CDS  NC_006274  1221576  1222346  771  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  YP_082714  decreased coverage  7.10304e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1174  CDS  NC_006274  1273055  1273825  771  hypothetical protein  YP_082773  decreased coverage  0.00073042  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1180  CDS  NC_006274  1280946  1281794  849  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  YP_082779  decreased coverage  0.00976508  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1208  CDS  NC_006274  1308184  1308666  483  PHA synthase subunit PhaR; regulator of PhaP  YP_082807  decreased coverage  0.00647485  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1209  CDS  NC_006274  1308818  1309561  744  acetoacetyl-CoA reductase  YP_082808  decreased coverage  0.00888886  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1277  CDS  NC_006274  1371774  1372241  468  hypothetical protein  YP_082876  decreased coverage  4.84756e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1323  CDS  NC_006274  1415901  1417256  1356  branched-chain amino acid transport protein  YP_082922  decreased coverage  0.00120773  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1335  CDS  NC_006274  1426556  1427176  621  hypothetical protein  YP_082934  decreased coverage  6.52491e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1372  CDS  NC_006274  1465505  1466791  1287  glutamate dehydrogenase  YP_082971  decreased coverage  3.83357e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1373  CDS  NC_006274  1466870  1467079  210  group-specific protein  YP_082972  decreased coverage  8.98056e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1392  CDS  NC_006274  1482182  1482454  273  DNA-binding protein HU  YP_082990  decreased coverage  5.12711e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1414  CDS  NC_006274  1500260  1500601  342  hypothetical protein  YP_083011  decreased coverage  7.54399e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1415  CDS  NC_006274  1500601  1501401  801  dihydrodipicolinate reductase  YP_083012  decreased coverage  6.79486e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1536  CDS  NC_006274  1622587  1623969  1383  flagellin  YP_083130  decreased coverage  4.28862e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1578  CDS  NC_006274  1659463  1660029  567  RNA polymerase factor sigma-70  YP_083172  decreased coverage  1.34399e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1595  CDS  NC_006274  1676730  1677542  813  cell surface protein  YP_083189  decreased coverage  1.45863e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1648  CDS  NC_006274  1737040  1738023  984  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  YP_083243  decreased coverage  0.000989072  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1652  CDS  NC_006274  1742413  1743624  1212  fosmidomycin resistance protein  YP_083247  decreased coverage  0.000459515  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1661  CDS  NC_006274  1752106  1752747  642  fibronectin-binding protein  YP_083256  decreased coverage  0.00307165  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1680  CDS  NC_006274  1772419  1772778  360  hypothetical protein  YP_083275  decreased coverage  0.000263371  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1698  CDS  NC_006274  1796288  1797448  1161  enterotoxin; non-hemolytic enterotoxin lytic component L2  YP_083293  decreased coverage  0.000371557  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1709  CDS  NC_006274  1806981  1807898  918  hypothetical protein  YP_083304  decreased coverage  1.23861e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1734  CDS  NC_006274  1857957  1858862  906  drug/metabolite exporter family protein  YP_083329  decreased coverage  0.000184981  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1768  CDS  NC_006274  1892610  1893209  600  nitroreductase family protein  YP_083363  decreased coverage  3.6137e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1792  CDS  NC_006274  1918787  1919443  657  lipoprotein  YP_083387  decreased coverage  5.34132e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1806  CDS  NC_006274  1934042  1934794  753  hypothetical protein  YP_083401  decreased coverage  2.61243e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1857  CDS  NC_006274  1982071  1982967  897  permease  YP_083451  decreased coverage  1.3234e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1889  CDS  NC_006274  2010054  2010899  846  hypothetical protein  YP_083482  decreased coverage  0.00425975  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1971  CDS  NC_006274  2083100  2083483  384  hypothetical protein  YP_083563  decreased coverage  1.54649e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2004  CDS  NC_006274  2126519  2127958  1440  gluconate permease  YP_083596  decreased coverage  0.000311316  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2005  CDS  NC_006274  2128011  2129213  1203  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_083597  decreased coverage  0.000571381  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2036  CDS  NC_006274  2157669  2158631  963  iron(III) dicitrate-binding protein  YP_083628  decreased coverage  1.0516e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2123  CDS  NC_006274  2246485  2246784  300  ArsR family transcriptional regulator  YP_083714  decreased coverage  1.10914e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2178  CDS  NC_006274  2306373  2307269  897  CAAX amino terminal protease family protein  YP_083769  decreased coverage  1.62291e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2191  CDS  NC_006274  2318173  2318769  597  hypothetical protein  YP_083782  decreased coverage  0.00552643  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2238  CDS  NC_006274  2366875  2367051  177  hypothetical protein  YP_083829  decreased coverage  0.00760157  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2306  CDS  NC_006274  2440387  2441022  636  hypothetical protein  YP_083895  decreased coverage  5.74802e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2322  CDS  NC_006274  2456065  2456394  330  aminoglycoside phosphotransferase, N-terminal region  YP_083911  decreased coverage  0.00287241  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2323  CDS  NC_006274  2456397  2456663  267  aminoglycoside phosphotransferase, C-terminal region  YP_083912  decreased coverage  0.00456612  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2329  CDS  NC_006274  2461649  2463019  1371  GntR family transcriptional regulator  YP_083918  decreased coverage  0.00634643  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2344  CDS  NC_006274  2475770  2476774  1005  sensor histidine kinase  YP_083933  decreased coverage  0.00230354  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2348  CDS  NC_006274  2480873  2481409  537  group-specific protein  YP_083937  decreased coverage  0.00355241  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2369  CDS  NC_006274  2503318  2503521  204  group-specific protein  YP_083958  decreased coverage  0.00607939  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2386  CDS  NC_006274  2522826  2523689  864  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  YP_083975  decreased coverage  0.00268022  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2430  CDS  NC_006274  2567318  2568448  1131  DNA polymerase III subunit beta  YP_084019  decreased coverage  8.41235e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2437  CDS  NC_006274  2574730  2575101  372  group-specific protein  YP_084026  decreased coverage  0.00345913  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2465  CDS  NC_006274  2601344  2602321  978  hypothetical protein  YP_084054  decreased coverage  1.08785e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2479  CDS  NC_006274  2614926  2615423  498  acetyltransferase  YP_084068  decreased coverage  0.000166388  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2484  CDS  NC_006274  2618803  2619135  333  hypothetical protein  YP_084073  decreased coverage  0.0035501  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2497  CDS  NC_006274  2629128  2629670  543  acetyltransferase  YP_084086  decreased coverage  0.000399882  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2512  CDS  NC_006274  2641268  2641516  249  hypothetical protein  YP_084101  decreased coverage  0.000980993  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2519  CDS  NC_006274  2647236  2647922  687  RNA polymerase factor sigma-70  YP_084108  decreased coverage  9.06034e-05  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>