238 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BAS0001  CDS  NC_005945  408  1748  1341  chromosomal replication initiation protein  YP_026292  decreased coverage  2.44098e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0016  CDS  NC_005945  21870  22421  552  hypothetical protein  YP_026304  decreased coverage  3.80571e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0060  CDS  NC_005945  63783  64265  483  hypothetical protein  YP_026347  decreased coverage  2.01317e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0143  CDS  NC_005945  139150  139587  438  50S ribosomal protein L13  YP_026429  decreased coverage  1.63354e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0183  CDS  NC_005945  183179  184429  1251  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  YP_026468  decreased coverage  2.44367e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0326  CDS  NC_005945  350748  352169  1422  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_026606  decreased coverage  0.000241995  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0335  CDS  NC_005945  361090  362106  1017  iron compound ABC transporter permease  YP_026615  decreased coverage  1.96235e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0379  CDS  NC_005945  410897  412180  1284  hypothetical protein  YP_026659  decreased coverage  2.1693e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0388  CDS  NC_005945  419884  420675  792  tellurium resistance protein  YP_026668  decreased coverage  3.90174e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0547  CDS  NC_005945  587121  588467  1347  citrate cation symporter family protein  YP_026825  decreased coverage  0.000864872  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0569  CDS  NC_005945  616319  616840  522  putative lipoprotein  YP_026846  decreased coverage  0.000903334  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0643  CDS  NC_005945  695040  695891  852  phospholipase C  YP_026920  decreased coverage  2.32146e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0656  CDS  NC_005945  707725  709026  1302  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  YP_026933  decreased coverage  3.75025e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0658  CDS  NC_005945  710919  712466  1548  hypothetical protein  YP_026935  decreased coverage  0.000101222  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0659  CDS  NC_005945  712648  714039  1392  amino acid permease family protein  YP_026936  decreased coverage  0.000492464  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0689  CDS  NC_005945  750226  750558  333  hypothetical protein  YP_026965  decreased coverage  0.000220428  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0703  CDS  NC_005945  761749  763416  1668  potassium-transporting ATPase subunit A  YP_026979  decreased coverage  0.000479775  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0711  CDS  NC_005945  770549  771850  1302  xanthine/uracil permease family protein  YP_026987  decreased coverage  0.000785311  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0718  CDS  NC_005945  776543  777919  1377  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  YP_026994  decreased coverage  1.27924e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0739  CDS  NC_005945  794501  795631  1131  metallo-beta-lactamase family protein  YP_027015  decreased coverage  0.000119995  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0772  CDS  NC_005945  824102  824383  282  hypothetical protein  YP_027048  decreased coverage  1.33286e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0791  CDS  NC_005945  840692  841147  456  acetyltransferase  YP_027067  decreased coverage  6.99744e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0812  CDS  NC_005945  863709  864506  798  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  YP_027088  decreased coverage  0.00534966  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0858  CDS  NC_005945  921953  923539  1587  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  YP_027134  decreased coverage  4.78589e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0916  CDS  NC_005945  979103  980836  1734  S-layer protein  YP_027191  decreased coverage  0.0018351  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0964  CDS  NC_005945  1020096  1020716  621  RNA polymerase factor sigma C  YP_027238  decreased coverage  3.60939e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0965  CDS  NC_005945  1020721  1021128  408  lineage-specific thermal regulator protein  YP_027239  decreased coverage  9.24855e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0966  CDS  NC_005945  1021136  1022386  1251  cell cycle protein FtsW  YP_027240  decreased coverage  1.40242e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0968  CDS  NC_005945  1022444  1022929  486  MarR family transcriptional regulator  YP_027241  decreased coverage  1.01536e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1001  CDS  NC_005945  1053083  1054504  1422  protoporphyrinogen oxidase  YP_027274  decreased coverage  9.15854e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1002  CDS  NC_005945  1054544  1055896  1353  hypothetical protein  YP_027275  decreased coverage  0.00204136  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1048  CDS  NC_005945  1101647  1102318  672  S-layer protein  YP_027320  decreased coverage  9.83689e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1119  CDS  NC_005945  1173550  1174188  639  hypothetical protein  YP_027391  decreased coverage  0.00142232  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1190  CDS  NC_005945  1234795  1236099  1305  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  YP_027460  decreased coverage  0.000208789  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1195  CDS  NC_005945  1239506  1239829  324  transcriptional regulator SinR  YP_027465  decreased coverage  0.00148794  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1199  CDS  NC_005945  1244540  1245535  996  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  YP_027469  decreased coverage  0.00119118  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1275  CDS  NC_005945  1312172  1312948  777  ABC transporter permease  YP_027544  decreased coverage  0.00493977  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1276  CDS  NC_005945  1313151  1314164  1014  AbrB family transcriptional regulator  YP_027545  decreased coverage  0.00251818  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1303  CDS  NC_005945  1337120  1337587  468  hypothetical protein  YP_027572  decreased coverage  2.10058e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1349  CDS  NC_005945  1380898  1381161  264  hypothetical protein  YP_027618  decreased coverage  2.76248e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1401  CDS  NC_005945  1430499  1431785  1287  glutamate dehydrogenase  YP_027670  decreased coverage  2.29011e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1408  CDS  NC_005945  1436607  1437755  1149  30S ribosomal protein S1  YP_027677  decreased coverage  1.02607e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1432  CDS  NC_005945  1458126  1458638  513  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  YP_027701  decreased coverage  0.00407482  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1439  CDS  NC_005945  1463349  1463990  642  uracil-DNA glycosylase family protein  YP_027708  decreased coverage  2.35617e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1478  CDS  NC_005945  1501173  1501388  216  hypothetical protein  YP_027747  decreased coverage  0.00049395  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1510  CDS  NC_005945  1543156  1543815  660  hypothetical protein  YP_027777  decreased coverage  0.00387825  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1573  CDS  NC_005945  1594334  1595293  960  hypothetical protein  YP_027840  decreased coverage  0.00424185  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1583  CDS  NC_005945  1608065  1608850  786  Slt family transglycosylase  YP_027850  decreased coverage  0.00492296  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1631  CDS  NC_005945  1648284  1649252  969  EamA family protein  YP_027897  decreased coverage  0.00303775  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1636  CDS  NC_005945  1653778  1655181  1404  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_027902  decreased coverage  0.00822114  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1647  CDS  NC_005945  1663234  1663947  714  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  YP_027913  decreased coverage  2.60345e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1654  CDS  NC_005945  1669356  1670603  1248  hypothetical protein  YP_027920  decreased coverage  9.22298e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1655  CDS  NC_005945  1670634  1671590  957  putative lipoprotein  YP_027921  decreased coverage  0.00476972  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1696  CDS  NC_005945  1715533  1716744  1212  fosmidomycin resistance protein  YP_027962  decreased coverage  0.00774427  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1754  CDS  NC_005945  1776936  1777607  672  deoxyribose-phosphate aldolase  YP_028018  decreased coverage  6.33467e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1759  CDS  NC_005945  1780963  1781193  231  hypothetical protein  YP_028023  decreased coverage  5.16404e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1765  CDS  NC_005945  1788011  1789705  1695  M24/M37 family peptidase  YP_028029  decreased coverage  1.30231e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1778  CDS  NC_005945  1803411  1804280  870  LysR family transcriptional regulator  YP_028042  decreased coverage  7.61412e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1787  CDS  NC_005945  1813159  1814193  1035  S-layer protein  YP_028051  decreased coverage  1.74638e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1812  CDS  NC_005945  1838277  1839539  1263  NLP/P60 family protein  YP_028076  decreased coverage  3.82267e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1834  CDS  NC_005945  1861560  1862381  822  polysaccharide deacetylase  YP_028098  decreased coverage  1.85073e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1903  CDS  NC_005945  1923169  1924110  942  magnesium transporter CorA family protein  YP_028167  decreased coverage  0.00149373  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1949  CDS  NC_005945  1959376  1959564  189  hypothetical protein  YP_028212  decreased coverage  0.00294896  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2031  CDS  NC_005945  2039514  2040812  1299  aspartyl-tRNA synthetase  YP_028294  decreased coverage  1.22417e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2096  CDS  NC_005945  2101500  2101859  360  acetyltransferase  YP_028359  decreased coverage  2.90118e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2097  CDS  NC_005945  2101908  2102237  330  hypothetical protein  YP_028360  decreased coverage  1.47393e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2098  CDS  NC_005945  2102331  2102525  195  hypothetical protein  YP_028361  decreased coverage  5.64933e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2157  CDS  NC_005945  2155122  2155484  363  hypothetical protein  YP_028418  decreased coverage  0.00218836  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2159  CDS  NC_005945  2156147  2157409  1263  hypothetical protein  YP_028420  decreased coverage  0.00661833  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2201  CDS  NC_005945  2198986  2199285  300  ArsR family transcriptional regulator  YP_028462  decreased coverage  0.00183018  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2216  CDS  NC_005945  2218707  2219900  1194  alkaline serine protease  YP_028477  decreased coverage  0.00115327  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2247  CDS  NC_005945  2248485  2249411  927  acetyltransferase  YP_028508  decreased coverage  0.0012519  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2257  CDS  NC_005945  2257082  2257285  204  cold shock protein CspA  YP_028518  decreased coverage  6.81816e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2308  CDS  NC_005945  2310579  2311289  711  hypothetical protein  YP_028569  decreased coverage  1.1894e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2314  CDS  NC_005945  2316430  2317170  741  hypothetical protein  YP_028575  decreased coverage  0.00196824  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2345  CDS  NC_005945  2345513  2345671  159  putative lipoprotein  YP_028606  decreased coverage  0.00251325  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2413  CDS  NC_005945  2412689  2413318  630  hypothetical protein  YP_028673  decreased coverage  0.00295431  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2414  CDS  NC_005945  2413592  2414797  1206  Mur ligase family protein  YP_028674  decreased coverage  0.00339863  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2442  CDS  NC_005945  2441496  2441684  189  hypothetical protein  YP_028702  decreased coverage  1.84646e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2443  CDS  NC_005945  2441811  2442227  417  hypothetical protein  YP_028703  decreased coverage  7.37818e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2461  CDS  NC_005945  2460226  2461926  1701  ABC transporter ATP-binding protein  YP_028721  decreased coverage  0.000483746  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2467  CDS  NC_005945  2467427  2469565  2139  penicillin-binding protein  YP_028727  decreased coverage  0.00794581  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2468  CDS  NC_005945  2470100  2471338  1239  permease  YP_028728  decreased coverage  0.000564968  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2473  CDS  NC_005945  2474902  2475474  573  thiJ/pfpI family protein  YP_028733  decreased coverage  0.00161724  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2482  CDS  NC_005945  2485162  2485860  699  hypothetical protein  YP_028742  decreased coverage  0.00158475  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2499  CDS  NC_005945  2499945  2501075  1131  DNA polymerase III subunit beta  YP_028759  decreased coverage  0.000103767  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2503  CDS  NC_005945  2503607  2504569  963  hypothetical protein  YP_028763  decreased coverage  0.00407253  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2507  CDS  NC_005945  2508276  2509091  816  hypothetical protein  YP_028767  decreased coverage  0.000307283  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2508  CDS  NC_005945  2509170  2509664  495  hypothetical protein  YP_028768  decreased coverage  8.91138e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2543  CDS  NC_005945  2544660  2546363  1704  neutral protease  YP_028803  decreased coverage  1.6311e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2555  CDS  NC_005945  2557549  2557953  405  hypothetical protein  YP_028814  decreased coverage  3.63282e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2561  CDS  NC_005945  2561288  2562628  1341  hypothetical protein  YP_028820  decreased coverage  0.000903794  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2562  CDS  NC_005945  2562644  2563405  762  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  YP_028821  decreased coverage  0.00268297  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2577  CDS  NC_005945  2573874  2574416  543  acetyltransferase  YP_028836  decreased coverage  2.95975e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2578  CDS  NC_005945  2574429  2575199  771  DeoR family transcriptional regulator  YP_028837  decreased coverage  4.22866e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2595  CDS  NC_005945  2587646  2588470  825  hypothetical protein  YP_028854  decreased coverage  0.00208063  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2617  CDS  NC_005945  2604497  2604874  378  hypothetical protein  YP_028876  decreased coverage  0.00587583  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2624  CDS  NC_005945  2610677  2611543  867  CAAX amino terminal protease family protein  YP_028883  decreased coverage  3.61529e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2663  CDS  NC_005945  2648562  2648825  264  hypothetical protein  YP_028922  decreased coverage  0.000945109  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2670  CDS  NC_005945  2654463  2654879  417  hypothetical protein  YP_028928  decreased coverage  0.00225187  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>