124 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CNA00020  CDS  NC_006670  6520  8278  1759  expressed protein  XP_566435  decreased coverage  0.00164795  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00050  CDS  NC_006670  16393  20462  4070  cell cycle arrest in response to pheromone-related protein, putative  XP_566438  decreased coverage  0.00713629  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00060  CDS  NC_006670  20600  22794  2195  methionine-tRNA ligase, putative  XP_566439  decreased coverage  0.000329548  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00190  CDS  NC_006670  57717  59788  2072  aminotransferase, putative  XP_566451  decreased coverage  0.00967249  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00900  CDS  NC_006670  251842  254770  2929  ATP dependent DNA helicase, putative  XP_566517  decreased coverage  0.000271511  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00920  CDS  NC_006670  257594  258539  946  hypothetical protein  XP_566519  decreased coverage  0.0028047  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA02150  CDS  NC_006670  567924  569580  1657  expressed protein  XP_566600  decreased coverage  0.0040378  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA02400  CDS  NC_006670  628241  630385  2145  conserved hypothetical protein  XP_567252  decreased coverage  0.00957306  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA02420  CDS  NC_006670  632814  635958  3145  rsec15, putative  XP_566633  decreased coverage  0.000851251  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA03170  CDS  NC_006670  836319  838137  1819  conserved hypothetical protein  XP_566758  decreased coverage  0.00254863  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA03500  CDS  NC_006670  907725  910387  2663  beta-catenin, putative  XP_566686  decreased coverage  0.00903794  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA03560  CDS  NC_006670  920683  925951  5269  conserved hypothetical protein  XP_566696  decreased coverage  0.00609757  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA04100  CDS  NC_006670  1100719  1102605  1887  choline-phosphate cytidylyltransferase, putative  XP_566767  decreased coverage  0.00623495  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA04770  CDS  NC_006670  1267204  1270455  3252  phosphoprotein phosphatase, putative  XP_566871  decreased coverage  0.00163033  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA04970  CDS  NC_006670  1314679  1316223  1545  mannitol dehydrogenase, putative  XP_566937  decreased coverage  0.00825992  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA05020  CDS  NC_006670  1326893  1332762  5870  hypothetical protein  XP_566788  decreased coverage  0.00970662  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA06000  CDS  NC_006670  1601011  1608493  7483  aspartate carbamoyltransferase, putative  XP_566954  decreased coverage  0.00636164  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA07490  CDS  NC_006670  2052715  2053562  848  ribosomal protein L35, putative  XP_567099  decreased coverage  0.0097389  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA08110  CDS  NC_006670  2231989  2233226  1238  D-hydroxyacid dehydrogenase, putative  XP_567190  decreased coverage  0.00184163  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA08140  CDS  NC_006670  2240826  2243762  2937  expressed protein  XP_567193  decreased coverage  0.00872968  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA08160  CDS  NC_006670  2245055  2246256  1202  mitochondrion protein, putative  XP_567195  decreased coverage  0.00756175  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA08250  CDS  NC_006670  2265720  2269450  3731  hypothetical protein  XP_567067  decreased coverage  0.00319789  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00030  CDS  NC_006684  4868  6210  1343  uroporphyrinogen decarboxylase, putative  XP_568749  decreased coverage  0.000569927  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00080  CDS  NC_006684  19759  23789  4031  exonuclease, putative  XP_568754  decreased coverage  0.008122  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00120  CDS  NC_006684  34177  36659  2483  heat shock transcription factor 2, putative  XP_568758  decreased coverage  0.000900604  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00200  CDS  NC_006684  61483  61903  421  pre-mRNA splicing factor, putative  XP_568761  decreased coverage  0.000299914  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00210  CDS  NC_006684  62224  64099  1876  serine/threonine kinase receptor associated protein, putative  XP_568762  decreased coverage  0.00228942  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00230  CDS  NC_006684  67914  70117  2204  expressed protein  XP_568764  decreased coverage  0.00399187  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00260  CDS  NC_006684  74295  77432  3138  ER to Golgi transport-related protein, putative  XP_568767  decreased coverage  0.00276078  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00270  CDS  NC_006684  77609  79104  1496  nuclear pore protein seh1, putative  XP_568769  decreased coverage  7.74214e-05  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00290  CDS  NC_006684  79756  81237  1482  expressed protein  XP_568770  decreased coverage  2.23097e-05  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00300  CDS  NC_006684  81692  83731  2040  fructose-bisphosphate aldolase, putative  XP_568771  decreased coverage  4.41241e-07  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00310  CDS  NC_006684  84020  88848  4829  gamma DNA-directed DNA polymerase, putative  XP_568772  decreased coverage  2.081e-05  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00340  CDS  NC_006684  92464  95787  3324  conserved hypothetical protein  XP_568775  decreased coverage  0.00258209  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00750  CDS  NC_006684  218315  220597  2283  hypothetical protein  XP_569084  decreased coverage  0.00877381  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB02360  CDS  NC_006684  682197  683090  894  ribosomal L10 protein, putative  XP_569162  decreased coverage  0.00987477  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB02600  CDS  NC_006684  763806  764837  1032  integral to membrane protein, putative  XP_569182  decreased coverage  0.00565695  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB03110  CDS  NC_006684  937394  940539  3146  hypothetical protein  XP_568888  decreased coverage  0.00148463  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB03120  CDS  NC_006684  940617  944112  3496  phosphatidylinositol 3-kinase, putative  XP_568889  decreased coverage  0.000801704  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB03400  CDS  NC_006684  1023278  1026866  3589  hypothetical protein  XP_568915  decreased coverage  0.0021041  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB03410  CDS  NC_006684  1026962  1027863  902  hypothetical protein  XP_569024  decreased coverage  0.000245472  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB03430  CDS  NC_006684  1030793  1032018  1226  SAR small monomeric GTPase, putative  XP_568917  decreased coverage  0.000269904  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB03440  CDS  NC_006684  1032209  1034324  2116  conserved hypothetical protein  XP_568918  decreased coverage  0.00118084  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB03450  CDS  NC_006684  1034300  1035718  1419  conserved hypothetical protein  XP_568920  decreased coverage  0.00275256  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB04090  CDS  NC_006684  1202474  1204543  2070  isocitrate dehydrogenase (NADP+), putative  XP_569233  decreased coverage  0.00968554  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB04500  CDS  NC_006684  1294735  1295445  711  hypothetical protein  XP_568945  decreased coverage  0.000303386  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB04540  CDS  NC_006684  1301901  1303763  1863  expressed protein  XP_568948  decreased coverage  0.00834951  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB04580  CDS  NC_006684  1311868  1312788  921  structural molecule, putative  XP_568950  decreased coverage  0.0037592  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05190  CDS  NC_006684  1476834  1477232  399  hypothetical protein  XP_569267  decreased coverage  0.00717621  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05370  CDS  NC_006684  1519401  1520279  879  expressed protein  XP_569281  decreased coverage  0.000880749  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05430  CDS  NC_006684  1529519  1532167  2649  expressed protein  XP_569288  decreased coverage  0.000548098  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05440  CDS  NC_006684  1532276  1534037  1762  hypothetical protein  XP_569289  decreased coverage  0.00204692  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05480  CDS  NC_006684  1542415  1543724  1310  conserved hypothetical protein  XP_569291  decreased coverage  0.000473551  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05530  CDS  NC_006684  1553586  1557293  3708  exonuclease, putative  XP_569296  decreased coverage  0.00532116  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05590  CDS  NC_006684  1571661  1573156  1496  hypothetical protein  XP_569302  decreased coverage  0.00949399  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05600  CDS  NC_006684  1574729  1575968  1240  dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase, putative  XP_569303  decreased coverage  0.00648323  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05680  CDS  NC_006684  1595127  1596076  950  coatomer zeta subunit (zeta-coat protein), putative  XP_569309  decreased coverage  0.00188933  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB05740  CDS  NC_006684  1609152  1612047  2896  conserved hypothetical protein  XP_569315  decreased coverage  0.00996322  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00720  CDS  NC_006685  205111  209504  4394  conserved hypothetical protein  XP_569954  decreased coverage  0.00839319  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00970  CDS  NC_006685  288224  289428  1205  conserved hypothetical protein  XP_569414  decreased coverage  0.00651288  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC01800  CDS  NC_006685  492461  494175  1715  conserved hypothetical protein  XP_569533  decreased coverage  0.00595341  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC03330  CDS  NC_006685  1054441  1059301  4861  conserved hypothetical protein  XP_569992  decreased coverage  0.00201155  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC04420  CDS  NC_006685  1340038  1341850  1813  argininosuccinate lyase, putative  XP_569694  decreased coverage  0.000251148  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC06660  CDS  NC_006685  1942067  1944176  2110  conserved hypothetical protein  XP_569948  decreased coverage  0.000684608  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC07080  CDS  NC_006685  2073249  2075189  1941  hypothetical protein  XP_569833  decreased coverage  0.000492685  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00930  CDS  NC_006686  287725  288340  616  hypothetical protein  XP_570318  decreased coverage  0.00736637  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND04530  CDS  NC_006686  1244986  1248625  3640  hypothetical protein  XP_570104  decreased coverage  0.008171  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND05350  CDS  NC_006686  1461931  1464738  2808  hypothetical protein  XP_570149  decreased coverage  0.00211799  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND05540  CDS  NC_006686  1499471  1501391  1921  negative regulation of transcription from Pol III promoter-related protein, putative  XP_570140  decreased coverage  0.000253774  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE01920  CDS  NC_006687  516960  518287  1328  conserved hypothetical protein  XP_570826  decreased coverage  0.00584688  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE02990    NC_006687  810264  815174  4911      decreased coverage  0.000623592  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE03000    NC_006687  817251  823712  6462      decreased coverage  0.00372907  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE04600  CDS  NC_006687  1287892  1290258  2367  leukotriene-A4 hydrolase, putative  XP_571153  decreased coverage  0.0099794  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE04990  CDS  NC_006687  1389668  1392050  2383  triose phosphate/3-phosphoglycerate/phosphate translocator, putative  XP_571024  decreased coverage  0.000562297  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE05020  CDS  NC_006687  1394868  1395494  627  hypothetical protein  XP_571030  decreased coverage  0.000817979  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00240  CDS  NC_006691  79924  81365  1442  expressed protein  XP_571295  decreased coverage  0.00356988  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00470  CDS  NC_006691  168487  169387  901  hypothetical protein  XP_571476  decreased coverage  0.000959419  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00550  CDS  NC_006691  186801  187775  975  tRNA specific adenosine deaminase, putative  XP_571237  decreased coverage  0.00012286  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF04460  CDS  NC_006691  1293460  1295784  2325  conserved hypothetical protein  XP_571716  decreased coverage  0.00447085  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNG00820  CDS  NC_006692  230056  230623  568  hypothetical protein  XP_571812  decreased coverage  0.00485497  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNG01320  CDS  NC_006692  380142  381042  901  hypothetical protein  XP_571818  decreased coverage  0.00619583  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNG03030  CDS  NC_006692  840071  841283  1213  S-adenosylmethionine transporter, putative  XP_571998  decreased coverage  0.00663793  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNG03360  CDS  NC_006692  947706  948801  1096  conserved hypothetical protein  XP_572065  decreased coverage  0.00487139  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNG04310  CDS  NC_006692  1217350  1221104  3755  UDP-glucose,sterol transferase  XP_572103  decreased coverage  0.000406767  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNG04320  CDS  NC_006692  1223510  1225475  1966  NAD-dependent histone deacetylase, putative  XP_572104  decreased coverage  0.00681381  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNG04350  CDS  NC_006692  1228762  1231260  2499  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  XP_572110  decreased coverage  0.00329151  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNH01270  CDS  NC_006693  821355  822878  1524  cytoplasm protein, putative  XP_572317  decreased coverage  9.80241e-06  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNH03650  CDS  NC_006693  62784  63455  672  hypothetical protein  XP_572527  decreased coverage  6.91871e-05  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNH03770  CDS  NC_006693  29944  32611  2668  expressed protein  XP_572537  decreased coverage  0.000218596  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI02090  CDS  NC_006694  575571  579503  3933  f-box protein pof6, putative  XP_572980  decreased coverage  0.00765046  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI02410  CDS  NC_006694  662891  664534  1644  Short chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, putative  XP_572875  decreased coverage  0.00642638  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI03190  CDS  NC_006694  866364  867074  711  hypothetical protein  XP_572635  decreased coverage  0.00762337  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI03990  CDS  NC_006694  1067494  1068857  1364  hypothetical protein  XP_572616  decreased coverage  0.00555332  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI04290  CDS  NC_006694  1143289  1145156  1868  protein kinase, putative  XP_572942  decreased coverage  0.0054946  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNJ00040  CDS  NC_006679  8922  9064  143  hypothetical protein  XP_567262  decreased coverage  0.00418057  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNJ00100  CDS  NC_006679  20980  25202  4223  hypothetical protein  XP_567268  decreased coverage  0.00491438  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNJ01010  CDS  NC_006679  293393  294013  621  hypothetical protein  XP_567480  decreased coverage  0.00736637  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNJ01270  CDS  NC_006679  357952  361912  3961  conserved hypothetical protein  XP_567505  decreased coverage  0.00191487  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNJ01280  CDS  NC_006679  362114  362936  823  cytoplasm protein, putative  XP_567506  decreased coverage  1.47189e-05  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNJ01300  CDS  NC_006679  365236  367803  2568  conserved hypothetical protein  XP_567508  decreased coverage  0.00232907  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>