4268 genes were found for organism Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Shewana3_0001  CDS  NC_008577  39  659  621  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_867652  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0002  CDS  NC_008577  777  2666  1890  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_867653  normal  0.72668  hitchhiker  2.25691e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0003  CDS  NC_008577  3107  3547  441  flavodoxin  YP_867654  normal  0.664218  hitchhiker  1.19397e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0004  CDS  NC_008577  3725  5272  1548  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  YP_867655  normal  hitchhiker  9.9426e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0005  CDS  NC_008577  5376  6737  1362  tRNA modification GTPase TrmE  YP_867656  normal  0.135343  hitchhiker  1.4804e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0006  CDS  NC_008577  6841  8466  1626  protein translocase subunit yidC  YP_867657  hitchhiker  1.01193e-05  unclonable  8.73101e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0007  CDS  NC_008577  8470  8724  255  hypothetical protein  YP_867658  unclonable  2.25175e-09  unclonable  3.48643e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0008  CDS  NC_008577  8691  9047  357  ribonuclease P  YP_867659  unclonable  4.50646e-09  unclonable  3.97397e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0009  CDS  NC_008577  9651  11033  1383  chromosomal replication initiation protein  YP_867660  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0010  CDS  NC_008577  11054  12154  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_867661  unclonable  6.42144e-08  hitchhiker  1.34313e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0011  CDS  NC_008577  12317  13399  1083  recombination protein F  YP_867662  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  1.41072e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0012  CDS  NC_008577  13416  15833  2418  DNA gyrase subunit B  YP_867663  normal  hitchhiker  2.57607e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0013  CDS  NC_008577  15916  16572  657  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_867664  normal  hitchhiker  9.75013e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0014  CDS  NC_008577  16699  17547  849  transcriptional regulator  YP_867665  normal  hitchhiker  1.22814e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0015  CDS  NC_008577  17706  18749  1044  putative signal transduction protein  YP_867666  normal  hitchhiker  1.89797e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0016  CDS  NC_008577  18813  20879  2067  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_867667  normal  hitchhiker  3.27788e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0017  CDS  NC_008577  20889  21794  906  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_867668  normal  hitchhiker  1.87933e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0018  CDS  NC_008577  21913  22488  576  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_867669  normal  hitchhiker  1.68083e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0019  CDS  NC_008577  22574  25762  3189  amidohydrolase  YP_867670  normal  hitchhiker  9.34915e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0020  CDS  NC_008577  25944  26381  438  MOSC domain-containing protein  YP_867671  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0021  CDS  NC_008577  26417  26662  246  sulfur transfer protein SirA  YP_867672  normal  0.628095  hitchhiker  1.7124e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0022  CDS  NC_008577  26815  28026  1212  diguanylate cyclase  YP_867673  normal  0.585928  hitchhiker  3.15771e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0023  CDS  NC_008577  28251  29414  1164  3-ketoacyl-CoA thiolase  YP_867674  normal  0.188213  hitchhiker  2.93236e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0024  CDS  NC_008577  29437  31587  2151  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  YP_867675  hitchhiker  0.00830663  hitchhiker  4.74346e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0025  CDS  NC_008577  32031  33350  1320  proline dipeptidase  YP_867676  normal  0.0142597  hitchhiker  4.09434e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0026  CDS  NC_008577  33366  33980  615  hypothetical protein  YP_867677  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0027  CDS  NC_008577  34058  35515  1458  TrkH family potassium uptake protein  YP_867678  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0028  CDS  NC_008577  35517  36041  525  protoporphyrinogen oxidase  YP_867679  hitchhiker  7.80551e-05  hitchhiker  1.45429e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0029  CDS  NC_008577  36096  36404  309  ArsR family transcriptional regulator  YP_867680  hitchhiker  4.81298e-05  hitchhiker  7.45632e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0030  CDS  NC_008577  36603  37157  555  protoporphyrinogen oxidase  YP_867681  decreased coverage  2.5966e-05  hitchhiker  9.9426e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0031  CDS  NC_008577  37204  38646  1443  TrkH family potassium uptake protein  YP_867682  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  1.65872e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0032  CDS  NC_008577  38658  40067  1410  potassium transporter peripheral membrane component  YP_867683  normal  0.21174  hitchhiker  6.89203e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0033  CDS  NC_008577  40083  41372  1290  sun protein  YP_867684  normal  0.709945  hitchhiker  6.40703e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0034  CDS  NC_008577  41372  42328  957  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_867685  normal  hitchhiker  2.57015e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0035  CDS  NC_008577  42344  42850  507  peptide deformylase  YP_867686  normal  hitchhiker  1.96537e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0036  CDS  NC_008577  42976  44100  1125  peptidoglycan-binding LysM  YP_867687  normal  hitchhiker  2.43599e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0037  CDS  NC_008577  44184  45200  1017  DNA protecting protein DprA  YP_867688  normal  hitchhiker  6.15281e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0038  CDS  NC_008577  45203  45679  477  hypothetical protein  YP_867689  normal  0.272353  hitchhiker  4.78432e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0039  CDS  NC_008577  45802  46365  564  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  YP_867690  normal  0.125507  hitchhiker  5.14659e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0040  CDS  NC_008577  46495  47061  567  translation factor SUA5  YP_867691  normal  0.123848  hitchhiker  4.48294e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0041  CDS  NC_008577  47091  47999  909  coproporphyrinogen III oxidase  YP_867692  normal  0.0219573  hitchhiker  5.53459e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0042  CDS  NC_008577  48030  48467  438  globin  YP_867693  normal  0.0182573  hitchhiker  8.60997e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0043  CDS  NC_008577  48638  49516  879  shikimate 5-dehydrogenase  YP_867694  hitchhiker  0.000585691  hitchhiker  1.2855e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0044  CDS  NC_008577  49537  49812  276  hypothetical protein  YP_867695  hitchhiker  1.93062e-05  hitchhiker  1.02958e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0045  CDS  NC_008577  49888  50436  549  carbonic anhydrase  YP_867696  hitchhiker  1.41842e-07  hitchhiker  1.0839e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0046  CDS  NC_008577  56354  56608  255  hypothetical protein  YP_867697  normal  hitchhiker  7.39222e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0047  CDS  NC_008577  56630  57085  456  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_867698  normal  hitchhiker  8.83142e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0048  CDS  NC_008577  57060  57815  756  protein of unknown function DUF610, YibQ  YP_867699  normal  hitchhiker  1.02958e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0049  CDS  NC_008577  57828  59033  1206  C-terminal processing peptidase-3  YP_867700  normal  hitchhiker  1.24234e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0050  CDS  NC_008577  59082  60215  1134  peptidase M23B  YP_867701  normal  hitchhiker  1.46051e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0051  CDS  NC_008577  60226  61770  1545  phosphoglyceromutase  YP_867702  normal  hitchhiker  1.85111e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0052  CDS  NC_008577  61994  62470  477  rhodanese domain-containing protein  YP_867703  normal  hitchhiker  1.03873e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0053  CDS  NC_008577  62731  63216  486  preprotein translocase subunit SecB  YP_867704  normal  hitchhiker  1.17006e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0054  CDS  NC_008577  63221  64237  1017  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_867705  normal  hitchhiker  1.41221e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0055  CDS  NC_008577  64476  65660  1185  hypothetical protein  YP_867706  normal  hitchhiker  1.53695e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0056  CDS  NC_008577  66383  67246  864  hypothetical protein  YP_867707  normal  hitchhiker  1.86467e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0057  CDS  NC_008577  67824  69185  1362  TrkH family potassium uptake protein  YP_867708  normal  hitchhiker  2.78373e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0058  CDS  NC_008577  69187  69885  699  TrkA domain-containing protein  YP_867709  normal  hitchhiker  1.70567e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0059  CDS  NC_008577  69930  70619  690  two component transcriptional regulator  YP_867710  normal  hitchhiker  1.52099e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0060  CDS  NC_008577  70620  71666  1047  ATPase domain-containing protein  YP_867711  normal  hitchhiker  2.13269e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0061  CDS  NC_008577  71895  72821  927  pirin domain-containing protein  YP_867712  normal  hitchhiker  2.22873e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0062  CDS  NC_008577  72956  73693  738  hypothetical protein  YP_867713  normal  hitchhiker  1.8824e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0063  CDS  NC_008577  73793  74272  480  NLP/P60 protein  YP_867714  normal  hitchhiker  1.56196e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0064  CDS  NC_008577  74297  75745  1449  major facilitator transporter  YP_867715  normal  hitchhiker  2.92111e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0065  CDS  NC_008577  75834  76862  1029  LacI family transcription regulator  YP_867716  normal  hitchhiker  1.94735e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0066  CDS  NC_008577  76921  78405  1485  sucrose phosphorylase  YP_867717  normal  hitchhiker  2.18626e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0067  CDS  NC_008577  78662  79882  1221  major facilitator transporter  YP_867718  normal  0.700351  unclonable  8.55622e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0068  CDS  NC_008577  80143  82539  2397  TonB-dependent receptor  YP_867719  unclonable  1.21546e-05  unclonable  2.40632e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0069  CDS  NC_008577  82632  83591  960  ribokinase-like domain-containing protein  YP_867720  normal  0.615124  hitchhiker  2.96005e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0070  CDS  NC_008577  83797  84330  534  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_867721  normal  0.815252  hitchhiker  1.95097e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0071  CDS  NC_008577  84364  84582  219  hypothetical protein  YP_867722  normal  hitchhiker  9.9426e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0072  CDS  NC_008577  84734  85777  1044  transcriptional regulator  YP_867723  normal  hitchhiker  1.58985e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0073  CDS  NC_008577  85781  86041  261  hypothetical protein  YP_867724  normal  hitchhiker  5.35971e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0074  CDS  NC_008577  86091  87230  1140  transport protein, putative  YP_867725  normal  hitchhiker  3.31098e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0075  CDS  NC_008577  87319  88053  735  ABC transporter related  YP_867726  normal  hitchhiker  2.73343e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0076  CDS  NC_008577  88057  89676  1620  TAP domain-containing protein  YP_867727  normal  hitchhiker  4.58817e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0077  CDS  NC_008577  89769  90134  366  GntR family transcriptional regulator  YP_867728  normal  hitchhiker  0.000256514  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0078  CDS  NC_008577  90181  91044  864  ABC transporter related  YP_867729  normal  hitchhiker  0.000932983  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0079  CDS  NC_008577  91041  92351  1311  hypothetical protein  YP_867730  normal  hitchhiker  0.00295361  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0080  CDS  NC_008577  92480  94273  1794  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_867731  normal  normal  0.0335816  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0081  CDS  NC_008577  94414  96903  2490  MORN repeat-containing protein  YP_867732  normal  normal  0.0420783  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0082  CDS  NC_008577  97011  97421  411  thioesterase superfamily protein  YP_867733  normal  normal  0.691992  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0083  CDS  NC_008577  97540  98088  549  HPP family protein  YP_867734  normal  normal  0.687562  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0084  CDS  NC_008577  98109  98372  264  hypothetical protein  YP_867735  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0085  CDS  NC_008577  98432  98896  465  thioesterase superfamily protein  YP_867736  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0086  CDS  NC_008577  99057  99410  354  MerR family transcriptional regulator  YP_867737  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0087  CDS  NC_008577  99482  100060  579  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  YP_867738  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0088  CDS  NC_008577  100076  100471  396  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  YP_867739  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0089  CDS  NC_008577  100534  101214  681  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  YP_867740  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0090  CDS  NC_008577  101578  102012  435  hypothetical protein  YP_867741  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0091  CDS  NC_008577  102105  103118  1014  hypothetical protein  YP_867742  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0092  CDS  NC_008577  103361  104164  804  integrase catalytic subunit  YP_867743  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0093  CDS  NC_008577  104194  104589  396  transposase  YP_867744  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0094  CDS  NC_008577  104633  105280  648  hypothetical protein  YP_867745  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0095  CDS  NC_008577  105371  107278  1908  hypothetical protein  YP_867746  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0096  CDS  NC_008577  107548  107976  429  MarR family transcriptional regulator  YP_867747  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0097  CDS  NC_008577  108012  108758  747  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  YP_867748  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0098  CDS  NC_008577  109462  110688  1227  imidazolonepropionase  YP_867749  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0099  CDS  NC_008577  110886  111593  708  histidine utilization repressor  YP_867750  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_0100  CDS  NC_008577  111717  113387  1671  urocanate hydratase  YP_867751  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>