251 genes were found for organism Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Shewana3_4140  CDS  NC_008573  278592  885  1236  hypothetical protein  YP_863656  normal  0.813287  normal  0.597426  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4141  CDS  NC_008573  1030  1248  219  putative transposase  YP_863657  normal  0.67819  normal  0.487019  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4142  CDS  NC_008573  1491  2471  981  IS4 family transposase  YP_863658  normal  normal  0.282209  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4143  CDS  NC_008573  2555  2836  282  hypothetical protein  YP_863659  normal  normal  0.256309  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4144  CDS  NC_008573  2880  3239  360  plastocyanin domain-containing protein  YP_863660  normal  0.9179  normal  0.258983  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4145  CDS  NC_008573  3276  5612  2337  copper-translocating P-type ATPase  YP_863661  normal  0.418825  normal  0.147287  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4146  CDS  NC_008573  5788  6504  717  GntR family transcriptional regulator  YP_863662  normal  0.994574  normal  0.105944  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4147  CDS  NC_008573  6556  7779  1224  outer membrane porin  YP_863663  normal  normal  0.17719  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4148  CDS  NC_008573  8181  8582  402  hypothetical protein  YP_863664  normal  normal  0.144769  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4149  CDS  NC_008573  10342  11445  1104  IS605 family transposase OrfB  YP_863665  normal  normal  0.247919  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4150  CDS  NC_008573  11576  11842  267  hypothetical protein  YP_863666  normal  normal  0.199425  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4151  CDS  NC_008573  12218  12505  288  hypothetical protein  YP_863667  normal  normal  0.2049  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4152  CDS  NC_008573  12547  12888  342  lipoprotein signal peptidase-like protein  YP_863668  normal  normal  0.202689  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4153  CDS  NC_008573  12893  13294  402  nitrogen regulatory protein P-II  YP_863669  normal  normal  0.312763  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4154  CDS  NC_008573  13291  16431  3141  CzcA family heavy metal efflux protein  YP_863670  normal  normal  0.36883  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4155  CDS  NC_008573  16506  17447  942  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_863671  normal  normal  0.259995  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4156  CDS  NC_008573  17444  18784  1341  outer membrane efflux protein  YP_863672  normal  normal  0.283296  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4157  CDS  NC_008573  19416  20315  900  Co/Zn/Cd efflux system component  YP_863673  normal  normal  0.162332  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4158  CDS  NC_008573  20393  20800  408  MerR family transcriptional regulator  YP_863674  normal  normal  0.144769  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4159  CDS  NC_008573  21137  21307  171  putative transposase  YP_863675  normal  normal  0.137992  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4160  CDS  NC_008573  21935  22345  411  S-adenosylhomocysteine hydrolase  YP_863676  normal  normal  0.142981  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4161  CDS  NC_008573  22342  23283  942  hypothetical protein  YP_863677  normal  normal  0.162977  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4162  CDS  NC_008573  23291  25915  2625  type I restriction-modification system, M subunit  YP_863678  normal  normal  0.235487  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4163  CDS  NC_008573  25917  27134  1218  restriction modification system DNA specificity subunit  YP_863679  normal  0.864984  normal  0.0584456  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4164  CDS  NC_008573  27306  30536  3231  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  YP_863680  normal  normal  0.0160364  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4165  CDS  NC_008573  30965  31375  411  hypothetical protein  YP_863681  normal  decreased coverage  0.00650831  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4166  CDS  NC_008573  31405  32007  603  hypothetical protein  YP_863682  normal  normal  0.0154822  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4167  CDS  NC_008573  32102  32974  873  DNA replication terminus site-binding protein  YP_863683  normal  normal  0.0175773  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4168  CDS  NC_008573  33318  34007  690  hypothetical protein  YP_863684  normal  normal  0.0186772  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4169  CDS  NC_008573  34151  35299  1149  hypothetical protein  YP_863685  normal  normal  0.0380533  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4170  CDS  NC_008573  35699  36355  657  hypothetical protein  YP_863686  normal  normal  0.0600778  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4171  CDS  NC_008573  36438  37784  1347  hypothetical protein  YP_863687  normal  normal  0.0721626  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4172  CDS  NC_008573  38365  39615  1251  DNA-directed DNA polymerase  YP_863688  normal  normal  0.06239  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4173  CDS  NC_008573  39612  40346  735  putative prophage repressor  YP_863689  normal  normal  0.0524637  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4174  CDS  NC_008573  40552  40911  360  hypothetical protein  YP_863690  normal  normal  0.0253482  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4175  CDS  NC_008573  41152  42258  1107  hypothetical protein  YP_863691  normal  0.171542  normal  0.0532237  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4176  CDS  NC_008573  42673  43521  849  hypothetical protein  YP_863692  normal  0.229359  normal  0.0939497  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4177  CDS  NC_008573  43496  44170  675  CBS domain-containing protein  YP_863693  normal  0.0451458  normal  0.0529538  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4178  CDS  NC_008573  44721  45335  615  hypothetical protein  YP_863694  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4179  CDS  NC_008573  45611  46507  897  hypothetical protein  YP_863695  normal  0.156402  normal  0.249624  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4180  CDS  NC_008573  46518  47165  648  hypothetical protein  YP_863696  normal  0.171725  normal  0.246945  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4181  CDS  NC_008573  47179  47901  723  hypothetical protein  YP_863697  normal  0.120409  normal  0.252411  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4182  CDS  NC_008573  48256  48957  702  hypothetical protein  YP_863698  normal  0.0852947  normal  0.252411  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4183  CDS  NC_008573  49029  49559  531  lytic transglycosylase, catalytic  YP_863699  normal  0.158148  normal  0.513979  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4184  CDS  NC_008573  49642  50745  1104  IS605 family transposase OrfB  YP_863700  normal  0.90515  normal  0.53705  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4185  CDS  NC_008573  50898  51413  516  hypothetical protein  YP_863701  normal  0.587335  normal  0.493657  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4186  CDS  NC_008573  51416  51769  354  membrane-bound metal-dependent hydrolase  YP_863702  normal  0.495485  normal  0.485593  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4187  CDS  NC_008573  51874  52488  615  hypothetical protein  YP_863703  normal  0.227071  normal  0.686605  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4188  CDS  NC_008573  52776  53429  654  hypothetical protein  YP_863704  normal  0.51797  normal  0.519749  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4189  CDS  NC_008573  53496  54005  510  hypothetical protein  YP_863705  normal  normal  0.708231  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4190  CDS  NC_008573  54097  54537  441  hypothetical protein  YP_863706  normal  normal  0.688919  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4191  CDS  NC_008573  54609  54833  225  ferredoxin  YP_863707  normal  0.661673  normal  0.663207  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4192  CDS  NC_008573  55345  55773  429  hypothetical protein  YP_863708  normal  normal  0.673999  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4193  CDS  NC_008573  55904  56452  549  hypothetical protein  YP_863709  normal  normal  0.671987  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4194  CDS  NC_008573  56546  57919  1374  C-5 cytosine-specific DNA methylase  YP_863710  normal  normal  0.741265  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4195  CDS  NC_008573  58048  58335  288  hypothetical protein  YP_863711  normal  normal  0.86298  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4196  CDS  NC_008573  58457  58891  435  hypothetical protein  YP_863712  normal  0.871696  normal  0.86298  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4197  CDS  NC_008573  59003  59368  366  putative toxin of addiction system  YP_863713  normal  0.705332  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4198  CDS  NC_008573  59875  60306  432  hypothetical protein  YP_863714  normal  0.618653  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4199  CDS  NC_008573  61082  62101  1020  hypothetical protein  YP_863715  normal  0.636561  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4200  CDS  NC_008573  62291  63763  1473  hypothetical protein  YP_863716  normal  0.590321  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4201  CDS  NC_008573  63987  64961  975  ATPase  YP_863717  normal  0.180208  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4202  CDS  NC_008573  65058  66125  1068  hypothetical protein  YP_863718  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4203  CDS  NC_008573  66304  66699  396  hypothetical protein  YP_863719  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4204  CDS  NC_008573  68453  70252  1800  UvrD/REP helicase  YP_863720  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4205  CDS  NC_008573  70404  71261  858  hypothetical protein  YP_863721  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4206  CDS  NC_008573  71303  75577  4275  hypothetical protein  YP_863722  normal  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4207  CDS  NC_008573  75580  76659  1080  TraU family protein  YP_863723  hitchhiker  0.00154228  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4208  CDS  NC_008573  76728  78023  1296  hypothetical protein  YP_863724  decreased coverage  7.59939e-05  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4209  CDS  NC_008573  78004  78510  507  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  YP_863725  hitchhiker  1.49258e-05  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4210  CDS  NC_008573  78585  79010  426  hypothetical protein  YP_863726  hitchhiker  4.23001e-05  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4211  CDS  NC_008573  79152  79604  453  hypothetical protein  YP_863727  hitchhiker  0.000117445  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4212  CDS  NC_008573  79601  80062  462  hypothetical protein  YP_863728  hitchhiker  0.00102749  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4213  CDS  NC_008573  80198  84442  4245  hypothetical protein  YP_863729  normal  0.0374586  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4214  CDS  NC_008573  84628  85533  906  hypothetical protein  YP_863730  hitchhiker  7.1573e-05  normal  0.744992  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4215  CDS  NC_008573  85589  87583  1995  helicase domain-containing protein  YP_863731  hitchhiker  0.00111168  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4216  CDS  NC_008573  87652  88143  492  hypothetical protein  YP_863732  normal  0.0238017  normal  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4217  CDS  NC_008573  88272  88994  723  putative signal transduction protein  YP_863733  normal  0.420533  normal  0.975868  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4218  CDS  NC_008573  89025  91709  2685  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  YP_863734  normal  normal  0.750787  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4219  CDS  NC_008573  91722  92450  729  hypothetical protein  YP_863735  normal  0.650672  normal  0.513979  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4220  CDS  NC_008573  92450  93277  828  hypothetical protein  YP_863736  normal  0.666716  normal  0.507877  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4221  CDS  NC_008573  93556  94818  1263  hypothetical protein  YP_863737  normal  normal  0.723086  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4222  CDS  NC_008573  94833  95180  348  hypothetical protein  YP_863738  normal  normal  0.624368  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4223  CDS  NC_008573  95440  96366  927  hypothetical protein  YP_863739  normal  normal  0.697146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4224  CDS  NC_008573  96487  96696  210  hypothetical protein  YP_863740  normal  0.936707  normal  0.82273  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4225  CDS  NC_008573  97320  98393  1074  hypothetical protein  YP_863741  normal  0.699695  normal  0.542878  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4226  CDS  NC_008573  98383  99600  1218  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_863742  normal  normal  0.533792  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4227  CDS  NC_008573  100875  102038  1164  initiator RepB protein  YP_863743  normal  normal  0.0931296  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4228  CDS  NC_008573  102690  103265  576  hypothetical protein  YP_863744  normal  0.428737  normal  0.0247109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4229  CDS  NC_008573  103338  103865  528  single-strand binding protein  YP_863745  normal  0.201329  normal  0.0453464  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4230  CDS  NC_008573  103994  105601  1608  hypothetical protein  YP_863746  normal  0.069904  hitchhiker  0.0076308  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4231  CDS  NC_008573  105805  106092  288  hypothetical protein  YP_863747  normal  0.963759  hitchhiker  0.00468492  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4232  CDS  NC_008573  106224  106649  426  hypothetical protein  YP_863748  normal  hitchhiker  0.00492028  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4233  CDS  NC_008573  106728  106979  252  hypothetical protein  YP_863749  normal  hitchhiker  0.00471515  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4234  CDS  NC_008573  107846  108745  900  IS605 family transposase OrfB  YP_863750  normal  hitchhiker  0.00596003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4235  CDS  NC_008573  108768  109001  234  virulence protein VsdF  YP_863751  normal  hitchhiker  0.00483154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4236  CDS  NC_008573  109046  109474  429  transposase IS200-family protein  YP_863752  normal  hitchhiker  0.00495198  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4237  CDS  NC_008573  109580  109891  312  XRE family transcriptional regulator  YP_863753  normal  hitchhiker  0.00492028  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4238  CDS  NC_008573  110255  112495  2241  hypothetical protein  YP_863754  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Shewana3_4239    NC_008573  112545  113054  510      normal  0.573269  hitchhiker  0.0025011  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>