1900 genes were found for organism Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
P9211_00001  CDS  NC_009976  162  1355  1194  DNA polymerase III subunit beta  YP_001549885  normal  0.284448  normal  0.0167825  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00011  CDS  NC_009976  1357  2124  768  hypothetical protein  YP_001549886  normal  0.680102  hitchhiker  0.00654314  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00021  CDS  NC_009976  2130  4544  2415  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_001549887  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00031  CDS  NC_009976  4620  6077  1458  amidophosphoribosyltransferase  YP_001549888  normal  0.495809  hitchhiker  0.00403524  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00041  CDS  NC_009976  6074  8560  2487  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  YP_001549889  normal  hitchhiker  0.00707356  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00051  CDS  NC_009976  8638  9531  894  Flp pilus assembly protein TadD  YP_001549890  normal  hitchhiker  0.000470033  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00061  CDS  NC_009976  9543  10508  966  hypothetical protein  YP_001549891  normal  0.374691  hitchhiker  0.000525225  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00071  CDS  NC_009976  10637  11380  744  hypothetical protein  YP_001549892  normal  hitchhiker  0.000473794  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00081  CDS  NC_009976  11415  12050  636  transcription antitermination protein NusB  YP_001549893  normal  decreased coverage  0.000149068  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00091  CDS  NC_009976  12050  13384  1335  signal recognition particle docking protein FtsY  YP_001549894  normal  decreased coverage  0.000209396  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00101  CDS  NC_009976  13442  14299  858  hypothetical protein  YP_001549895  normal  0.843979  hitchhiker  0.000559398  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00111  CDS  NC_009976  14250  14852  603  hypothetical protein  YP_001549896  normal  hitchhiker  0.00368656  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00121  CDS  NC_009976  14906  16294  1389  argininosuccinate lyase  YP_001549897  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00131  CDS  NC_009976  16417  17154  738  RNA recognition motif-containing protein  YP_001549898  normal  hitchhiker  0.00821888  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00141  CDS  NC_009976  17159  18160  1002  tRNA-dihydrouridine synthase A  YP_001549899  normal  hitchhiker  0.00872968  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00151  CDS  NC_009976  18235  18741  507  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  YP_001549900  normal  normal  0.0152291  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00161  CDS  NC_009976  18859  19602  744  heat shock protein GrpE  YP_001549901  normal  normal  0.0174287  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00171  CDS  NC_009976  19645  20778  1134  chaperone protein DnaJ  YP_001549902  normal  normal  0.0387416  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00181  CDS  NC_009976  20771  21019  249  hypothetical protein  YP_001549903  normal  0.910571  normal  0.0515701  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00191  CDS  NC_009976  21009  21950  942  GTPase  YP_001549904  normal  0.193331  normal  0.0640635  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00201  CDS  NC_009976  21919  22266  348  hypothetical protein  YP_001549905  normal  0.076053  normal  0.0532755  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00211  CDS  NC_009976  22303  23184  882  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  YP_001549906  normal  0.168871  normal  0.0349491  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00221  CDS  NC_009976  23188  24618  1431  UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase  YP_001549907  normal  0.05611  normal  0.0698138  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00231  CDS  NC_009976  24834  25856  1023  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(NADP+)(phosphorylating)  YP_001549908  normal  0.148459  normal  0.106886  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00241  CDS  NC_009976  25876  26886  1011  putative thiamine-monophosphate kinase  YP_001549909  normal  0.208498  normal  0.107796  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00251  CDS  NC_009976  26879  27955  1077  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001549910  normal  0.665391  normal  0.112012  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00261  CDS  NC_009976  28019  28579  561  elongation factor P  YP_001549911  normal  0.382229  normal  0.051277  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00271  CDS  NC_009976  28579  29088  510  biotin / lipoyl attachment:Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier subunit  YP_001549912  normal  normal  0.0487976  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00281  CDS  NC_009976  29075  30121  1047  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_001549913  normal  normal  0.105984  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00291  CDS  NC_009976  30126  30308  183  hypothetical protein  YP_001549914  normal  normal  0.0897824  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00301  CDS  NC_009976  30317  31225  909  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  YP_001549915  normal  0.979033  normal  0.104273  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00311  CDS  NC_009976  31256  31474  219  hypothetical protein  YP_001549916  normal  0.456224  normal  0.142159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00321  CDS  NC_009976  31481  31888  408  HNH endonuclease:HNH nuclease  YP_001549917  normal  0.888481  normal  0.156652  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00331  CDS  NC_009976  32083  32487  405  type II secretion system protein-like prrotein  YP_001549918  normal  0.422503  normal  0.239316  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00341  CDS  NC_009976  32853  33140  288  hypothetical protein  YP_001549919  normal  0.227885  normal  0.229777  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00351  CDS  NC_009976  33241  34398  1158  soluble hydrogenase small subunit  YP_001549920  normal  normal  0.269173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00361  CDS  NC_009976  34536  35621  1086  cobalt-precorrin-6A synthase  YP_001549921  normal  0.678537  normal  0.247635  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00371  CDS  NC_009976  35605  37251  1647  GMP synthase  YP_001549922  normal  0.280363  normal  0.275334  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00381  CDS  NC_009976  37473  37961  489  hypothetical protein  YP_001549923  normal  0.182568  normal  0.313362  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00391  CDS  NC_009976  38058  38945  888  hypothetical protein  YP_001549924  normal  0.989493  normal  0.497862  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00401  CDS  NC_009976  39230  41320  2091  acyltransferase  YP_001549925  normal  0.8971  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00411  CDS  NC_009976  41379  41990  612  hypothetical protein  YP_001549926  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00421  CDS  NC_009976  42005  42352  348  hypothetical protein  YP_001549927  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00431  CDS  NC_009976  42389  44197  1809  putative penicillin-binding protein  YP_001549928  normal  0.689764  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00441  CDS  NC_009976  44220  44426  207  hypothetical protein  YP_001549929  normal  0.101951  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00451  CDS  NC_009976  44534  44698  165  hypothetical protein  YP_001549930  normal  0.240015  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00461  CDS  NC_009976  44660  45184  525  putative reductase  YP_001549931  normal  0.677229  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00471  CDS  NC_009976  45233  47074  1842  flavoprotein  YP_001549932  normal  0.818961  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00481  CDS  NC_009976  47074  48843  1770  flavoprotein  YP_001549933  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00491  CDS  NC_009976  48971  49864  894  hypothetical protein  YP_001549934  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00501  CDS  NC_009976  49870  53073  3204  SNF2 family DNA/RNA helicase  YP_001549935  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00511  CDS  NC_009976  53169  55841  2673  alanyl-tRNA synthetase  YP_001549936  normal  0.409533  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00521  CDS  NC_009976  55844  57790  1947  arginine decarboxylase  YP_001549937  normal  0.234716  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00531  CDS  NC_009976  57941  58396  456  nucleoside diphosphate kinase  YP_001549938  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00541  CDS  NC_009976  58353  59513  1161  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  YP_001549939  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00551  CDS  NC_009976  59618  61093  1476  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_001549940  normal  0.986098  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00561  CDS  NC_009976  61100  61705  606  dephospho-CoA kinase  YP_001549941  normal  0.982696  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00571  CDS  NC_009976  61776  63014  1239  ArgJ family protein  YP_001549942  normal  0.21075  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00581  CDS  NC_009976  63047  64879  1833  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  YP_001549943  normal  0.779768  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00591  CDS  NC_009976  65307  66431  1125  RNA methylase family protein  YP_001549944  normal  0.950833  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00601  CDS  NC_009976  66432  66824  393  hypothetical protein  YP_001549945  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00611  CDS  NC_009976  66824  67291  468  hypothetical protein  YP_001549946  normal  0.415645  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00621  CDS  NC_009976  67506  67637  132  hypothetical protein  YP_001549947  normal  0.438522  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00631  CDS  NC_009976  67807  68028  222  hypothetical protein  YP_001549948  normal  0.342546  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00641  CDS  NC_009976  68071  68454  384  hypothetical protein  YP_001549949  normal  0.451795  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00651  CDS  NC_009976  68494  72117  3624  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  YP_001549950  normal  0.929261  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00661  CDS  NC_009976  72185  73249  1065  hypothetical protein  YP_001549951  normal  0.693612  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00671  CDS  NC_009976  73267  74487  1221  hypothetical protein  YP_001549952  normal  0.997015  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00681  CDS  NC_009976  74801  76147  1347  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  YP_001549953  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00691  CDS  NC_009976  76174  76482  309  hypothetical protein  YP_001549954  normal  normal  0.82447  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00701  CDS  NC_009976  76580  76756  177  photosystem II protein X PsbX  YP_001549955  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00711  CDS  NC_009976  76845  77831  987  hypothetical protein  YP_001549956  normal  normal  0.721442  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00721  CDS  NC_009976  77864  78112  249  high light inducible protein  YP_001549957  normal  normal  0.624875  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00731  CDS  NC_009976  78125  80113  1989  ABC transporter, ATP binding protein  YP_001549958  normal  normal  0.862442  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00741  CDS  NC_009976  80380  80721  342  HIT (histidine triad) family protein  YP_001549959  normal  0.39075  normal  0.85423  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00751  CDS  NC_009976  81036  81206  171  30S ribosomal protein S21  YP_001549960  normal  0.17541  normal  0.831051  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00761  CDS  NC_009976  81287  81892  606  peptide deformylase  YP_001549961  normal  0.264235  normal  0.886891  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00771  CDS  NC_009976  81970  83907  1938  esterase/lipase/thioesterase family protein  YP_001549962  normal  0.248963  normal  0.78651  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00781  CDS  NC_009976  83904  85163  1260  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  YP_001549963  normal  normal  0.674845  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00791  CDS  NC_009976  85165  86391  1227  ABC transporter, membrane component  YP_001549964  normal  normal  0.917338  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00801  CDS  NC_009976  86400  87173  774  ABC transporter, ATP binding component  YP_001549965  normal  normal  0.681309  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00811  CDS  NC_009976  87245  88693  1449  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  YP_001549966  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00821  CDS  NC_009976  88793  89158  366  hypothetical protein  YP_001549967  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00831  CDS  NC_009976  89217  89384  168  hypothetical protein  YP_001549968  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00841  CDS  NC_009976  89476  90573  1098  hypothetical protein  YP_001549969  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00851  CDS  NC_009976  90585  90755  171  membrane protein  YP_001549970  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00861  CDS  NC_009976  90801  92462  1662  phosphoglucomutase  YP_001549971  normal  0.662006  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00871  CDS  NC_009976  92565  93932  1368  recombination factor protein RarA  YP_001549972  normal  0.0752794  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00881  CDS  NC_009976  93991  94467  477  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  YP_001549973  normal  0.364893  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00891  CDS  NC_009976  94470  95156  687  transcriptional regulator  YP_001549974  normal  0.529002  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00901  CDS  NC_009976  95153  95920  768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  YP_001549975  normal  0.800152  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00911  CDS  NC_009976  95979  97157  1179  putative NADH dehydrogenase, transport associated  YP_001549976  normal  0.616782  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00921  CDS  NC_009976  97251  99080  1830  DASS family sodium/sulfate transporter  YP_001549977  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00931  CDS  NC_009976  99123  100526  1404  Trk family sodium transporter  YP_001549978  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00941  CDS  NC_009976  100551  101255  705  VIC family potassium channel protein  YP_001549979  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00951  CDS  NC_009976  101266  102405  1140  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  YP_001549980  normal  0.612767  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00961  CDS  NC_009976  102410  102709  300  hypothetical protein  YP_001549981  normal  0.745359  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00971  CDS  NC_009976  102907  103275  369  hypothetical protein  YP_001549982  normal  0.591895  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00981  CDS  NC_009976  103308  103538  231  hypothetical protein  YP_001549983  normal  0.808336  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
P9211_00991  CDS  NC_009976  103541  103705  165  hypothetical protein  YP_001549984  normal  normal  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>