2027 genes were found for organism Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Lreu_0001  CDS  NC_009513  381  1703  1323  chromosomal replication initiation protein  YP_001270614  normal  0.203604  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0002  CDS  NC_009513  1879  3021  1143  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001270615  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0003  CDS  NC_009513  3268  3489  222  S4 region, YaaA  YP_001270616  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0004  CDS  NC_009513  3498  4622  1125  recombination protein F  YP_001270617  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0005  CDS  NC_009513  4619  6568  1950  DNA gyrase subunit B  YP_001270618  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0006  CDS  NC_009513  6611  9115  2505  DNA gyrase subunit A  YP_001270619  normal  0.0218004  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0007  CDS  NC_009513  9318  9614  297  30S ribosomal protein S6  YP_001270620  hitchhiker  1.32561e-10  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0008  CDS  NC_009513  9652  10215  564  single-strand binding protein  YP_001270621  unclonable  1.09058e-13  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0009  CDS  NC_009513  10249  10485  237  30S ribosomal protein S18  YP_001270622  hitchhiker  1.83869e-07  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0010  CDS  NC_009513  10702  12720  2019  phosphoesterase domain-containing protein  YP_001270623  normal  0.0144039  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0011  CDS  NC_009513  12726  13178  453  50S ribosomal protein L9  YP_001270624  normal  0.557694  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0012  CDS  NC_009513  13212  14603  1392  primary replicative DNA helicase  YP_001270625  normal  0.781358  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0013  CDS  NC_009513  14725  15927  1203  major facilitator transporter  YP_001270626  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0014  CDS  NC_009513  15940  16266  327  hypothetical protein  YP_001270627  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0015  CDS  NC_009513  16371  17249  879  polyphosphate:AMP phosphotransferase  YP_001270628  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0016  CDS  NC_009513  17279  17836  558  XRE family transcriptional regulator  YP_001270629  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0017  CDS  NC_009513  18438  18872  435  MarR family transcriptional regulator  YP_001270630  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0018  CDS  NC_009513  18960  20681  1722  ABC transporter related  YP_001270631  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0019  CDS  NC_009513  21025  21732  708  two component transcriptional regulator  YP_001270632  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0020  CDS  NC_009513  21746  23611  1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_001270633  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0021  CDS  NC_009513  23589  24884  1296  YycH family protein  YP_001270634  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0022  CDS  NC_009513  24897  25739  843  hypothetical protein  YP_001270635  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0023  CDS  NC_009513  25757  26563  807  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001270636  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0024  CDS  NC_009513  26665  27939  1275  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  YP_001270637  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0025  CDS  NC_009513  28168  28665  498  phosphatidylglycerophosphatase A  YP_001270638  normal  0.6081  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0026  CDS  NC_009513  28974  29960  987  hypothetical protein  YP_001270639  normal  0.35198  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0027  CDS  NC_009513  30429  30908  480  rRNA large subunit methyltransferase  YP_001270640  hitchhiker  0.000611129  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0028  CDS  NC_009513  31051  31269  219  hypothetical protein  YP_001270641  hitchhiker  1.64698e-05  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0029  CDS  NC_009513  31343  31879  537  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001270642  hitchhiker  1.62368e-08  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0030  CDS  NC_009513  32098  33270  1173  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001270643  hitchhiker  7.06289e-11  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0031  CDS  NC_009513  33514  34377  864  sugar transport family protein  YP_001270644  unclonable  1.4774e-13  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0032  CDS  NC_009513  34492  35268  777  hypothetical protein  YP_001270645  hitchhiker  7.24697e-11  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0033  CDS  NC_009513  35270  36082  813  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_001270646  hitchhiker  7.57721e-09  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0034  CDS  NC_009513  36383  37756  1374  aldehyde dehydrogenase  YP_001270647  hitchhiker  8.22234e-07  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0035  CDS  NC_009513  37932  39014  1083  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001270648  hitchhiker  3.02663e-08  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0036  CDS  NC_009513  39016  39714  699  ABC transporter related  YP_001270649  hitchhiker  0.00248641  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0037  CDS  NC_009513  39701  40936  1236  hypothetical protein  YP_001270650  normal  0.191885  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0038  CDS  NC_009513  41186  41590  405  hypothetical protein  YP_001270651  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0039  CDS  NC_009513  41600  41737  138  hypothetical protein  YP_001270652  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0040  CDS  NC_009513  41926  43320  1395  hypothetical protein  YP_001270653  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0041  CDS  NC_009513  43610  44086  477  hypothetical protein  YP_001270654  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0042  CDS  NC_009513  44169  44597  429  OsmC family protein  YP_001270655  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0043  CDS  NC_009513  44665  45660  996  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_001270656  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0044  CDS  NC_009513  45662  46849  1188  aromatic amino acid aminotransferase  YP_001270657  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0045  CDS  NC_009513  47696  49933  2238  ATPase  YP_001270658  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0046  CDS  NC_009513  50822  53677  2856  hypothetical protein  YP_001270659  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0047  CDS  NC_009513  53759  54343  585  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001270660  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0048  CDS  NC_009513  54483  55946  1464  cardiolipin synthetase 2  YP_001270661  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0049  CDS  NC_009513  56075  59857  3783  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  YP_001270662  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0050  CDS  NC_009513  59857  64035  4179  recombination helicase AddA  YP_001270663  normal  0.110759  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0051  CDS  NC_009513  64036  64971  936  LacI family transcription regulator  YP_001270664  hitchhiker  2.23899e-10  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0052  CDS  NC_009513  65035  66213  1179  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_001270665  hitchhiker  8.85488e-11  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0053  CDS  NC_009513  66525  67874  1350  major facilitator transporter  YP_001270666  unclonable  9.0495e-12  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0054  CDS  NC_009513  67963  70215  2253  maltose phosphorylase  YP_001270667  hitchhiker  2.86879e-06  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0055  CDS  NC_009513  70234  70896  663  beta-phosphoglucomutase  YP_001270668  hitchhiker  7.75406e-11  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0056  CDS  NC_009513  70973  71455  483  hypothetical protein  YP_001270669  hitchhiker  1.74632e-12  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0057    NC_009513  71540  72164  625      unclonable  1.04622e-13  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0058  CDS  NC_009513  72166  72831  666  two component transcriptional regulator  YP_001270670  hitchhiker  5.51146e-09  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0059  CDS  NC_009513  72843  74090  1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001270671  hitchhiker  0.000404489  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0060  CDS  NC_009513  74093  75274  1182  hypothetical protein  YP_001270672  normal  0.139873  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0061  CDS  NC_009513  75426  76766  1341  glutamate-cysteine ligase  YP_001270673  normal  0.398399  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0062  CDS  NC_009513  77012  77470  459  transposase IS200-family protein  YP_001270674  normal  0.121759  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0063  CDS  NC_009513  77669  78397  729  peptidase C26  YP_001270675  normal  0.542911  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0064  CDS  NC_009513  78516  79382  867  2,5-didehydrogluconate reductase  YP_001270676  normal  0.750291  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0065  CDS  NC_009513  79521  81308  1788  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_001270677  normal  0.253496  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0066  CDS  NC_009513  81361  81858  498  membrane protein-like protein  YP_001270678  normal  0.0126213  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0067  CDS  NC_009513  82127  83476  1350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001270679  hitchhiker  0.000104201  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0068  CDS  NC_009513  83536  84510  975  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  YP_001270680  hitchhiker  8.29344e-07  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0069  CDS  NC_009513  84706  86004  1299  adenylosuccinate synthetase  YP_001270681  hitchhiker  2.15485e-08  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0070  CDS  NC_009513  86115  86900  786  hypothetical protein  YP_001270682  hitchhiker  7.78889e-12  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0071  CDS  NC_009513  87063  87602  540  Uracil phosphoribosyltransferase  YP_001270683  hitchhiker  2.43605e-12  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0072  CDS  NC_009513  87721  88107  387  hypothetical protein  YP_001270684  unclonable  2.59116e-14  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0073  CDS  NC_009513  88356  89612  1257  IS605 family transposase OrfB  YP_001270685  hitchhiker  1.49259e-07  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0074  CDS  NC_009513  89687  90142  456  transposase IS200-family protein  YP_001270686  normal  0.28559  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0075  CDS  NC_009513  90267  91001  735  peptidase C26  YP_001270687  normal  0.70164  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0076  CDS  NC_009513  91007  92401  1395  amino acid permease-associated region  YP_001270688  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0077  CDS  NC_009513  92873  93070  198  hypothetical protein  YP_001270689  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0078  CDS  NC_009513  93058  93513  456  hypothetical protein  YP_001270690  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0079  CDS  NC_009513  93578  94021  444  hypothetical protein  YP_001270691  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0080  CDS  NC_009513  94121  95662  1542  hypothetical protein  YP_001270692  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0081  CDS  NC_009513  95664  97166  1503  hypothetical protein  YP_001270693  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0082  CDS  NC_009513  97278  99095  1818  hypothetical protein  YP_001270694  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0083  CDS  NC_009513  99279  100961  1683  alpha amylase, catalytic region  YP_001270695  normal  0.0810365  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0084  CDS  NC_009513  100979  102364  1386  major facilitator transporter  YP_001270696  hitchhiker  3.80135e-08  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0085  CDS  NC_009513  102442  105612  3171  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_001270697  hitchhiker  0.00260745  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0086  CDS  NC_009513  105605  106693  1089  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_001270698  hitchhiker  0.000481793  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0087  CDS  NC_009513  107075  108448  1374  major facilitator transporter  YP_001270699  hitchhiker  3.15537e-10  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0088  CDS  NC_009513  108608  109618  1011  LacI family transcription regulator  YP_001270700  unclonable  1.27052e-12  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0089  CDS  NC_009513  109757  111163  1407  RNA methyltransferase  YP_001270701  hitchhiker  1.33484e-06  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0090  CDS  NC_009513  111380  111991  612  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001270702  hitchhiker  7.95412e-07  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0091  CDS  NC_009513  111991  113241  1251  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001270703  hitchhiker  1.39902e-08  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0092  CDS  NC_009513  113244  114170  927  ApbE family lipoprotein  YP_001270704  hitchhiker  0.0025456  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0093  CDS  NC_009513  114668  116050  1383  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_001270705  normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0095    NC_009513  116315  120965  4651      normal  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0097  CDS  NC_009513  121729  123036  1308  seryl-tRNA synthetase  YP_001270706  decreased coverage  1.7376e-10  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0098  CDS  NC_009513  123305  124768  1464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001270707  decreased coverage  3.21849e-10  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0099  CDS  NC_009513  124770  125513  744  ABC transporter related  YP_001270708  hitchhiker  1.31657e-05  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0100  CDS  NC_009513  125817  127166  1350  amino acid permease-associated region  YP_001270709  hitchhiker  1.48817e-05  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0101  CDS  NC_009513  128117  129328  1212  Na+ dependent nucleoside transporter  YP_001270710  hitchhiker  1.76042e-05  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0102  CDS  NC_009513  129409  130317  909  ribonucleoside hydrolase RihC  YP_001270711  hitchhiker  1.59714e-05  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>