3720 genes were found for organism Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 38    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mesil_0001  CDS  NC_014212  126  1445  1320  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003683457  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0002  CDS  NC_014212  1736  2836  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003683458  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0003  CDS  NC_014212  2937  4205  1269  enolase  YP_003683459  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0004  CDS  NC_014212  4192  5616  1425  pyruvate kinase  YP_003683460  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0005  CDS  NC_014212  5653  6954  1302  cytochrome P450  YP_003683461  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0006  CDS  NC_014212  8736  9893  1158  Integrase catalytic region  YP_003683462  unclonable  3.97696e-07  normal  0.219937  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0007  CDS  NC_014212  10011  11042  1032  transposase IS4 family protein  YP_003683463  hitchhiker  4.67317e-06  normal  0.127483  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0008  CDS  NC_014212  11152  11874  723  LmbE family protein  YP_003683464  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0009  CDS  NC_014212  12006  12452  447  hypothetical protein  YP_003683465  hitchhiker  0.00326854  normal  0.123538  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0010  CDS  NC_014212  12520  13782  1263  transposase mutator type  YP_003683466  normal  0.113874  normal  0.0774421  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0011  CDS  NC_014212  13813  14049  237  hypothetical protein  YP_003683467  normal  0.0492679  normal  0.0612001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0012  CDS  NC_014212  14075  14536  462  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  YP_003683468  normal  0.121067  normal  0.063625  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0013  CDS  NC_014212  14733  15083  351  nitrogen regulatory protein P-II  YP_003683469  normal  0.271001  normal  0.0615385  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0014  CDS  NC_014212  15099  16466  1368  ammonium transporter  YP_003683470  normal  normal  0.138738  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0015  CDS  NC_014212  16685  17599  915  heat-inducible transcription repressor HrcA  YP_003683471  normal  0.914534  normal  0.130735  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0016  CDS  NC_014212  17655  18653  999  Polyprenyl synthetase  YP_003683472  normal  normal  0.24479  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0017  CDS  NC_014212  18868  19530  663  phage shock protein A, PspA  YP_003683473  normal  normal  0.12234  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0018  CDS  NC_014212  19608  20057  450  hypothetical protein  YP_003683474  normal  normal  0.217753  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0019  CDS  NC_014212  20246  20902  657  hypothetical protein  YP_003683475  normal  normal  0.228639  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0020  CDS  NC_014212  20980  22011  1032  transposase IS4 family protein  YP_003683476  normal  normal  0.390946  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0021  CDS  NC_014212  22116  23981  1866  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  YP_003683477  normal  0.640132  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0022  CDS  NC_014212  24007  24648  642  beta-lactamase domain protein  YP_003683478  normal  0.887133  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0023  CDS  NC_014212  24852  25292  441  hypothetical protein  YP_003683479  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0024  CDS  NC_014212  25513  25881  369  hypothetical protein  YP_003683480  normal  0.944021  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0025  CDS  NC_014212  25898  26620  723  protein of unknown function DUF164  YP_003683481  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0026  CDS  NC_014212  26778  27728  951  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  YP_003683482  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0027  CDS  NC_014212  27890  28804  915  hypothetical protein  YP_003683483  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0028  CDS  NC_014212  28918  29889  972  Ribosylpyrimidine nucleosidase  YP_003683484  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0029  CDS  NC_014212  30081  32138  2058  Oligopeptidase B  YP_003683485  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0030  CDS  NC_014212  32135  32674  540  protein of unknown function DUF820  YP_003683486  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0031  CDS  NC_014212  32681  34720  2040  molybdopterin dinucleotide-binding region  YP_003683487  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0032  CDS  NC_014212  34717  35508  792  hypothetical protein  YP_003683488  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0033  CDS  NC_014212  35580  36647  1068  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003683489  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0034  CDS  NC_014212  36800  38392  1593  peptidase M20  YP_003683490  normal  0.917037  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0035  CDS  NC_014212  38493  40691  2199  primosomal protein N'  YP_003683491  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0036  CDS  NC_014212  40959  41810  852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_003683492  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0037  CDS  NC_014212  41870  42613  744  ABC transporter related protein  YP_003683493  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0038  CDS  NC_014212  42692  43651  960  inner-membrane translocator  YP_003683494  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0039  CDS  NC_014212  43661  44623  963  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_003683495  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0040  CDS  NC_014212  44740  45732  993  transcriptional regulator, LacI family  YP_003683496  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0041  CDS  NC_014212  45941  46900  960  branched-chain amino acid aminotransferase  YP_003683497  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0042  CDS  NC_014212  46974  47471  498  ATP-cone domain protein  YP_003683498  normal  0.67036  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0043  CDS  NC_014212  47580  48290  711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003683499  normal  0.368387  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0044  CDS  NC_014212  48470  48928  459  Methyltransferase type 12  YP_003683500  normal  0.0924465  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0045  CDS  NC_014212  48925  49134  210  hypothetical protein  YP_003683501  normal  0.100529  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0046  CDS  NC_014212  49131  49628  498  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003683502  normal  0.152291  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0047  CDS  NC_014212  49711  50730  1020  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003683503  normal  0.163048  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0048  CDS  NC_014212  50734  50931  198  hypothetical protein  YP_003683504  normal  0.156566  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0049    NC_014212  51022  51996  975      normal  0.779431  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0050  CDS  NC_014212  52172  52954  783  metallophosphoesterase  YP_003683505  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0051  CDS  NC_014212  53281  54345  1065  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  YP_003683506  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0052  CDS  NC_014212  54405  54884  480  Appr-1-p processing domain protein  YP_003683507  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0053  CDS  NC_014212  54943  55986  1044  DNA replication and repair protein RecF  YP_003683508  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0054  CDS  NC_014212  56002  56769  768  protein of unknown function DUF81  YP_003683509  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0055  CDS  NC_014212  56881  57696  816  protein of unknown function DUF721  YP_003683510  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0056  CDS  NC_014212  57700  58416  717  protein of unknown function DUF45  YP_003683511  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0057  CDS  NC_014212  58714  59094  381  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003683512  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0058  CDS  NC_014212  59278  59838  561  Ankyrin  YP_003683513  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0059  CDS  NC_014212  59955  60179  225  phospholipase D family protein  YP_003683514  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0060  CDS  NC_014212  60167  61264  1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003683515  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0061  CDS  NC_014212  61261  62349  1089  Queuosine biosynthesis protein  YP_003683516  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0062  CDS  NC_014212  62489  62824  336  hypothetical protein  YP_003683517  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0063  CDS  NC_014212  62821  63189  369  hypothetical protein  YP_003683518  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0064  CDS  NC_014212  63287  64477  1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  YP_003683519  normal  0.693223  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0065  CDS  NC_014212  64482  65096  615  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003683520  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0066  CDS  NC_014212  65169  65558  390  RNA binding S1 domain protein  YP_003683521  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0067  CDS  NC_014212  65811  66995  1185  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003683522  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0068  CDS  NC_014212  67002  67850  849  protein of unknown function DUF692  YP_003683523  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0069  CDS  NC_014212  68001  69233  1233  threonine dehydratase  YP_003683524  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0070  CDS  NC_014212  69394  70611  1218  molybdenum cofactor synthesis domain protein  YP_003683525  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0071  CDS  NC_014212  70752  71372  621  ATP phosphoribosyltransferase  YP_003683526  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0072  CDS  NC_014212  71501  72529  1029  aldo/keto reductase  YP_003683527  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0073  CDS  NC_014212  72628  73056  429  hypothetical protein  YP_003683528  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0074  CDS  NC_014212  73063  73749  687  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  YP_003683529  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0075  CDS  NC_014212  73778  74989  1212  VanW family protein  YP_003683530  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0076  CDS  NC_014212  75010  76224  1215  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  YP_003683531  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0077  CDS  NC_014212  76440  77945  1506  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003683532  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0078  CDS  NC_014212  78050  78997  948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003683533  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0079  CDS  NC_014212  78990  79847  858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003683534  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0080  CDS  NC_014212  79865  80656  792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003683535  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0081  CDS  NC_014212  80653  81882  1230  Phosphoglycerate mutase  YP_003683536  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0082  CDS  NC_014212  81922  82248  327  Rhodanese domain protein  YP_003683537  normal  0.459536  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0083  CDS  NC_014212  82296  82826  531  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003683538  normal  0.0457106  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0084  CDS  NC_014212  83049  85631  2583  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_003683539  decreased coverage  0.000306364  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0085    NC_014212  86052  88041  1990      normal  0.390414  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0086    NC_014212  88362  88646  285      normal  0.981567  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0087  CDS  NC_014212  88680  89494  815  Transposase-like protein  YP_003683540  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0088  CDS  NC_014212  89555  90649  1095  Integrase catalytic region  YP_003683541  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0089  CDS  NC_014212  91011  92444  1434  prolyl-tRNA synthetase  YP_003683542  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0090  CDS  NC_014212  92535  93530  996  oxidoreductase domain protein  YP_003683543  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0091  CDS  NC_014212  93534  94247  714  endonuclease III  YP_003683544  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0092  CDS  NC_014212  94310  95476  1167  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003683545  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0093  CDS  NC_014212  95473  96123  651  hypothetical protein  YP_003683546  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0094  CDS  NC_014212  96226  97860  1635  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003683547  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0095  CDS  NC_014212  97968  98378  411  thioesterase superfamily protein  YP_003683548  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0096  CDS  NC_014212  98375  98860  486  Dihydrofolate reductase  YP_003683549  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0097  CDS  NC_014212  98892  99686  795  thymidylate synthase  YP_003683550  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0098  CDS  NC_014212  99849  101123  1275  S-layer domain protein  YP_003683551  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0099  CDS  NC_014212  101712  102065  354  membrane protein of unknown function  YP_003683552  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0100  CDS  NC_014212  102083  102514  432  putative signal transduction protein with CBS domains  YP_003683553  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 38    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>