5155 genes were found for organism Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Gobs_0001  CDS  NC_013757  314  2068  +  1755  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003407184  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0002  CDS  NC_013757  2787  3947  +  1161  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003407185  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0003  CDS  NC_013757  4135  5067  +  933  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  YP_003407186  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0004  CDS  NC_013757  5185  6384  +  1200  DNA replication and repair protein RecF  YP_003407187  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0005  CDS  NC_013757  6381  6881  +  501  protein of unknown function DUF721  YP_003407188  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0006  CDS  NC_013757  6940  7863  +  924  hypothetical protein  YP_003407189  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0007  CDS  NC_013757  7886  9652  +  1767  ABC transporter related protein  YP_003407190  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0008  CDS  NC_013757  9749  11281  -  1533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_003407191  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0009  CDS  NC_013757  11414  12838  +  1425  amino acid permease-associated region  YP_003407192  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0010  CDS  NC_013757  13195  15237  +  2043  DNA gyrase, B subunit  YP_003407193  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0011  CDS  NC_013757  15470  17938  +  2469  DNA gyrase, A subunit  YP_003407194  normal  0.81481  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0012  CDS  NC_013757  18107  18820  +  714  hypothetical protein  YP_003407195  normal  0.984121  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0013  CDS  NC_013757  19285  19428  +  144  hypothetical protein  YP_003407196  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0014  CDS  NC_013757  19590  20693  -  1104  integrase family protein  YP_003407197  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0015  CDS  NC_013757  20856  21083  -  228  regulatory protein MerR  YP_003407198  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0016  CDS  NC_013757  21245  24025  -  2781  TrwC relaxase  YP_003407199  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0017  CDS  NC_013757  24536  25210  -  675  transcriptional regulator, TetR family  YP_003407200  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0018  CDS  NC_013757  25327  26091  +  765  hypothetical protein  YP_003407201  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0019  CDS  NC_013757  26379  27347  +  969  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_003407202  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0020  CDS  NC_013757  27444  27944  +  501  hypothetical protein  YP_003407203  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0021  CDS  NC_013757  28061  29005  +  945  ABC transporter related protein  YP_003407204  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0022  CDS  NC_013757  29002  29859  +  858  putative integral membrane transport protein  YP_003407205  normal  0.598911  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0023  CDS  NC_013757  29897  30460  +  564  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003407206  normal  0.058243  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0024  CDS  NC_013757  30640  30852  +  213  hypothetical protein  YP_003407207  normal  0.0169675  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0025  CDS  NC_013757  30859  31938  +  1080  hypothetical protein  YP_003407208  decreased coverage  0.00265781  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0026  CDS  NC_013757  32247  33500  +  1254  peptidase S49  YP_003407209  normal  0.0292498  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0027  CDS  NC_013757  33619  34113  +  495  hypothetical protein  YP_003407210  normal  0.0608014  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0028  CDS  NC_013757  34224  34757  +  534  Peptidylprolyl isomerase  YP_003407211  normal  0.189916  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0029    NC_013757  34817  35653  +  837      normal  0.261853  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0030  CDS  NC_013757  35780  36187  -  408  hypothetical protein  YP_003407212  normal  0.241385  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0031  CDS  NC_013757  36388  37548  +  1161  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_003407213  normal  0.430894  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0032  CDS  NC_013757  38078  38350  -  273  protein of unknown function UPF0233  YP_003407214  normal  0.361268  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0033  CDS  NC_013757  38419  39186  +  768  protein of unknown function DUF881  YP_003407215  normal  0.249833  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0034  CDS  NC_013757  39198  39869  +  672  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003407216  normal  0.70958  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0035  CDS  NC_013757  39984  41927  -  1944  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_003407217  normal  0.975748  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0036  CDS  NC_013757  42055  43899  -  1845  serine/threonine protein kinase  YP_003407218  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0037  CDS  NC_013757  43899  45341  -  1443  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003407219  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0038  CDS  NC_013757  45338  46759  -  1422  cell cycle protein  YP_003407220  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0039  CDS  NC_013757  46833  48251  -  1419  protein serine/threonine phosphatase  YP_003407221  normal  0.759123  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0040  CDS  NC_013757  48280  48744  -  465  FHA domain containing protein  YP_003407222  normal  0.906333  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0041  CDS  NC_013757  48758  49570  -  813  FHA domain containing protein  YP_003407223  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0042  CDS  NC_013757  49979  50365  -  387  protein of unknown function DUF1486  YP_003407224  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0043  CDS  NC_013757  50437  50895  -  459  protein of unknown function DUF1707  YP_003407225  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0044  CDS  NC_013757  51019  51954  +  936  Aldose 1-epimerase  YP_003407226  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0045  CDS  NC_013757  51956  52669  +  714  MOSC domain protein beta barrel domain protein  YP_003407227  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0046  CDS  NC_013757  52666  52890  +  225  hypothetical protein  YP_003407228  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0047  CDS  NC_013757  52915  54102  +  1188  aminotransferase class I and II  YP_003407229  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0048  CDS  NC_013757  54102  54884  +  783  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  YP_003407230  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0049  CDS  NC_013757  55048  55440  -  393  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_003407231  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0050  CDS  NC_013757  55451  56356  -  906  Domain of unknown function DUF2382-like protein  YP_003407232  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0051  CDS  NC_013757  56500  58083  +  1584  CHAD domain containing protein  YP_003407233  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0052  CDS  NC_013757  58159  59484  +  1326  metallophosphoesterase  YP_003407234  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0053  CDS  NC_013757  59488  60054  -  567  transcriptional regulator, TetR family  YP_003407235  normal  0.573004  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0054  CDS  NC_013757  60297  61025  +  729  transcriptional regulator, GntR family  YP_003407236  normal  0.514646  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0055  CDS  NC_013757  61082  61567  +  486  hypothetical protein  YP_003407237  normal  0.595037  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0056  CDS  NC_013757  61689  61961  +  273  integral membrane protein  YP_003407238  normal  0.13836  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0057  CDS  NC_013757  62062  62331  +  270  hypothetical protein  YP_003407239  normal  0.134814  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0058  CDS  NC_013757  62349  62987  -  639  hypothetical protein  YP_003407240  normal  0.329585  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0059  CDS  NC_013757  63116  63340  +  225  hypothetical protein  YP_003407241  normal  0.635433  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0060  CDS  NC_013757  63414  64190  -  777  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_003407242  normal  0.157267  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0061  CDS  NC_013757  64597  66285  +  1689  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_003407243  normal  0.282994  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0062  CDS  NC_013757  66298  67944  +  1647  serine/threonine protein kinase  YP_003407244  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0063  CDS  NC_013757  67953  68651  -  699  hypothetical protein  YP_003407245  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0064  CDS  NC_013757  68744  70048  +  1305  CinA domain protein  YP_003407246  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0065  CDS  NC_013757  70048  70476  +  429  hypothetical protein  YP_003407247  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0066  CDS  NC_013757  70473  70868  +  396  hypothetical protein  YP_003407248  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0067  CDS  NC_013757  70931  71089  -  159  hypothetical protein  YP_003407249  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0068  CDS  NC_013757  71163  71663  -  501  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003407250  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0069  CDS  NC_013757  71814  73055  +  1242  HNH nuclease  YP_003407251  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0070    NC_013757  73226  74130  +  905      normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0071  CDS  NC_013757  74165  76258  +  2094  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_003407252  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0072  CDS  NC_013757  76267  77073  +  807  hypothetical protein  YP_003407253  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0073  CDS  NC_013757  77079  78593  +  1515  phospholipase D/Transphosphatidylase  YP_003407254  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0074  CDS  NC_013757  78655  79512  -  858  formate/nitrite transporter  YP_003407255  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0075  CDS  NC_013757  79512  80174  -  663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  YP_003407256  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0076  CDS  NC_013757  80219  82915  -  2697  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  YP_003407257  normal  0.695831  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0077  CDS  NC_013757  83117  83752  +  636  type IV pilus assembly PilZ  YP_003407258  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0078  CDS  NC_013757  83909  84544  +  636  type IV pilus assembly PilZ  YP_003407259  normal  0.970228  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0079  CDS  NC_013757  84574  86271  +  1698  putative ABC transporter  YP_003407260  normal  0.459634  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0080  CDS  NC_013757  86268  87866  +  1599  GTP-binding protein HSR1-related protein  YP_003407261  normal  0.170633  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0081  CDS  NC_013757  87918  88370  -  453  putative signal transduction histidine kinase  YP_003407262  normal  0.273591  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0082  CDS  NC_013757  88461  89273  +  813  ANTAR domain protein with unknown sensor  YP_003407263  normal  0.265172  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0083  CDS  NC_013757  89345  90286  -  942  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  YP_003407264  normal  0.178624  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0084  CDS  NC_013757  90301  91650  -  1350  amino acid permease-associated region  YP_003407265  normal  0.687355  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0085  CDS  NC_013757  91968  92648  +  681  Gm3773; predicted gene 3773  YP_003407266  normal  0.069317  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0086  CDS  NC_013757  93357  95414  +  2058  putative PAS/PAC sensor protein  YP_003407267  normal  0.65346  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0087  CDS  NC_013757  95639  97003  +  1365  pyrrolo-quinoline quinone  YP_003407268  normal  0.597911  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0088  CDS  NC_013757  97051  97977  +  927  periplasmic solute binding protein  YP_003407269  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0089  CDS  NC_013757  98053  100386  -  2334  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  YP_003407270  normal  0.472584  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0090    NC_013757  100680  101099  -  420      normal  0.282518  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0091  CDS  NC_013757  101353  101952  -  600  thiamine monophosphate synthase  YP_003407271  normal  0.230715  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0092  CDS  NC_013757  101949  102794  -  846  thiazole biosynthesis family protein  YP_003407272  normal  0.638488  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0093  CDS  NC_013757  102797  102997  -  201  thiamine biosynthesis protein ThiS  YP_003407273  normal  0.704796  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0094  CDS  NC_013757  103003  104109  -  1107  glycine oxidase ThiO  YP_003407274  normal  0.883041  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0095  CDS  NC_013757  104106  105452  -  1347  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  YP_003407275  normal  0.209676  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0096  CDS  NC_013757  105624  106220  +  597  transcriptional activator, TenA family  YP_003407276  normal  1  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0097  CDS  NC_013757  106217  106834  +  618  transcriptional activator, TenA family  YP_003407277  normal  0.658619  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0098  CDS  NC_013757  107131  107301  +  171  hypothetical protein  YP_003407278  normal  0.441072  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0099  CDS  NC_013757  107394  108689  -  1296  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  YP_003407279  normal  0.510784  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Gobs_0100  CDS  NC_013757  108842  109549  -  708  protein of unknown function DUF82  YP_003407280  normal  0.566034  n/a    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>