2894 genes were found for organism Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bmur_0001  CDS  NC_014150  132  1511  1380  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003632311  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0002  CDS  NC_014150  2051  2671  621  GrpE protein  YP_003632312  normal  0.531723  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0003  CDS  NC_014150  2693  2902  210  hypothetical protein  YP_003632313  normal  0.540829  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0004  CDS  NC_014150  2992  4908  1917  chaperone protein DnaK  YP_003632314  normal  0.0408404  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0005  CDS  NC_014150  5123  5455  333  Ankyrin  YP_003632315  normal  0.0136413  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0006  CDS  NC_014150  5465  6406  942  hypothetical protein  YP_003632316  decreased coverage  0.00155614  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0007  CDS  NC_014150  6556  7248  693  protein of unknown function DUF1275  YP_003632317  hitchhiker  0.00254664  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0008  CDS  NC_014150  7274  7564  291  heat shock protein DnaJ domain protein  YP_003632318  normal  0.0163612  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0009  CDS  NC_014150  7604  8734  1131  chaperone protein DnaJ  YP_003632319  normal  0.0447538  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0010  CDS  NC_014150  8859  9899  1041  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  YP_003632320  normal  0.133832  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0011  CDS  NC_014150  10288  12345  2058  excinuclease ABC, B subunit  YP_003632321  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0012  CDS  NC_014150  12373  13278  906  hypothetical protein  YP_003632322  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0013  CDS  NC_014150  13510  14364  855  Peptidase M23  YP_003632323  normal  0.958477  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0014  CDS  NC_014150  14361  15536  1176  hypothetical protein  YP_003632324  normal  0.195528  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0015  CDS  NC_014150  15593  16780  1188  Peptidase M23  YP_003632325  normal  0.136901  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0016  CDS  NC_014150  16832  17521  690  TPR repeat-containing protein  YP_003632326  normal  0.0964608  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0017  CDS  NC_014150  17875  19782  1908  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003632327  normal  0.603122  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0018  CDS  NC_014150  19804  20706  903  PfkB domain protein  YP_003632328  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0019  CDS  NC_014150  20711  21265  555  hypothetical protein  YP_003632329  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0020  CDS  NC_014150  21293  22465  1173  TPR repeat-containing protein  YP_003632330  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0021  CDS  NC_014150  22492  23142  651  protein of unknown function DUF151  YP_003632331  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0022  CDS  NC_014150  23339  25096  1758  hypothetical protein  YP_003632332  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0023  CDS  NC_014150  25083  27134  2052  putative YD repeat protein  YP_003632333  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0024  CDS  NC_014150  27314  29854  2541  helicase c2  YP_003632334  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0025  CDS  NC_014150  30283  31614  1332  AAA ATPase central domain protein  YP_003632335  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0026  CDS  NC_014150  31657  32154  498  hypothetical protein  YP_003632336  normal  0.852331  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0027  CDS  NC_014150  32171  32500  330  hypothetical protein  YP_003632337  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0028  CDS  NC_014150  32513  32899  387  hypothetical protein  YP_003632338  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0029  CDS  NC_014150  32902  33447  546  hypothetical protein  YP_003632339  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0030  CDS  NC_014150  33457  33870  414  hypothetical protein  YP_003632340  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0031  CDS  NC_014150  33890  34120  231  hypothetical protein  YP_003632341  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0032  CDS  NC_014150  34156  35343  1188  Capsule synthesis protein, CapA  YP_003632342  normal  0.563184  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0033  CDS  NC_014150  35394  36797  1404  protein of unknown function DUF21  YP_003632343  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0034  CDS  NC_014150  36816  37502  687  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  YP_003632344  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0035  CDS  NC_014150  37514  37990  477  CheC domain protein  YP_003632345  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0036  CDS  NC_014150  38394  42116  3723  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_003632346  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0037  CDS  NC_014150  42485  43477  993  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_003632347  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0038  CDS  NC_014150  43554  44540  987  PSP1 domain protein  YP_003632348  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0039  CDS  NC_014150  44709  45326  618  hypothetical protein  YP_003632349  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0040  CDS  NC_014150  45323  48019  2697  lipoprotein  YP_003632350  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0041  CDS  NC_014150  48182  49216  1035  hypothetical protein  YP_003632351  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0042  CDS  NC_014150  49737  50429  693  channel protein, hemolysin III family  YP_003632352  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0043  CDS  NC_014150  50511  51551  1041  tRNA 2-selenouridine synthase  YP_003632353  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0044  CDS  NC_014150  51576  53417  1842  excinuclease ABC, C subunit  YP_003632354  normal  0.101531  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0045  CDS  NC_014150  53433  54557  1125  Radical SAM domain protein  YP_003632355  normal  0.120726  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0046  CDS  NC_014150  54735  55670  936  hypothetical protein  YP_003632356  normal  0.115392  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0047  CDS  NC_014150  55955  57307  1353  nucleoside recognition domain protein  YP_003632357  normal  0.307144  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0048  CDS  NC_014150  57332  58126  795  phenazine biosynthesis protein PhzF family  YP_003632358  normal  0.521637  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0049  CDS  NC_014150  58200  58994  795  Hydroxyethylthiazole kinase  YP_003632359  normal  0.144065  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0050  CDS  NC_014150  59123  60061  939  Bile acid:sodium symporter  YP_003632360  hitchhiker  0.00660635  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0051  CDS  NC_014150  60091  61176  1086  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_003632361  hitchhiker  0.00126649  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0052  CDS  NC_014150  61499  63181  1683  dihydroxy-acid dehydratase  YP_003632362  hitchhiker  0.00527668  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0053  CDS  NC_014150  63483  65420  1938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003632363  hitchhiker  0.000916885  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0054  CDS  NC_014150  65487  67364  1878  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003632364  normal  0.412311  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0055  CDS  NC_014150  67439  68569  1131  glycosyl transferase group 1  YP_003632365  normal  0.557703  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0056  CDS  NC_014150  68688  69641  954  putative esterase  YP_003632366  normal  0.728822  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0057  CDS  NC_014150  70115  71041  927  hypothetical protein  YP_003632367  normal  0.0366699  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0058  CDS  NC_014150  71046  71657  612  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  YP_003632368  hitchhiker  0.00166064  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0059  CDS  NC_014150  72127  73713  1587  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  YP_003632369  hitchhiker  7.94981e-05  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0060  CDS  NC_014150  73700  75136  1437  von Willebrand factor type A  YP_003632370  hitchhiker  1.04862e-09  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0061  CDS  NC_014150  75141  75968  828  glutamate racemase  YP_003632371  hitchhiker  5.21676e-17  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0062  CDS  NC_014150  76145  76393  249  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  YP_003632372  decreased coverage  5.26498e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0063  CDS  NC_014150  76421  78232  1812  Pyruvate carboxylase  YP_003632373  hitchhiker  3.88454e-14  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0064  CDS  NC_014150  78264  79640  1377  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  YP_003632374  hitchhiker  8.25924e-06  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0065  CDS  NC_014150  79933  80871  939  glycosyl transferase family 2  YP_003632375  hitchhiker  0.000100424  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0066  CDS  NC_014150  80861  82399  1539  glycosyl transferase family 39  YP_003632376  normal  0.545213  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0067  CDS  NC_014150  82452  83408  957  Uncharacterized conserved protein UCP018688  YP_003632377  normal  0.324653  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0068    NC_014150  83477  84028  552      normal  0.74747  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0069  CDS  NC_014150  84149  84481  333  transcriptional regulator, HxlR family  YP_003632378  normal  0.700237  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0070  CDS  NC_014150  84482  85015  534  hypothetical protein  YP_003632379  normal  0.638734  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0071  CDS  NC_014150  85015  86322  1308  protein of unknown function UPF0118  YP_003632380  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0072  CDS  NC_014150  86751  87104  354  Ankyrin  YP_003632381  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0073  CDS  NC_014150  87107  88867  1761  hypothetical protein  YP_003632382  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0074  CDS  NC_014150  89287  92457  3171  acriflavin resistance protein  YP_003632383  normal  0.247567  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0075  CDS  NC_014150  92531  94036  1506  putative outer membrane component of multidrug efflux  YP_003632384  normal  0.0947347  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0076  CDS  NC_014150  94259  94966  708  transcriptional regulator, GntR family  YP_003632385  normal  0.15859  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0077  CDS  NC_014150  95160  97091  1932  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  YP_003632386  normal  0.569592  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0078  CDS  NC_014150  97208  98878  1671  alpha,alpha-phosphotrehalase  YP_003632387  normal  0.220549  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0079  CDS  NC_014150  99052  99618  567  transcriptional regulator, TetR family  YP_003632388  normal  0.0990564  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0080  CDS  NC_014150  99722  100723  1002  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  YP_003632389  normal  0.273658  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0081  CDS  NC_014150  100724  101131  408  hypothetical protein  YP_003632390  normal  0.441178  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0082  CDS  NC_014150  101250  102308  1059  protein of unknown function DUF1385  YP_003632391  normal  0.547452  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0083  CDS  NC_014150  102299  103426  1128  hypothetical protein  YP_003632392  normal  0.732085  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0084  CDS  NC_014150  103426  104454  1029  putative transcriptional regulator  YP_003632393  normal  0.499568  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0085  CDS  NC_014150  104532  106619  2088  glutamine synthetase catalytic region  YP_003632394  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0086  CDS  NC_014150  106753  107571  819  hypothetical protein  YP_003632395  normal  0.834145  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0087  CDS  NC_014150  107576  108709  1134  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  YP_003632396  normal  0.515449  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0088  CDS  NC_014150  108737  109330  594  CheD  YP_003632397  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0089  CDS  NC_014150  109346  110197  852  MCP methyltransferase, CheR-type  YP_003632398  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0090  CDS  NC_014150  110220  110750  531  CheW protein  YP_003632399  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0091  CDS  NC_014150  110762  112870  2109  CheA signal transduction histidine kinase  YP_003632400  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0092  CDS  NC_014150  112930  113298  369  response regulator receiver protein  YP_003632401  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0093  CDS  NC_014150  113318  113581  264  anti-sigma-factor antagonist  YP_003632402  normal  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0094  CDS  NC_014150  113606  115537  1932  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003632403  normal  0.378453  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0095  CDS  NC_014150  115850  117742  1893  NAD+ synthetase  YP_003632404  normal  0.0107801  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0096  CDS  NC_014150  117889  118476  588  flavin-nucleotide-binding protein  YP_003632405  hitchhiker  2.83829e-06  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0097  CDS  NC_014150  118593  119582  990  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_003632406  hitchhiker  1.20969e-11  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0098  CDS  NC_014150  119604  120239  636  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_003632407  hitchhiker  4.43926e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0099  CDS  NC_014150  120390  121082  693  Ankyrin  YP_003632408  unclonable  1.52071e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0100    NC_014150  121330  122003  674      hitchhiker  5.8336e-18  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>