4250 genes were found for organism Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sterm_0001  CDS  NC_013517  361  1719  1359  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003306820  decreased coverage  0.0000000330873  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0002  CDS  NC_013517  1805  2017  213  RNA-binding S4 domain protein  YP_003306821  hitchhiker  0.000000678168  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0003  CDS  NC_013517  2019  3107  1089  DNA replication and repair protein RecF  YP_003306822  hitchhiker  0.0000115018  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0004  CDS  NC_013517  3100  3960  861  protein of unknown function DUF721  YP_003306823  hitchhiker  0.000131484  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0005  CDS  NC_013517  3962  4213  252  hypothetical protein  YP_003306824  hitchhiker  0.0000225955  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0006  CDS  NC_013517  4237  4917  681  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  YP_003306825  hitchhiker  0.000077593  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0007  CDS  NC_013517  5057  6985  1929  DNA gyrase, B subunit  YP_003306826  hitchhiker  0.000235506  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0008  CDS  NC_013517  7000  9459  2460  DNA gyrase, A subunit  YP_003306827  normal  0.163769  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0009  CDS  NC_013517  9477  10232  756  hypothetical protein  YP_003306828  normal  0.0212245  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0010  CDS  NC_013517  10503  11189  687  hypothetical protein  YP_003306829  hitchhiker  0.00691899  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0011  CDS  NC_013517  11398  11862  465  phosphodiesterase, MJ0936 family  YP_003306830  hitchhiker  0.00169497  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0012  CDS  NC_013517  12200  12949  750  transcriptional regulator, DeoR family  YP_003306831  hitchhiker  0.0000515995  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0013  CDS  NC_013517  13279  20109  6831  Autotransporter beta- domain protein  YP_003306832  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0014  CDS  NC_013517  20328  20906  579  hypothetical protein  YP_003306833  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0015  CDS  NC_013517  20984  21382  399  hypothetical protein  YP_003306834  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0016  CDS  NC_013517  21428  21961  534  metallophosphoesterase  YP_003306835  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0017  CDS  NC_013517  22107  23291  1185  amidohydrolase  YP_003306836  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0018  CDS  NC_013517  23383  24918  1536  AbgT putative transporter  YP_003306837  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0019  CDS  NC_013517  25102  26586  1485  lysyl-tRNA synthetase  YP_003306838  hitchhiker  0.00231338  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0020  CDS  NC_013517  26657  27025  369  hypothetical protein  YP_003306839  hitchhiker  0.00000180326  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0021  CDS  NC_013517  27031  27423  393  hypothetical protein  YP_003306840  hitchhiker  0.0000000277456  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0022  CDS  NC_013517  27446  27913  468  protein of unknown function DUF163  YP_003306841  unclonable  0.000000000120768  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0023  CDS  NC_013517  27980  29845  1866  DNA mismatch repair protein MutL  YP_003306842  hitchhiker  0.000000493473  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0024  CDS  NC_013517  29838  30521  684  thymidylate kinase  YP_003306843  hitchhiker  0.0000000063864  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0025  CDS  NC_013517  30633  33161  2529  TPR repeat-containing protein  YP_003306844  hitchhiker  0.00000698246  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0026  CDS  NC_013517  33307  34998  1692  dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_003306845  hitchhiker  0.00000184744  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0027  CDS  NC_013517  35018  36346  1329  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  YP_003306846  normal  0.345712  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0028  CDS  NC_013517  36386  37369  984  Transketolase central region  YP_003306847  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0029  CDS  NC_013517  37512  38474  963  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  YP_003306848  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0030  CDS  NC_013517  38491  38964  474  hypothetical protein  YP_003306849  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0031  CDS  NC_013517  38983  39255  273  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  YP_003306850  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0032  CDS  NC_013517  39365  40123  759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003306851  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0033  CDS  NC_013517  40487  40771  285  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  YP_003306852  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0034  CDS  NC_013517  40793  42157  1365  PTS system Galactitol-specific IIC component  YP_003306853  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0035  CDS  NC_013517  42177  42821  645  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  YP_003306854  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0036  CDS  NC_013517  42838  44199  1362  PTS system Galactitol-specific IIC component  YP_003306855  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0037  CDS  NC_013517  44438  44890  453  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  YP_003306856  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0038  CDS  NC_013517  44895  47006  2112  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  YP_003306857  normal  0.977169  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0039  CDS  NC_013517  47513  48256  744  transcriptional regulator, DeoR family  YP_003306858  hitchhiker  0.000112771  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0040  CDS  NC_013517  48275  48913  639  class II aldolase/adducin family protein  YP_003306859  hitchhiker  0.000104047  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0041  CDS  NC_013517  48926  49951  1026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_003306860  hitchhiker  0.00000412094  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0042  CDS  NC_013517  50332  50982  651  hypothetical protein  YP_003306861  hitchhiker  0.00000000346701  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0043  CDS  NC_013517  51123  51767  645  hypothetical protein  YP_003306862  unclonable  0.000000000215417  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0044  CDS  NC_013517  51809  52177  369  Endoribonuclease L-PSP  YP_003306863  hitchhiker  0.000312648  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0045  CDS  NC_013517  52215  52607  393  hypothetical protein  YP_003306864  hitchhiker  0.00610389  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0046  CDS  NC_013517  52675  53064  390  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_003306865  normal  0.0272379  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0047  CDS  NC_013517  53141  53905  765  transcriptional regulator, AraC family  YP_003306866  normal  0.230347  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0048  CDS  NC_013517  53955  54710  756  hypothetical protein  YP_003306867  normal  0.192995  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0049  CDS  NC_013517  54836  56347  1512  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003306868  normal  0.492583  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0050  CDS  NC_013517  56363  57511  1149  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_003306869  normal  0.132652  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0051  CDS  NC_013517  57520  58440  921  phosphatidate cytidylyltransferase  YP_003306870  hitchhiker  0.000904282  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0052  CDS  NC_013517  58430  59125  696  undecaprenyl diphosphate synthase  YP_003306871  hitchhiker  0.0000100505  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0053  CDS  NC_013517  59290  59616  327  hypothetical protein  YP_003306872  decreased coverage  0.0000000141355  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0054  CDS  NC_013517  59787  60812  1026  hypothetical protein  YP_003306873  decreased coverage  0.000000167469  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0055  CDS  NC_013517  61085  61978  894  transcriptional regulator, LysR family  YP_003306874  hitchhiker  0.000650557  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0056  CDS  NC_013517  62145  62285  141  hypothetical protein  YP_003306875  normal  0.0105771  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0057  CDS  NC_013517  62398  62814  417  hypothetical protein  YP_003306876  normal  0.0312411  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0058  CDS  NC_013517  62919  64232  1314  hypothetical protein  YP_003306877  normal  0.86027  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0059  CDS  NC_013517  64536  64949  414  hypothetical protein  YP_003306878  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0060  CDS  NC_013517  64953  65882  930  hypothetical protein  YP_003306879  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0061  CDS  NC_013517  66020  66505  486  hypothetical protein  YP_003306880  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0062  CDS  NC_013517  66875  72079  5205  hypothetical protein  YP_003306881  normal  0.164201  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0063  CDS  NC_013517  72153  72617  465  hypothetical protein  YP_003306882  decreased coverage  0.000000492485  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0064  CDS  NC_013517  72845  75136  2292  hypothetical protein  YP_003306883  hitchhiker  0.00226293  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0065  CDS  NC_013517  75120  75443  324  hypothetical protein  YP_003306884  normal  0.0686321  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0066  CDS  NC_013517  75499  76134  636  hypothetical protein  YP_003306885  normal  0.181882  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0067  CDS  NC_013517  76139  76759  621  hypothetical protein  YP_003306886  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0068  CDS  NC_013517  76761  77159  399  hypothetical protein  YP_003306887  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0069  CDS  NC_013517  77181  77555  375  hypothetical protein  YP_003306888  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0070  CDS  NC_013517  77927  78076  150  hypothetical protein  YP_003306889  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0071  CDS  NC_013517  78189  78626  438  hypothetical protein  YP_003306890  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0072  CDS  NC_013517  78637  79086  450  hypothetical protein  YP_003306891  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0073    NC_013517  79373  79544  172      normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0074    NC_013517  79615  80385  771      normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0075    NC_013517  80453  80530  78      normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0076  CDS  NC_013517  81150  81632  483  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  YP_003306892  normal  0.208777  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0077  CDS  NC_013517  81739  82296  558  ribosome recycling factor  YP_003306893  normal  0.010398  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0078  CDS  NC_013517  82330  83040  711  uridylate kinase  YP_003306894  hitchhiker  0.000395488  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0079  CDS  NC_013517  83092  83976  885  translation elongation factor Ts  YP_003306895  hitchhiker  0.000000572472  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0080  CDS  NC_013517  84024  84815  792  ribosomal protein S2  YP_003306896  unclonable  0.000000000155744  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0081  CDS  NC_013517  86101  87204  1104  hypothetical protein  YP_003306897  hitchhiker  0.00405626  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0082  CDS  NC_013517  87452  88537  1086  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  YP_003306898  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0083  CDS  NC_013517  88736  90148  1413  signal transduction histidine kinase  YP_003306899  normal  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0084  CDS  NC_013517  90149  90877  729  response regulator receiver and ANTAR domain protein  YP_003306900  normal  0.682854  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0085  CDS  NC_013517  91313  91960  648  hypothetical protein  YP_003306901  normal  0.152617  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0086  CDS  NC_013517  92057  92998  942  transcriptional regulator, AraC family  YP_003306902  normal  0.353006  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0087  CDS  NC_013517  93597  94865  1269  Endoribonuclease L-PSP  YP_003306903  normal  0.381775  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0088  CDS  NC_013517  95196  95909  714  hypothetical protein  YP_003306904  normal  0.190673  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0089  CDS  NC_013517  96405  97082  678  hypothetical protein  YP_003306905  normal  0.0669519  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0090  CDS  NC_013517  97159  100113  2955  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003306906  unclonable  0.00000165147  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0091  CDS  NC_013517  100123  101043  921  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_003306907  unclonable  0.000000000878302  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0092  CDS  NC_013517  101366  102703  1338  hypothetical protein  YP_003306908  unclonable  0.00000000278192  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0093  CDS  NC_013517  102709  102957  249  RNA-binding S4 domain protein  YP_003306909  unclonable  0.0000000000415805  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0094  CDS  NC_013517  102954  103811  858  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  YP_003306910  unclonable  0.000000000449957  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0095  CDS  NC_013517  104012  104311  300  SpoVG family protein  YP_003306911  unclonable  0.0000000000535808  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0096  CDS  NC_013517  104480  105043  564  transferase hexapeptide repeat containing protein  YP_003306912  unclonable  0.000000000143526  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0097  CDS  NC_013517  105127  105699  573  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_003306913  unclonable  0.00000000012965  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0098  CDS  NC_013517  105733  106422  690  ABC transporter related protein  YP_003306914  hitchhiker  0.0000000337151  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0099  CDS  NC_013517  106415  107269  855  hypothetical protein  YP_003306915  hitchhiker  0.00000333813  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0100  CDS  NC_013517  107409  107585  177  hypothetical protein  YP_003306916  hitchhiker  0.00000927044  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>