1916 genes were found for organism Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 20    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Apre_0001  CDS  NC_013171  254  1633  1380  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003151777  normal  0.0161542  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0002  CDS  NC_013171  1858  2970  1113  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003151778  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0003  CDS  NC_013171  2978  3184  207  S4 domain-containing protein  YP_003151779  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0004  CDS  NC_013171  3184  4263  1080  DNA replication and repair protein RecF  YP_003151780  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0005  CDS  NC_013171  4265  6166  1902  DNA gyrase, B subunit  YP_003151781  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0006  CDS  NC_013171  6175  8619  2445  DNA gyrase, A subunit  YP_003151782  normal  0.0624353  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0007  CDS  NC_013171  8612  8917  306  anti-sigma-factor antagonist  YP_003151783  hitchhiker  0.000178812  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0008  CDS  NC_013171  8919  9254  336  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_003151784  hitchhiker  7.43678e-07  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0009  CDS  NC_013171  9254  10021  768  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  YP_003151785  decreased coverage  4.98773e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0010  CDS  NC_013171  10128  11432  1305  hypothetical protein  YP_003151786  decreased coverage  4.57156e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0011  CDS  NC_013171  11578  11877  300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  YP_003151787  hitchhiker  1.57017e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0012  CDS  NC_013171  11908  12858  951  hypothetical protein  YP_003151788  hitchhiker  1.37137e-07  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0013  CDS  NC_013171  13115  14884  1770  peptidoglycan hydrolase  YP_003151789  hitchhiker  0.0013556  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0014  CDS  NC_013171  15199  17343  2145  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003151790  normal  0.021356  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0015  CDS  NC_013171  17737  19923  2187  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003151791  unclonable  9.73096e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0016  CDS  NC_013171  20264  21226  963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003151792  unclonable  4.61837e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0017  CDS  NC_013171  21228  23204  1977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003151793  normal  0.0118989  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0018  CDS  NC_013171  23213  24211  999  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_003151794  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0019  CDS  NC_013171  24204  25817  1614  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_003151795  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0020  CDS  NC_013171  25814  26002  189  hypothetical protein  YP_003151796  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0021  CDS  NC_013171  26241  28064  1824  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  YP_003151797  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0022  CDS  NC_013171  28241  28432  192  hypothetical protein  YP_003151798  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0023  CDS  NC_013171  28752  29039  288  hypothetical protein  YP_003151799  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0024  CDS  NC_013171  29207  29470  264  protein of unknown function DUF1232  YP_003151800  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0025  CDS  NC_013171  29730  30908  1179  hypothetical protein  YP_003151801  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0026  CDS  NC_013171  30911  32014  1104  hypothetical protein  YP_003151802  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0027  CDS  NC_013171  32096  33334  1239  transcriptional regulator, AraC family  YP_003151803  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0028  CDS  NC_013171  33687  35099  1413  amino acid carrier protein  YP_003151804  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0029  CDS  NC_013171  35142  36074  933  carbamate kinase  YP_003151805  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0030  CDS  NC_013171  36092  38596  2505  ATPase AAA-2 domain protein  YP_003151806  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0031  CDS  NC_013171  38620  39624  1005  ornithine carbamoyltransferase  YP_003151807  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0032  CDS  NC_013171  39714  40685  972  hypothetical protein  YP_003151808  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0033  CDS  NC_013171  40825  41142  318  hypothetical protein  YP_003151809  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0034  CDS  NC_013171  41142  43217  2076  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_003151810  normal  0.205705  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0035  CDS  NC_013171  43275  44069  795  transcriptional regulator, DeoR family  YP_003151811  hitchhiker  0.000906536  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0036  CDS  NC_013171  44266  44934  669  deoxyribose-phosphate aldolase  YP_003151812  hitchhiker  0.000477173  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0037  CDS  NC_013171  44943  46118  1176  phosphopentomutase  YP_003151813  hitchhiker  7.00156e-05  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0038  CDS  NC_013171  46128  47330  1203  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  YP_003151814  decreased coverage  9.07116e-05  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0039  CDS  NC_013171  47341  48642  1302  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  YP_003151815  normal  0.0183104  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0040  CDS  NC_013171  48911  50134  1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_003151816  normal  0.268434  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0041  CDS  NC_013171  50318  51328  1011  ornithine carbamoyltransferase  YP_003151817  normal  0.978727  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0042  CDS  NC_013171  51684  52652  969  protein of unknown function DUF534  YP_003151818  normal  0.920382  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0043  CDS  NC_013171  52662  53531  870  inner-membrane translocator  YP_003151819  normal  0.963469  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0044  CDS  NC_013171  53524  54279  756  ABC transporter related  YP_003151820  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0045  CDS  NC_013171  54572  55000  429  transcriptional regulator, ArsR family  YP_003151821  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0046  CDS  NC_013171  55273  56490  1218  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003151822  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0047  CDS  NC_013171  56541  58079  1539  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  YP_003151823  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0048  CDS  NC_013171  58081  58650  570  peroxiredoxin  YP_003151824  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0049  CDS  NC_013171  59390  60262  873  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_003151825  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0050  CDS  NC_013171  60330  61238  909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_003151826  normal  0.71429  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0051  CDS  NC_013171  61401  62537  1137  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003151827  normal  0.115612  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0052  CDS  NC_013171  62611  64248  1638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003151828  normal  0.102963  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0053  CDS  NC_013171  64220  65149  930  ABC transporter related  YP_003151829  normal  0.916211  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0054  CDS  NC_013171  65146  66342  1197  glycosyl transferase group 1  YP_003151830  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0055  CDS  NC_013171  66640  67743  1104  glycerate kinase  YP_003151831  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0056  CDS  NC_013171  67766  68443  678  Rhomboid family protein  YP_003151832  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0057  CDS  NC_013171  68445  69269  825  hypothetical protein  YP_003151833  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0058  CDS  NC_013171  69278  71056  1779  oligoendopeptidase F  YP_003151834  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0059  CDS  NC_013171  71166  72803  1638  ABC-1 domain protein  YP_003151835  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0060  CDS  NC_013171  72909  73631  723  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_003151836  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0061  CDS  NC_013171  73722  75110  1389  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003151837  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0062  CDS  NC_013171  75110  75967  858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003151838  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0063  CDS  NC_013171  75954  76829  876  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003151839  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0064  CDS  NC_013171  76832  77974  1143  ABC transporter related  YP_003151840  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0065  CDS  NC_013171  78024  78572  549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  YP_003151841  normal  0.73098  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0066  CDS  NC_013171  78650  79531  882  Radical SAM domain protein  YP_003151842  normal  0.628263  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0067    NC_013171  79558  81119  1562      normal  0.0954502  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0068  CDS  NC_013171  87243  87959  717  hypothetical protein  YP_003151843  hitchhiker  4.05195e-07  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0069  CDS  NC_013171  88131  88583  453  Galactose-6-phosphate isomerase  YP_003151844  decreased coverage  1.7744e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0070  CDS  NC_013171  88593  89123  531  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  YP_003151845  hitchhiker  1.49222e-06  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0071  CDS  NC_013171  89224  90570  1347  melibiose:sodium symporter  YP_003151846  hitchhiker  0.00245996  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0072  CDS  NC_013171  90619  92838  2220  glycoside hydrolase clan GH-D  YP_003151847  normal  0.723397  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0073  CDS  NC_013171  92883  93632  750  transcriptional regulator, DeoR family  YP_003151848  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0074    NC_013171  93945  94530  586      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0075  CDS  NC_013171  94629  95762  1134  sugar isomerase (SIS)  YP_003151849  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0076  CDS  NC_013171  95768  96469  702  transcriptional regulator, GntR family  YP_003151850  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0077  CDS  NC_013171  96484  97611  1128  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  YP_003151851  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0078  CDS  NC_013171  97608  98534  927  1-phosphofructokinase  YP_003151852  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0079  CDS  NC_013171  98534  99517  984  Tagatose-bisphosphate aldolase  YP_003151853  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0080  CDS  NC_013171  99563  100249  687  hypothetical protein  YP_003151854  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0081  CDS  NC_013171  100544  102472  1929  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003151855  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0082  CDS  NC_013171  102485  103729  1245  beta-lactamase domain protein  YP_003151856  normal  0.143007  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0083  CDS  NC_013171  104092  105606  1515  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  YP_003151857  unclonable  6.36511e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0084  CDS  NC_013171  105887  106513  627  hypothetical protein  YP_003151858  decreased coverage  4.35503e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0085  CDS  NC_013171  106649  106975  327  hypothetical protein  YP_003151859  hitchhiker  2.13707e-07  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0086  CDS  NC_013171  107132  107803  672  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003151860  hitchhiker  4.30601e-06  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0087  CDS  NC_013171  107793  108902  1110  histidine kinase  YP_003151861  hitchhiker  0.00115186  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0088  CDS  NC_013171  108949  109095  147  hypothetical protein  YP_003151862  normal  0.0449568  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0089  CDS  NC_013171  109088  109945  858  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003151863  normal  0.194579  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0090  CDS  NC_013171  109935  110630  696  Redoxin domain protein  YP_003151864  normal  0.246189  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0091  CDS  NC_013171  110770  112533  1764  hypothetical protein  YP_003151865  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0092  CDS  NC_013171  112770  114188  1419  fumarate lyase  YP_003151866  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0093  CDS  NC_013171  114191  115555  1365  fumarate lyase  YP_003151867  normal  0.0337943  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0094  CDS  NC_013171  115552  116700  1149  hypothetical protein  YP_003151868  hitchhiker  4.2098e-05  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0095  CDS  NC_013171  116770  117216  447  MaoC domain protein dehydratase  YP_003151869  decreased coverage  5.82569e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0096  CDS  NC_013171  117514  118740  1227  sodium:dicarboxylate symporter  YP_003151870  hitchhiker  4.35647e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0097  CDS  NC_013171  118822  119484  663  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  YP_003151871  hitchhiker  5.99373e-05  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0098  CDS  NC_013171  119486  120361  876  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  YP_003151872  hitchhiker  0.000117533  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0099  CDS  NC_013171  120408  121814  1407  amino acid carrier protein  YP_003151873  hitchhiker  0.00900834  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0100  CDS  NC_013171  122156  123520  1365  MATE efflux family protein  YP_003151874  normal  0.0456451  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 20    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>