1828 genes were found for organism Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Taci_0001  CDS  NC_013522  97  1440  1344  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003316524  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0002  CDS  NC_013522  1689  2828  1140  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003316525  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0003  CDS  NC_013522  2818  3882  1065  DNA replication and repair protein RecF  YP_003316526  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0004  CDS  NC_013522  3889  5757  1869  glucose inhibited division protein A  YP_003316527  normal  0.947875  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0005  CDS  NC_013522  5754  6203  450  protein of unknown function DUF721  YP_003316528  normal  0.478726  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0006  CDS  NC_013522  6894  7892  999  2-nitropropane dioxygenase NPD  YP_003316529  hitchhiker  0.00157351  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0007  CDS  NC_013522  7969  8361  393  Superoxide reductase  YP_003316530  decreased coverage  0.000102627  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0008  CDS  NC_013522  8644  10278  1635  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003316531  hitchhiker  0.00260142  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0009  CDS  NC_013522  10495  12129  1635  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003316532  normal  0.327799  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0010  CDS  NC_013522  12190  13116  927  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003316533  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0011  CDS  NC_013522  13129  14052  924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003316534  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0012  CDS  NC_013522  14065  15051  987  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_003316535  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0013  CDS  NC_013522  15052  16017  966  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_003316536  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0014  CDS  NC_013522  16121  17128  1008  glycosyl transferase group 1  YP_003316537  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0015  CDS  NC_013522  17200  17907  708  hypothetical protein  YP_003316538  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0016  CDS  NC_013522  17953  19296  1344  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  YP_003316539  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0017  CDS  NC_013522  19361  20455  1095  GDP-mannose 4,6-dehydratase  YP_003316540  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0018  CDS  NC_013522  20455  21411  957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_003316541  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0019    NC_013522  21408  22402  995      normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0020  CDS  NC_013522  22890  24824  1935  aconitate hydratase  YP_003316542  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0021  CDS  NC_013522  25126  26379  1254  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  YP_003316543  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0022  CDS  NC_013522  26393  26710  318  citrate lyase subunit gamma  YP_003316544  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0023  CDS  NC_013522  26707  27585  879  Citrate (pro-3S)-lyase  YP_003316545  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0024  CDS  NC_013522  27582  29138  1557  citrate lyase, alpha subunit  YP_003316546  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0025  CDS  NC_013522  29218  29685  468  hypothetical protein  YP_003316547  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0026  CDS  NC_013522  29682  30878  1197  hypothetical protein  YP_003316548  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0027  CDS  NC_013522  30981  32099  1119  peptidase T-like protein  YP_003316549  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0028  CDS  NC_013522  32160  33698  1539  AbgT putative transporter  YP_003316550  normal  0.790153  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0029  CDS  NC_013522  34109  35317  1209  ornithine aminotransferase  YP_003316551  normal  0.628841  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0030  CDS  NC_013522  35610  38693  3084  acriflavin resistance protein  YP_003316552  normal  0.0439457  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0031  CDS  NC_013522  38693  39871  1179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  YP_003316553  hitchhiker  3.23168e-05  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0032  CDS  NC_013522  40007  40717  711  hypothetical protein  YP_003316554  unclonable  6.31349e-09  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0033  CDS  NC_013522  40717  41991  1275  histidinol dehydrogenase  YP_003316555  unclonable  3.80077e-08  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0034  CDS  NC_013522  42034  42960  927  PfkB domain protein  YP_003316556  normal  0.0204225  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0035  CDS  NC_013522  42962  43522  561  DSBA oxidoreductase  YP_003316557  normal  0.88491  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0036  CDS  NC_013522  44107  45252  1146  glycosyl transferase group 1  YP_003316558  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0037  CDS  NC_013522  45310  46449  1140  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  YP_003316559  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0038  CDS  NC_013522  46442  47074  633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  YP_003316560  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0039  CDS  NC_013522  47078  48940  1863  polysaccharide biosynthesis protein CapD  YP_003316561  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0040  CDS  NC_013522  48937  49686  750  transferase hexapeptide repeat containing protein  YP_003316562  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0041  CDS  NC_013522  49689  50678  990  Porphobilinogen synthase  YP_003316563  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0042  CDS  NC_013522  50680  51972  1293  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  YP_003316564  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0043  CDS  NC_013522  51982  53466  1485  uroporphyrin-III C-methyltransferase  YP_003316565  normal  0.655247  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0044  CDS  NC_013522  53463  54386  924  porphobilinogen deaminase  YP_003316566  normal  0.0780784  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0045  CDS  NC_013522  54383  54844  462  Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)-like protein  YP_003316567  normal  0.407819  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0046  CDS  NC_013522  54841  55704  864  Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase-like protein  YP_003316568  normal  0.627045  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0047  CDS  NC_013522  55701  56609  909  hypothetical protein  YP_003316569  normal  0.369746  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0048  CDS  NC_013522  56600  57289  690  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_003316570  normal  0.837851  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0049  CDS  NC_013522  57335  59809  2475  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_003316571  normal  0.749856  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0050  CDS  NC_013522  59806  60573  768  precorrin-4 C11-methyltransferase  YP_003316572  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0051  CDS  NC_013522  60570  61808  1239  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  YP_003316573  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0052  CDS  NC_013522  61808  62887  1080  cobalamin biosynthesis protein CbiD  YP_003316574  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0053  CDS  NC_013522  62890  63786  897  periplasmic binding protein  YP_003316575  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0054  CDS  NC_013522  63870  64772  903  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  YP_003316576  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0055  CDS  NC_013522  64820  65446  627  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  YP_003316577  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0056  CDS  NC_013522  65709  66524  816  zinc/iron permease  YP_003316578  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0057  CDS  NC_013522  66529  67359  831  periplasmic solute binding protein  YP_003316579  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0058  CDS  NC_013522  67557  68687  1131  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  YP_003316580  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0059  CDS  NC_013522  68684  70837  2154  metal dependent phosphohydrolase  YP_003316581  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0060  CDS  NC_013522  70905  71750  846  spermidine synthase  YP_003316582  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0061  CDS  NC_013522  71755  74619  2865  cobyric acid synthase CobQ  YP_003316583  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0062  CDS  NC_013522  74606  74986  381  translation initiation factor SUI1  YP_003316584  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0063  CDS  NC_013522  74992  75813  822  diaminopimelate epimerase  YP_003316585  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0064  CDS  NC_013522  75810  76823  1014  TrkA-N domain protein  YP_003316586  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0065  CDS  NC_013522  76894  77673  780  exodeoxyribonuclease III Xth  YP_003316587  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0066  CDS  NC_013522  77670  78527  858  GHMP kinase  YP_003316588  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0067  CDS  NC_013522  78505  78957  453  hypothetical protein  YP_003316589  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0068  CDS  NC_013522  79011  80270  1260  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003316590  normal  0.774441  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0069  CDS  NC_013522  80298  81005  708  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_003316591  normal  0.571737  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0070  CDS  NC_013522  81616  82977  1362  Ethanolamine ammonia-lyase  YP_003316592  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0071  CDS  NC_013522  82993  83886  894  Ethanolamine ammonia-lyase  YP_003316593  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0072  CDS  NC_013522  83915  84568  654  microcompartments protein  YP_003316594  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0073  CDS  NC_013522  84592  85119  528  microcompartments protein  YP_003316595  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0074  CDS  NC_013522  85110  86567  1458  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  YP_003316596  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0075  CDS  NC_013522  86623  86922  300  microcompartments protein  YP_003316597  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0076  CDS  NC_013522  86943  87569  627  Propanediol utilization protein  YP_003316598  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0077  CDS  NC_013522  87566  88414  849  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  YP_003316599  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0078  CDS  NC_013522  88420  89088  669  hypothetical protein  YP_003316600  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0079  CDS  NC_013522  89085  89357  273  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  YP_003316601  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0080  CDS  NC_013522  89400  90512  1113  Ethanolamine utilisation protein EutH  YP_003316602  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0081  CDS  NC_013522  90529  91092  564  Ethanolamine utilisation EutQ family protein  YP_003316603  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0082  CDS  NC_013522  91106  91870  765  cobalamin adenosyltransferase  YP_003316604  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0083  CDS  NC_013522  91890  93320  1431  Ethanolamine utilisation EutA  YP_003316605  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0084  CDS  NC_013522  93332  94681  1350  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  YP_003316606  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0085  CDS  NC_013522  94678  95226  549  microcompartments protein  YP_003316607  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0086  CDS  NC_013522  95223  95666  444  ethanolamine utilization protein-like protein  YP_003316608  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0087  CDS  NC_013522  95663  96001  339  microcompartments protein  YP_003316609  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0088  CDS  NC_013522  96109  96897  789  Lytic transglycosylase catalytic  YP_003316610  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0089  CDS  NC_013522  97130  98893  1764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003316611  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0090  CDS  NC_013522  98894  99580  687  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003316612  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0091  CDS  NC_013522  99577  100272  696  phosphate uptake regulator, PhoU  YP_003316613  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0092  CDS  NC_013522  100289  101056  768  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  YP_003316614  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0093  CDS  NC_013522  101093  101947  855  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  YP_003316615  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0094  CDS  NC_013522  101944  102891  948  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  YP_003316616  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0095  CDS  NC_013522  102907  103725  819  phosphate binding protein  YP_003316617  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0096  CDS  NC_013522  103900  104655  756  PAS fold-4 domain protein  YP_003316618  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0097  CDS  NC_013522  104628  105587  960  putative PAS/PAC sensor protein  YP_003316619  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0098  CDS  NC_013522  105592  107520  1929  diguanylate cyclase with GAF sensor  YP_003316620  normal  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0099  CDS  NC_013522  107546  109405  1860  oligoendopeptidase F  YP_003316621  normal  0.893555  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Taci_0100  CDS  NC_013522  109530  110285  756  extracellular solute-binding protein family 3  YP_003316622  normal  0.246862  n/a    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>