2346 genes were found for organism Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sdel_0001  CDS  NC_013512  36  650  615  thymidylate synthase, flavin-dependent  YP_003303074  normal  0.248117  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0002  CDS  NC_013512  647  1120  474  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  YP_003303075  normal  0.075802  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0003  CDS  NC_013512  1277  2602  1326  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003303076  hitchhiker  0.00105638  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0004  CDS  NC_013512  2758  3825  1068  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003303077  unclonable  2.63126e-08  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0005  CDS  NC_013512  3856  6168  2313  DNA gyrase, B subunit  YP_003303078  normal  0.19711  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0006  CDS  NC_013512  6168  7583  1416  EAL domain protein  YP_003303079  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0007  CDS  NC_013512  7570  7965  396  7-cyano-7-deazaguanine reductase  YP_003303080  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0008  CDS  NC_013512  7959  9170  1212  hypothetical protein  YP_003303081  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0009  CDS  NC_013512  9449  10123  675  uracil-DNA glycosylase  YP_003303082  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0010  CDS  NC_013512  10108  11061  954  A/G-specific adenine glycosylase  YP_003303083  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0011  CDS  NC_013512  11250  11366  117  hypothetical protein  YP_003303084  normal  0.46737  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0012  CDS  NC_013512  11353  12540  1188  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  YP_003303085  normal  0.502887  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0013  CDS  NC_013512  12691  13347  657  GntR domain protein  YP_003303086  normal  0.913161  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0014  CDS  NC_013512  13476  14129  654  hypothetical protein  YP_003303087  normal  0.752755  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0015  CDS  NC_013512  14140  14769  630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  YP_003303088  normal  0.492258  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0016  CDS  NC_013512  14952  16025  1074  chemotaxis sensory transducer  YP_003303089  normal  0.760621  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0017  CDS  NC_013512  16239  16715  477  hypothetical protein  YP_003303090  normal  0.336516  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0018  CDS  NC_013512  16716  18305  1590  YidE/YbjL duplication  YP_003303091  normal  0.0175151  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0019  CDS  NC_013512  18411  19619  1209  outer membrane porin  YP_003303092  hitchhiker  0.00360128  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0020  CDS  NC_013512  19797  21416  1620  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  YP_003303093  decreased coverage  0.00232018  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0021  CDS  NC_013512  21480  22415  936  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  YP_003303094  hitchhiker  0.00143513  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0022  CDS  NC_013512  22419  23240  822  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  YP_003303095  hitchhiker  0.00108936  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0023  CDS  NC_013512  23237  24055  819  ABC transporter related protein  YP_003303096  hitchhiker  0.00286476  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0024  CDS  NC_013512  24049  24813  765  ABC transporter related protein  YP_003303097  hitchhiker  0.000767046  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0025  CDS  NC_013512  24823  26124  1302  MATE efflux family protein  YP_003303098  hitchhiker  0.00700816  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0026  CDS  NC_013512  26291  27355  1065  hypothetical protein  YP_003303099  normal  0.228478  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0027  CDS  NC_013512  27359  27571  213  SirA family protein  YP_003303100  normal  0.111426  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0028  CDS  NC_013512  27568  28710  1143  aminotransferase class V  YP_003303101  normal  0.354528  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0029  CDS  NC_013512  28707  28925  219  hypothetical protein  YP_003303102  normal  0.806395  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0030  CDS  NC_013512  29023  29715  693  MOSC domain containing protein  YP_003303103  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0031  CDS  NC_013512  29771  30493  723  hypothetical protein  YP_003303104  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0032  CDS  NC_013512  30493  31815  1323  SMC domain protein  YP_003303105  normal  0.841332  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0033  CDS  NC_013512  31885  32676  792  protein of unknown function DUF52  YP_003303106  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0034  CDS  NC_013512  32705  33247  543  AMMECR1 domain protein  YP_003303107  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0035  CDS  NC_013512  33340  33738  399  hypothetical protein  YP_003303108  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0036  CDS  NC_013512  33742  34638  897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_003303109  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0037  CDS  NC_013512  34604  35176  573  protein of unknown function UPF0227  YP_003303110  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0038  CDS  NC_013512  35375  35659  285  hypothetical protein  YP_003303111  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0039  CDS  NC_013512  35660  37744  2085  molybdopterin oxidoreductase  YP_003303112  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0040  CDS  NC_013512  37904  38188  285  hypothetical protein  YP_003303113  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0041  CDS  NC_013512  39243  40922  1680  dihydroxy-acid dehydratase  YP_003303114  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0042  CDS  NC_013512  40922  41560  639  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  YP_003303115  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0043  CDS  NC_013512  41572  41769  198  hypothetical protein  YP_003303116  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0044  CDS  NC_013512  41826  42695  870  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_003303117  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0045  CDS  NC_013512  42767  44407  1641  CTP synthase  YP_003303118  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0046  CDS  NC_013512  44400  45983  1584  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  YP_003303119  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0047  CDS  NC_013512  45992  46651  660  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  YP_003303120  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0048  CDS  NC_013512  46629  47369  741  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  YP_003303121  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0049  CDS  NC_013512  47374  48396  1023  Ribonucleoside-diphosphate reductase  YP_003303122  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0050  CDS  NC_013512  48524  49219  696  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  YP_003303123  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0051  CDS  NC_013512  49194  49358  165  hypothetical protein  YP_003303124  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0052  CDS  NC_013512  49355  51460  2106  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  YP_003303125  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0053  CDS  NC_013512  51669  52370  702  aspartate racemase  YP_003303126  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0054  CDS  NC_013512  52432  54798  2367  ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit  YP_003303127  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0055  CDS  NC_013512  54798  56126  1329  adenylosuccinate lyase  YP_003303128  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0056  CDS  NC_013512  56244  57152  909  pseudouridine synthase  YP_003303129  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0057  CDS  NC_013512  57154  57768  615  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  YP_003303130  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0058  CDS  NC_013512  57805  57903  99  hypothetical protein  YP_003303131  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0059  CDS  NC_013512  57890  58966  1077  radical SAM enzyme, Cfr family  YP_003303132  normal  0.955574  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0060  CDS  NC_013512  58973  59521  549  hypothetical protein  YP_003303133  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0061  CDS  NC_013512  59518  60276  759  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  YP_003303134  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0062  CDS  NC_013512  60426  61271  846  dimethyladenosine transferase  YP_003303135  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0063  CDS  NC_013512  61237  63231  1995  beta-lactamase domain protein  YP_003303136  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0064  CDS  NC_013512  63242  64207  966  KpsF/GutQ family protein  YP_003303137  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0065  CDS  NC_013512  64208  64993  786  RNA-binding S4 domain protein  YP_003303138  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0066  CDS  NC_013512  64983  66173  1191  AAA ATPase central domain protein  YP_003303139  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0067  CDS  NC_013512  66210  67916  1707  hypothetical protein  YP_003303140  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0068  CDS  NC_013512  67913  68191  279  FlhB domain-containing protein  YP_003303141  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0069  CDS  NC_013512  68208  68993  786  protein of unknown function DUF218  YP_003303142  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0070  CDS  NC_013512  68993  69988  996  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  YP_003303143  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0071  CDS  NC_013512  70080  70685  606  dephospho-CoA kinase  YP_003303144  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0072  CDS  NC_013512  70666  71409  744  diaminopimelate epimerase  YP_003303145  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0073  CDS  NC_013512  71414  72133  720  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  YP_003303146  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0074  CDS  NC_013512  72151  73218  1068  peptide chain release factor 1  YP_003303147  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0075  CDS  NC_013512  73252  73527  276  ribosomal protein S20  YP_003303148  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0076  CDS  NC_013512  73643  75331  1689  TrkA-N domain protein  YP_003303149  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0077  CDS  NC_013512  75342  75719  378  hypothetical protein  YP_003303150  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0078  CDS  NC_013512  75839  77179  1341  phosphoglucosamine mutase  YP_003303151  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0079  CDS  NC_013512  77172  77624  453  lipoprotein signal peptidase  YP_003303152  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0080  CDS  NC_013512  77645  79549  1905  sulfatase  YP_003303153  normal  0.204618  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0081  CDS  NC_013512  79911  81728  1818  threonyl-tRNA synthetase  YP_003303154  hitchhiker  7.16431e-06  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0082  CDS  NC_013512  81725  82240  516  translation initiation factor IF-3  YP_003303155  unclonable  4.96209e-09  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0083  CDS  NC_013512  82362  82556  195  ribosomal protein L35  YP_003303156  unclonable  1.92427e-09  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0084  CDS  NC_013512  82670  83023  354  ribosomal protein L20  YP_003303157  unclonable  3.55513e-09  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0085  CDS  NC_013512  83077  84435  1359  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  YP_003303158  unclonable  9.22183e-08  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0086  CDS  NC_013512  84446  85114  669  hypothetical protein  YP_003303159  hitchhiker  1.34382e-05  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0087  CDS  NC_013512  85315  85527  213  ribosomal protein S21  YP_003303160  hitchhiker  0.00102133  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0088  CDS  NC_013512  85651  86367  717  putative phage integrase  YP_003303161  normal  0.0179321  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0089  CDS  NC_013512  86369  86992  624  hypothetical protein  YP_003303162  normal  0.104299  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0090  CDS  NC_013512  86999  88180  1182  glutathionylspermidine synthase  YP_003303163  normal  0.346525  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0091  CDS  NC_013512  88184  89116  933  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  YP_003303164  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0092  CDS  NC_013512  89126  89623  498  protein of unknown function DUF520  YP_003303165  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0093  CDS  NC_013512  89627  89926  300  hypothetical protein  YP_003303166  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0094  CDS  NC_013512  89936  90298  363  diacylglycerol kinase  YP_003303167  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0095  CDS  NC_013512  90301  90636  336  hypothetical protein  YP_003303168  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0096  CDS  NC_013512  90630  91817  1188  ATP-binding region ATPase domain protein  YP_003303169  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0097  CDS  NC_013512  91777  92445  669  response regulator receiver  YP_003303170  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0098  CDS  NC_013512  92435  92653  219  hypothetical protein  YP_003303171  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0099  CDS  NC_013512  92656  93252  597  protein of unknown function DUF330  YP_003303172  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Sdel_0100  CDS  NC_013512  93410  94360  951  Mammalian cell entry related domain protein  YP_003303173  normal  n/a    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>