3568 genes were found for organism Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dbac_0001  CDS  NC_013173  331  1680  1350  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003156547  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0002  CDS  NC_013173  1767  3839  2073  putative PAS/PAC sensor protein  YP_003156548  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0003  CDS  NC_013173  3859  4848  990  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  YP_003156549  normal  0.11115  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0004  CDS  NC_013173  4946  6274  1329  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  YP_003156550  normal  0.197437  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0005  CDS  NC_013173  6264  8480  2217  type I secretion system ATPase  YP_003156551  normal  0.4635  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0006  CDS  NC_013173  8923  16281  7359  von Willebrand factor type A  YP_003156552  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0007  CDS  NC_013173  16330  16965  636  hypothetical protein  YP_003156553  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0008  CDS  NC_013173  17501  24511  7011  Hemolysin-type calcium-binding region  YP_003156554  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0009  CDS  NC_013173  24593  25111  519  hypothetical protein  YP_003156555  normal  0.358466  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0010  CDS  NC_013173  25254  26585  1332  type I secretion outer membrane protein, TolC family  YP_003156556  normal  0.444301  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0011  CDS  NC_013173  26800  26898  99  hypothetical protein  YP_003156557  normal  0.059588  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0012  CDS  NC_013173  27102  29255  2154  ferrous iron transport protein B  YP_003156558  hitchhiker  0.00299021  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0013  CDS  NC_013173  29252  29509  258  FeoA family protein  YP_003156559  hitchhiker  7.78712e-08  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0014  CDS  NC_013173  29597  29758  162  hypothetical protein  YP_003156560  unclonable  2.00541e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0015  CDS  NC_013173  30060  30398  339  hypothetical protein  YP_003156561  unclonable  3.51673e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0016  CDS  NC_013173  30445  31185  741  beta-lactamase domain protein  YP_003156562  hitchhiker  3.73362e-08  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0017  CDS  NC_013173  31264  32085  822  hypothetical protein  YP_003156563  hitchhiker  8.71636e-05  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0018  CDS  NC_013173  32212  33192  981  Mg2 transporter protein CorA family protein  YP_003156564  hitchhiker  0.000124809  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0019  CDS  NC_013173  33242  34267  1026  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  YP_003156565  normal  0.0416556  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0020  CDS  NC_013173  34251  34841  591  CheB methylesterase  YP_003156566  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0021  CDS  NC_013173  34838  35671  834  MCP methyltransferase, CheR-type  YP_003156567  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0022  CDS  NC_013173  35668  39738  4071  GAF sensor hybrid histidine kinase  YP_003156568  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0023  CDS  NC_013173  40319  41251  933  Mg2 transporter protein CorA family protein  YP_003156569  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0024  CDS  NC_013173  41309  41935  627  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_003156570  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0025  CDS  NC_013173  42082  43704  1623  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  YP_003156571  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0026  CDS  NC_013173  44187  46247  2061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003156572  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0027  CDS  NC_013173  46382  46852  471  hypothetical protein  YP_003156573  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0028  CDS  NC_013173  46845  48149  1305  diguanylate cyclase  YP_003156574  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0029  CDS  NC_013173  48160  48270  111  hypothetical protein  YP_003156575  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0030  CDS  NC_013173  48336  49574  1239  HI0933 family protein  YP_003156576  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0031  CDS  NC_013173  49846  50337  492  UspA domain protein  YP_003156577  normal  0.781417  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0032  CDS  NC_013173  50355  52568  2214  TRAP transporter, 4TM/12TM fusion protein  YP_003156578  normal  0.764201  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0033  CDS  NC_013173  52662  53621  960  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  YP_003156579  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0034  CDS  NC_013173  53728  54897  1170  peptidase M20  YP_003156580  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0035  CDS  NC_013173  54894  56456  1563  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  YP_003156581  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0036  CDS  NC_013173  56453  57877  1425  protein of unknown function DUF201  YP_003156582  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0037  CDS  NC_013173  58090  58476  387  hypothetical protein  YP_003156583  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0038  CDS  NC_013173  58638  59561  924  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003156584  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0039  CDS  NC_013173  59660  60556  897  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_003156585  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0040  CDS  NC_013173  60556  61146  591  SNO glutamine amidotransferase  YP_003156586  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0041  CDS  NC_013173  61203  62924  1722  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003156587  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0042  CDS  NC_013173  63104  64384  1281  amidohydrolase  YP_003156588  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0043  CDS  NC_013173  64375  64878  504  ATP:corrinoid adenosyltransferase BtuR/CobO/CobP  YP_003156589  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0044  CDS  NC_013173  64901  65932  1032  Radical SAM domain protein  YP_003156590  normal  0.671161  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0045  CDS  NC_013173  65936  66187  252  hypothetical protein  YP_003156591  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0046  CDS  NC_013173  66321  67382  1062  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  YP_003156592  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0047  CDS  NC_013173  67488  68768  1281  Radical SAM domain protein  YP_003156593  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0048  CDS  NC_013173  68846  69238  393  30S ribosomal protein S9  YP_003156594  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0049  CDS  NC_013173  69257  69685  429  ribosomal protein L13  YP_003156595  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0050  CDS  NC_013173  69928  71178  1251  hypothetical protein  YP_003156596  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0051  CDS  NC_013173  71236  71712  477  putative signal transduction protein with CBS domains  YP_003156597  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0052  CDS  NC_013173  71820  75062  3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003156598  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0053  CDS  NC_013173  75146  77560  2415  ATP-dependent protease La  YP_003156599  unclonable  9.30171e-07  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0054  CDS  NC_013173  77688  78368  681  DNA repair protein RadC  YP_003156600  unclonable  1.85738e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0055  CDS  NC_013173  78365  79318  954  DNA polymerase III, delta  YP_003156601  hitchhiker  6.01887e-05  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0056  CDS  NC_013173  79327  79905  579  hypothetical protein  YP_003156602  normal  0.0125376  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0057  CDS  NC_013173  79853  82342  2490  leucyl-tRNA synthetase  YP_003156603  normal  0.300018  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0058  CDS  NC_013173  82350  82814  465  NusB antitermination factor  YP_003156604  normal  0.233824  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0059  CDS  NC_013173  82825  83295  471  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  YP_003156605  normal  0.275733  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0060  CDS  NC_013173  83315  84529  1215  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  YP_003156606  normal  0.194891  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0061  CDS  NC_013173  84569  85225  657  riboflavin synthase subunit alpha  YP_003156607  normal  0.201459  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0062  CDS  NC_013173  85228  86352  1125  riboflavin biosynthesis protein RibD  YP_003156608  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0063  CDS  NC_013173  86345  86806  462  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_003156609  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0064  CDS  NC_013173  86890  88128  1239  serine hydroxymethyltransferase  YP_003156610  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0065  CDS  NC_013173  88170  89411  1242  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  YP_003156611  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0066  CDS  NC_013173  89524  89754  231  acyl carrier protein  YP_003156612  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0067  CDS  NC_013173  89799  90542  744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_003156613  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0068  CDS  NC_013173  90598  91587  990  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  YP_003156614  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0069  CDS  NC_013173  91635  92702  1068  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_003156615  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0070  CDS  NC_013173  92695  92874  180  ribosomal protein L32  YP_003156616  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0071  CDS  NC_013173  92901  93431  531  protein of unknown function DUF177  YP_003156617  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0072  CDS  NC_013173  93627  93827  201  ribosomal protein L28  YP_003156618  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0073  CDS  NC_013173  93889  94485  597  Superoxide dismutase  YP_003156619  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0074  CDS  NC_013173  94647  95777  1131  putative RNA methylase  YP_003156620  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0075  CDS  NC_013173  95806  97200  1395  glutamyl-tRNA synthetase  YP_003156621  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0076  CDS  NC_013173  97332  97553  222  nitrogen-fixing NifU domain protein  YP_003156622  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0077  CDS  NC_013173  97602  97952  351  hypothetical protein  YP_003156623  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0078  CDS  NC_013173  97952  98206  255  glutaredoxin  YP_003156624  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0079  CDS  NC_013173  98330  99484  1155  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  YP_003156625  normal  0.525182  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0080  CDS  NC_013173  99557  100435  879  RarD protein, DMT superfamily transporter  YP_003156626  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0081  CDS  NC_013173  100489  101295  807  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  YP_003156627  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0082  CDS  NC_013173  101360  101965  606  nitroreductase  YP_003156628  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0083  CDS  NC_013173  101982  103382  1401  fumarate hydratase  YP_003156629  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0084  CDS  NC_013173  103455  104222  768  glycosyl transferase family 2  YP_003156630  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0085  CDS  NC_013173  104215  104850  636  thymidylate kinase  YP_003156631  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0086  CDS  NC_013173  104863  105948  1086  metal dependent phosphohydrolase  YP_003156632  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0087  CDS  NC_013173  106197  106541  345  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003156633  normal  0.803989  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0088  CDS  NC_013173  106522  107670  1149  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit alpha  YP_003156634  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0089  CDS  NC_013173  107673  108509  837  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  YP_003156635  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0090  CDS  NC_013173  108502  109113  612  2-oxoglutarate synthase  YP_003156636  normal  0.992901  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0091  CDS  NC_013173  109071  109823  753  stationary-phase survival protein SurE  YP_003156637  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0092  CDS  NC_013173  109853  110776  924  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  YP_003156638  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0093  CDS  NC_013173  110795  111790  996  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  YP_003156639  normal  0.851144  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0094  CDS  NC_013173  112124  113842  1719  putative transcriptional regulator  YP_003156640  normal  0.130495  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0095    NC_013173  113940  114017  78      normal  0.136048  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0096  CDS  NC_013173  114099  117554  3456  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_003156641  normal  0.810427  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0097  CDS  NC_013173  117572  117964  393  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  YP_003156642  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0098  CDS  NC_013173  117964  118425  462  D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase  YP_003156643  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0099  CDS  NC_013173  118562  120238  1677  CgeB family protein  YP_003156644  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0100  CDS  NC_013173  120242  121630  1389  glycosyl transferase family 9  YP_003156645  normal  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>