3078 genes were found for organism Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Huta_0001  CDS  NC_013158  73  2172  2100  Vesicle-fusing ATPase  YP_003128924  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0002  CDS  NC_013158  2358  2783  426  hypothetical protein  YP_003128925  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0003  CDS  NC_013158  2820  3044  225  hypothetical protein  YP_003128926  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0004  CDS  NC_013158  3082  3333  252  hypothetical protein  YP_003128927  normal  0.714664  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0005  CDS  NC_013158  3372  4454  1083  geranylgeranyl reductase  YP_003128928  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0006  CDS  NC_013158  4481  5419  939  PfkB domain protein  YP_003128929  normal  0.997573  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0007  CDS  NC_013158  5482  7611  2130  DNA mismatch repair protein MutL  YP_003128930  normal  0.953905  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0008  CDS  NC_013158  7924  8670  747  protein of unknown function DUF1405  YP_003128931  normal  0.0306436  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0009  CDS  NC_013158  8709  9221  513  hypothetical protein  YP_003128932  normal  0.0110123  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0010  CDS  NC_013158  9362  9877  516  hypothetical protein  YP_003128933  normal  0.0237448  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0011  CDS  NC_013158  9884  13504  3621  hypothetical protein  YP_003128934  normal  0.0504408  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0012  CDS  NC_013158  13495  14484  990  hypothetical protein  YP_003128935  normal  0.243117  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0013  CDS  NC_013158  14481  14933  453  hypothetical protein  YP_003128936  normal  0.263885  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0014  CDS  NC_013158  14989  16695  1707  type II secretion system protein  YP_003128937  normal  0.198638  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0015  CDS  NC_013158  16695  18629  1935  type II secretion system protein E  YP_003128938  normal  0.529162  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0016  CDS  NC_013158  18902  19180  279  MoaD family protein  YP_003128939  normal  0.767605  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0017  CDS  NC_013158  19256  19741  486  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  YP_003128940  normal  0.508446  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0018    NC_013158  19893  20225  333      normal  0.178148  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0019  CDS  NC_013158  20245  20931  687  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  YP_003128941  normal  0.67767  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0020  CDS  NC_013158  21169  21744  576  hypothetical protein  YP_003128942  normal  0.823321  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0021  CDS  NC_013158  21737  22366  630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  YP_003128943  normal  0.581068  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0022  CDS  NC_013158  22366  23784  1419  Cytochrome b/b6 domain protein  YP_003128944  normal  0.401541  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0023  CDS  NC_013158  23777  23962  186  hypothetical protein  YP_003128945  normal  0.349792  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0024  CDS  NC_013158  23959  26814  2856  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  YP_003128946  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0025  CDS  NC_013158  26814  27863  1050  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  YP_003128947  normal  0.380385  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0026  CDS  NC_013158  27916  28767  852  DMSO reductase family type II enzyme, heme b subunit  YP_003128948  normal  0.282137  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0027  CDS  NC_013158  28764  29498  735  DMSO reductase family type II enzyme chaperone  YP_003128949  normal  0.22584  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0028  CDS  NC_013158  29498  30367  870  putative ABC-type phosphate transport system permease component  YP_003128950  normal  0.103563  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0029  CDS  NC_013158  30360  31154  795  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  YP_003128951  normal  0.158294  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0030  CDS  NC_013158  31191  31442  252  hypothetical protein  YP_003128952  normal  0.0465583  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0031  CDS  NC_013158  31578  32696  1119  Radical SAM domain protein  YP_003128953  normal  0.082628  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0032  CDS  NC_013158  32748  33044  297  hypothetical protein  YP_003128954  normal  0.0241551  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0033  CDS  NC_013158  33041  33817  777  MOSC domain containing protein  YP_003128955  normal  0.0250865  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0034  CDS  NC_013158  33866  34099  234  hypothetical protein  YP_003128956  normal  0.176375  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0035  CDS  NC_013158  34293  35381  1089  nitrite reductase, copper-containing  YP_003128957  normal  0.208873  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0036  CDS  NC_013158  35427  37268  1842  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  YP_003128958  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0037  CDS  NC_013158  37265  38467  1203  molybdenum cofactor synthesis domain protein  YP_003128959  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0038  CDS  NC_013158  38564  39217  654  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  YP_003128960  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0039  CDS  NC_013158  39214  40032  819  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoaE  YP_003128961  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0040  CDS  NC_013158  40099  40602  504  molybdenum cofactor synthesis domain protein  YP_003128962  normal  0.130603  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0041  CDS  NC_013158  40700  40894  195  hypothetical protein  YP_003128963  normal  0.0458571  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0042  CDS  NC_013158  41238  42998  1761  cytochrome c oxidase, subunit I  YP_003128964  normal  0.0382499  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0043  CDS  NC_013158  43191  43463  273  hypothetical protein  YP_003128965  normal  0.0548246  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0044  CDS  NC_013158  43563  43952  390  cox cluster protein  YP_003128966  normal  0.0294752  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0045  CDS  NC_013158  44114  46657  2544  hypothetical protein  YP_003128967  normal  0.370915  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0046  CDS  NC_013158  46761  47066  306  hypothetical protein  YP_003128968  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0047  CDS  NC_013158  47230  48618  1389  adenylosuccinate synthetase  YP_003128969  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0048  CDS  NC_013158  48634  49728  1095  oxidoreductase domain protein  YP_003128970  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0049  CDS  NC_013158  49838  50032  195  protein of unknown function DUF343  YP_003128971  normal  0.625626  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0050  CDS  NC_013158  50066  50623  558  hypothetical protein  YP_003128972  normal  0.932906  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0051  CDS  NC_013158  50675  51142  468  hypothetical protein  YP_003128973  normal  0.829044  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0052  CDS  NC_013158  51210  52700  1491  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_003128974  normal  0.227151  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0053  CDS  NC_013158  52772  52939  168  hypothetical protein  YP_003128975  normal  0.0591385  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0054  CDS  NC_013158  52936  53913  978  magnesium and cobalt transport protein CorA  YP_003128976  normal  0.0349471  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0055  CDS  NC_013158  54599  55840  1242  protein of unknown function DUF112 transmembrane  YP_003128977  normal  0.0613814  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0056  CDS  NC_013158  55964  56869  906  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_003128978  normal  0.0183789  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0057  CDS  NC_013158  56900  58165  1266  MscS Mechanosensitive ion channel  YP_003128979  normal  0.185804  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0058  CDS  NC_013158  58168  59043  876  homoserine kinase  YP_003128980  normal  0.188045  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0059  CDS  NC_013158  59150  61339  2190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003128981  normal  0.318391  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0060  CDS  NC_013158  61419  62732  1314  hypothetical protein  YP_003128982  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0061  CDS  NC_013158  62882  63781  900  hypothetical protein  YP_003128983  normal  0.239241  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0062  CDS  NC_013158  63851  64258  408  hypothetical protein  YP_003128984  normal  0.216614  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0063  CDS  NC_013158  64325  64933  609  hypothetical protein  YP_003128985  normal  0.342508  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0064  CDS  NC_013158  65131  66375  1245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_003128986  normal  0.11367  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0065  CDS  NC_013158  66442  66858  417  hypothetical protein  YP_003128987  decreased coverage  0.00663312  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0066  CDS  NC_013158  66939  67469  531  hypothetical protein  YP_003128988  decreased coverage  0.00292003  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0067  CDS  NC_013158  67622  67876  255  hypothetical protein  YP_003128989  hitchhiker  0.00408843  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0068  CDS  NC_013158  67922  69664  1743  PurK operon protein / membrane-bound mannosyltransferase  YP_003128990  normal  0.0587914  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0069  CDS  NC_013158  69742  72963  3222  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_003128991  normal  0.503132  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0070  CDS  NC_013158  72971  73492  522  hypothetical protein  YP_003128992  normal  0.153757  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0071  CDS  NC_013158  73509  74468  960  methionine aminopeptidase  YP_003128993  normal  0.186393  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0072  CDS  NC_013158  74566  75906  1341  transposase  YP_003128994  normal  0.198369  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0073  CDS  NC_013158  75949  76092  144  hypothetical protein  YP_003128995  normal  0.267987  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0074  CDS  NC_013158  76760  77302  543  histidine triad (HIT) protein  YP_003128996  normal  0.461162  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0075  CDS  NC_013158  77342  77485  144  hypothetical protein  YP_003128997  normal  0.252124  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0076  CDS  NC_013158  77602  78549  948  cation diffusion facilitator family transporter  YP_003128998  normal  0.097535  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0077  CDS  NC_013158  78597  79979  1383  Phosphomannomutase  YP_003128999  normal  0.133339  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0078  CDS  NC_013158  79999  80448  450  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  YP_003129000  normal  0.305356  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0079  CDS  NC_013158  80620  81609  990  Cobalamin-independent synthase MetE domain protein  YP_003129001  normal  0.0833926  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0080  CDS  NC_013158  81606  82658  1053  methionine synthase  YP_003129002  normal  0.0497366  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0081  CDS  NC_013158  82773  83213  441  hypothetical protein  YP_003129003  normal  0.113411  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0082  CDS  NC_013158  83234  83707  474  NUDIX hydrolase  YP_003129004  normal  0.348807  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0083  CDS  NC_013158  83788  84759  972  Transcription factor TFIIB cyclin-related  YP_003129005  normal  0.404784  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0084  CDS  NC_013158  84929  85207  279  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  YP_003129006  normal  0.409735  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0085  CDS  NC_013158  85204  86508  1305  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  YP_003129007  normal  0.626452  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0086  CDS  NC_013158  86615  87043  429  hypothetical protein  YP_003129008  normal  0.492279  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0087  CDS  NC_013158  87072  87443  372  hypothetical protein  YP_003129009  normal  0.701846  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0088  CDS  NC_013158  87457  88566  1110  glycosyl transferase group 1  YP_003129010  normal  0.323047  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0089  CDS  NC_013158  88658  88957  300  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  YP_003129011  normal  0.949378  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0090  CDS  NC_013158  89054  89302  249  protein of unknown function UPF0044  YP_003129012  normal  0.784423  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0091  CDS  NC_013158  89299  90192  894  MscS Mechanosensitive ion channel  YP_003129013  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0092  CDS  NC_013158  90228  91244  1017  lipolytic protein G-D-S-L family  YP_003129014  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0093  CDS  NC_013158  91741  92124  384  hypothetical protein  YP_003129015  normal  0.743612  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0094  CDS  NC_013158  92214  92531  318  hypothetical protein  YP_003129016  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0095  CDS  NC_013158  92603  93016  414  CoA-binding domain protein  YP_003129017  normal  0.784423  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0096  CDS  NC_013158  93569  93718  150  hypothetical protein  YP_003129018  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0097  CDS  NC_013158  94020  94295  276  hypothetical protein  YP_003129019  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0098  CDS  NC_013158  94818  95285  468  hypothetical protein  YP_003129020  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0099  CDS  NC_013158  95385  95633  249  transcriptional regulator, PadR-like family  YP_003129021  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Huta_0100  CDS  NC_013158  95875  96600  726  protein of unknown function DUF45  YP_003129022  normal  n/a    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>