107 genes were found for organism Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rmar_2808  CDS  NC_013502  37  2838  -  2802  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  YP_003292064  normal  0.843003  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2809  CDS  NC_013502  2835  4280  -  1446  CRISPR-associated protein, GSU0054 family  YP_003292065  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2810  CDS  NC_013502  4277  5509  -  1233  hypothetical protein  YP_003292066  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2811  CDS  NC_013502  5735  6001  -  267  hypothetical protein  YP_003292067  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2812  CDS  NC_013502  6778  7821  +  1044  helix-turn-helix domain protein  YP_003292068  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2813  CDS  NC_013502  8008  8169  -  162  hypothetical protein  YP_003292069  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2814    NC_013502  8304  8555  -  252      normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2815  CDS  NC_013502  8638  9528  -  891  beta-lactamase  YP_003292070  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2816  CDS  NC_013502  9542  11170  -  1629  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  YP_003292071  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2817  CDS  NC_013502  11170  12237  -  1068  hypothetical protein  YP_003292072  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2818  CDS  NC_013502  12209  15604  -  3396  hypothetical protein  YP_003292073  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2819  CDS  NC_013502  15619  18312  -  2694  TonB-dependent receptor  YP_003292074  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2820  CDS  NC_013502  18385  21093  -  2709  FG-GAP repeat protein  YP_003292075  normal  0.517376  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2821  CDS  NC_013502  22111  23535  -  1425  ATPase  YP_003292076  decreased coverage  0.000929757  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2822  CDS  NC_013502  24946  26598  -  1653  CRISPR-associated RAMP protein, Csm5 family  YP_003292077  normal  0.0845679  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2823  CDS  NC_013502  26617  27636  -  1020  CRISPR-associated RAMP protein, Csm4 family  YP_003292078  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2824  CDS  NC_013502  27633  28427  -  795  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  YP_003292079  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2825  CDS  NC_013502  28444  28824  -  381  CRISPR-associated protein, Csm2 family  YP_003292080  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2826  CDS  NC_013502  28854  31067  -  2214  CRISPR-associated protein, Csm1 family  YP_003292081  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2827  CDS  NC_013502  31171  32043  -  873  response regulator receiver protein  YP_003292082  normal  0.383259  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2828  CDS  NC_013502  33405  33581  +  177  hypothetical protein  YP_003292083  decreased coverage  0.0000801961  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2829  CDS  NC_013502  33706  34728  +  1023  hypothetical protein  YP_003292084  hitchhiker  0.00607776  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2830  CDS  NC_013502  34747  36555  +  1809  hypothetical protein  YP_003292085  normal  0.220906  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2831  CDS  NC_013502  36563  37381  +  819  hypothetical protein  YP_003292086  normal  0.187271  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2832  CDS  NC_013502  37385  38665  +  1281  CRISPR-associated protein, TM1812 family  YP_003292087  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2833  CDS  NC_013502  38646  39038  +  393  CRISPR-associated protein, putative  YP_003292088  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2834  CDS  NC_013502  39152  39550  +  399  hypothetical protein  YP_003292089  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2835  CDS  NC_013502  39554  39919  +  366  hypothetical protein  YP_003292090  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2836  CDS  NC_013502  39973  41157  +  1185  CRISPR-associated protein, NE0113 family  YP_003292091  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2837  CDS  NC_013502  41164  42504  +  1341  CRISPR-associated protein DxTHG motif protein  YP_003292092  normal  0.974478  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2838  CDS  NC_013502  42490  43479  -  990  conserved hypothetical cytosolic protein  YP_003292093  normal  0.445341  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2839  CDS  NC_013502  43549  44424  -  876  heat shock protein DnaJ domain protein  YP_003292094  normal  0.0705284  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2840  CDS  NC_013502  44448  44729  -  282  CRISPR-associated protein Cas2  YP_003292095  normal  0.016788  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2841  CDS  NC_013502  44730  46307  -  1578  CRISPR-associated protein Cas1  YP_003292096  hitchhiker  0.00141566  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2842  CDS  NC_013502  46430  47140  -  711  hypothetical protein  YP_003292097  unclonable  0.0000023578  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2843  CDS  NC_013502  47137  47619  -  483  hypothetical protein  YP_003292098  unclonable  0.00000164273  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2844  CDS  NC_013502  47622  48221  -  600  protein of unknown function DUF1130  YP_003292099  unclonable  0.00000271396  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2845  CDS  NC_013502  48759  49133  -  375  hypothetical protein  YP_003292100  hitchhiker  0.000206777  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2846  CDS  NC_013502  49189  49509  -  321  hypothetical protein  YP_003292101  hitchhiker  0.000204936  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2847  CDS  NC_013502  49787  50143  -  357  hypothetical protein  YP_003292102  hitchhiker  0.000186379  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2848  CDS  NC_013502  50163  50432  -  270  hypothetical protein  YP_003292103  hitchhiker  0.00270303  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2849  CDS  NC_013502  50620  52656  +  2037  AAA ATPase  YP_003292104  normal  0.0353435  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2850  CDS  NC_013502  52674  54146  +  1473  hypothetical protein  YP_003292105  normal  0.35167  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2851  CDS  NC_013502  54377  54922  -  546  hypothetical protein  YP_003292106  normal  0.738002  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2852  CDS  NC_013502  55799  57331  -  1533  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  YP_003292107  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2853  CDS  NC_013502  57506  60595  +  3090  hypothetical protein  YP_003292108  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2854  CDS  NC_013502  60624  61115  +  492  hypothetical protein  YP_003292109  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2855  CDS  NC_013502  61286  61894  -  609  hypothetical protein  YP_003292110  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2856  CDS  NC_013502  61891  65622  -  3732  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  YP_003292111  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2857  CDS  NC_013502  66823  67425  -  603  hypothetical protein  YP_003292112  normal  0.550879  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2858  CDS  NC_013502  67672  68802  -  1131  transposase, IS605 OrfB family  YP_003292113  normal  0.551858  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2859  CDS  NC_013502  69088  69435  +  348  hypothetical protein  YP_003292114  normal  0.26802  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2860  CDS  NC_013502  69957  70892  +  936  hypothetical protein  YP_003292115  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2861  CDS  NC_013502  71267  71803  +  537  transposase  YP_003292116  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2862  CDS  NC_013502  71895  72197  +  303  prevent-host-death family protein  YP_003292117  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2863  CDS  NC_013502  72172  72600  +  429  PilT domain-containing protein  YP_003292118  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2864    NC_013502  72825  74296  -  1472      normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2865  CDS  NC_013502  74587  74790  -  204  hypothetical protein  YP_003292119  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2866  CDS  NC_013502  74787  75140  -  354  DNA polymerase beta domain protein region  YP_003292120  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2867  CDS  NC_013502  75298  75534  -  237  hypothetical protein  YP_003292121  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2868  CDS  NC_013502  75548  75778  -  231  hypothetical protein  YP_003292122  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2869    NC_013502  75798  76250  -  453      normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2870  CDS  NC_013502  76438  78348  -  1911  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003292123  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2871  CDS  NC_013502  79733  80455  +  723  hypothetical protein  YP_003292124  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2872  CDS  NC_013502  80461  80856  +  396  hypothetical protein  YP_003292125  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2873  CDS  NC_013502  80899  81159  -  261  hypothetical protein  YP_003292126  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2874    NC_013502  81156  82513  -  1358      normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2875  CDS  NC_013502  82543  83025  -  483  hypothetical protein  YP_003292127  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2876  CDS  NC_013502  83026  83148  +  123  hypothetical protein  YP_003292128  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2877  CDS  NC_013502  83145  83597  -  453  hypothetical protein  YP_003292129  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2878    NC_013502  83651  84296  -  646      normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2879  CDS  NC_013502  84965  85852  +  888  plasmid encoded RepA protein  YP_003292130  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2880    NC_013502  86292  88118  +  1827      normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2881  CDS  NC_013502  88629  89795  +  1167  transposase, IS605 OrfB family  YP_003292131  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2882  CDS  NC_013502  89866  90348  +  483  hypothetical protein  YP_003292132  normal  0.576452  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2883  CDS  NC_013502  90485  90898  -  414  PilT protein domain protein  YP_003292133  normal  0.548802  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2884  CDS  NC_013502  90895  91113  -  219  transcriptional regulator, CopG family  YP_003292134  normal  0.477393  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2885  CDS  NC_013502  91314  92303  -  990  transcriptional regulator protein-like protein  YP_003292135  normal  0.379735  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2886  CDS  NC_013502  92502  93455  +  954  hypothetical protein  YP_003292136  normal  0.31904  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2887  CDS  NC_013502  93498  93695  +  198  hypothetical protein  YP_003292137  normal  0.900221  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2888  CDS  NC_013502  94010  94546  +  537  hypothetical protein  YP_003292138  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2889  CDS  NC_013502  94611  95474  +  864  Type II site-specific deoxyribonuclease  YP_003292139  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2890  CDS  NC_013502  95471  96358  +  888  DNA adenine methylase  YP_003292140  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2891    NC_013502  96396  96594  +  199      normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2892  CDS  NC_013502  96632  98383  +  1752  type III restriction protein res subunit  YP_003292141  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2893  CDS  NC_013502  98401  99114  +  714  restriction modification system DNA specificity domain protein  YP_003292142  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2894  CDS  NC_013502  99220  99915  +  696  hypothetical protein  YP_003292143  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2895    NC_013502  99908  102269  -  2362      normal  0.69551  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2896    NC_013502  100574  101964  -  1391      normal  0.468281  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2897  CDS  NC_013502  102430  102597  +  168  hypothetical protein  YP_003292144  normal  0.917638  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2898  CDS  NC_013502  102905  103192  +  288  hypothetical protein  YP_003292145  normal  0.932627  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2899  CDS  NC_013502  103453  105042  -  1590  beta-lactamase domain protein  YP_003292146  normal  0.920708  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2900    NC_013502  105374  105805  -  432      normal  0.474865  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2901  CDS  NC_013502  105805  106044  -  240  prevent-host-death family protein  YP_003292147  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2902  CDS  NC_013502  106103  106366  +  264  hypothetical protein  YP_003292148  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2903  CDS  NC_013502  106456  107766  -  1311  hypothetical protein  YP_003292149  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2904  CDS  NC_013502  107900  108082  +  183  hypothetical protein  YP_003292150  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2905  CDS  NC_013502  108474  108806  +  333  hypothetical protein  YP_003292151  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2906  CDS  NC_013502  108923  113515  -  4593  hypothetical protein  YP_003292152  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2907  CDS  NC_013502  115015  115158  -  144  hypothetical protein  YP_003292153  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>