1867 genes were found for organism Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dtur_0001  CDS  NC_011661  75  1406  1332  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_002351956  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0002  CDS  NC_011661  1409  2254  846  HflC protein  YP_002351957  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0003  CDS  NC_011661  2251  3240  990  HflK protein  YP_002351958  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0004  CDS  NC_011661  3251  3655  405  hypothetical protein  YP_002351959  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0005  CDS  NC_011661  3832  5886  2055  PEGA domain protein  YP_002351960  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0006  CDS  NC_011661  5977  7650  1674  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_002351961  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0007  CDS  NC_011661  7817  9076  1260  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  YP_002351962  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0008  CDS  NC_011661  9104  9880  777  hypothetical protein  YP_002351963  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0009  CDS  NC_011661  9871  10569  699  ABC-2 type transporter  YP_002351964  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0010  CDS  NC_011661  10566  11585  1020  ABC transporter related  YP_002351965  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0011  CDS  NC_011661  11610  12026  417  Ferritin Dps family protein  YP_002351966  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0012  CDS  NC_011661  12034  12789  756  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  YP_002351967  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0013  CDS  NC_011661  12779  14113  1335  domain of unknown function DUF1727  YP_002351968  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0014  CDS  NC_011661  14094  17462  3369  reverse gyrase  YP_002351969  normal  0.492155  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0015  CDS  NC_011661  17464  18486  1023  DNA replication and repair protein RecF  YP_002351970  normal  0.486493  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0016  CDS  NC_011661  18683  19207  525  GrpE protein  YP_002351971  normal  0.0339785  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0017  CDS  NC_011661  19185  21008  1824  chaperone protein DnaK  YP_002351972  normal  0.0836411  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0018  CDS  NC_011661  21011  22177  1167  chaperone protein DnaJ  YP_002351973  normal  0.253679  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0019  CDS  NC_011661  22262  23353  1092  hypothetical protein  YP_002351974  unclonable  1.82586e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0020  CDS  NC_011661  23593  24192  600  SOS-response transcriptional repressor, LexA  YP_002351975  hitchhiker  3.09012e-07  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0021  CDS  NC_011661  24309  25763  1455  FAD dependent oxidoreductase  YP_002351976  normal  0.0147629  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0022  CDS  NC_011661  25747  26994  1248  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_002351977  normal  0.372109  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0023  CDS  NC_011661  26997  27404  408  protein of unknown function DUF1667  YP_002351978  normal  0.184277  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0024  CDS  NC_011661  27308  28528  1221  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002351979  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0025  CDS  NC_011661  28744  29841  1098  glutamine amidotransferase class-II  YP_002351980  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0026    NC_011661  29838  31345  1508      normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0027    NC_011661  31346  31561  216      normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0028    NC_011661  31571  31786  216      normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0029  CDS  NC_011661  31789  32547  759  glutamate synthase alpha subunit domain protein  YP_002351981  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0030  CDS  NC_011661  32631  33566  936  cysteine synthase A  YP_002351982  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0031  CDS  NC_011661  33563  35230  1668  phosphoribulokinase/uridine kinase  YP_002351983  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0032  CDS  NC_011661  35319  36158  840  hypothetical protein  YP_002351984  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0033  CDS  NC_011661  36202  36471  270  chaperonin Cpn10  YP_002351985  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0034  CDS  NC_011661  36495  36740  246  glutaredoxin-like protein, YruB-family  YP_002351986  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0035  CDS  NC_011661  36889  37818  930  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  YP_002351987  normal  0.643061  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0036  CDS  NC_011661  37835  38629  795  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_002351988  normal  0.875943  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0037  CDS  NC_011661  38662  39522  861  hypothetical protein  YP_002351989  normal  0.37696  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0038  CDS  NC_011661  39519  40106  588  ATP:corrinoid adenosyltransferase BtuR/CobO/CobP  YP_002351990  normal  0.0979163  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0039  CDS  NC_011661  40097  41674  1578  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  YP_002351991  hitchhiker  0.00530837  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0040  CDS  NC_011661  41698  42855  1158  aminotransferase class V  YP_002351992  normal  0.0119169  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0041  CDS  NC_011661  42863  43366  504  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  YP_002351993  hitchhiker  0.000415248  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0042  CDS  NC_011661  43508  43894  387  protein of unknown function DUF583  YP_002351994  hitchhiker  1.75069e-06  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0043  CDS  NC_011661  43913  44830  918  Peptidase M23  YP_002351995  unclonable  6.81555e-11  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0044  CDS  NC_011661  45023  45547  525  hypothetical protein  YP_002351996  hitchhiker  1.20123e-05  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0045  CDS  NC_011661  45544  46143  600  hypothetical protein  YP_002351997  normal  0.0126009  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0046  CDS  NC_011661  46140  46532  393  hypothetical protein  YP_002351998  normal  0.066217  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0047  CDS  NC_011661  46485  48530  2046  transglutaminase domain protein  YP_002351999  normal  0.10552  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0048  CDS  NC_011661  48567  49658  1092  protein of unknown function DUF58  YP_002352000  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0049  CDS  NC_011661  49655  50614  960  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  YP_002352001  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0050  CDS  NC_011661  50623  50814  192  hypothetical protein  YP_002352002  normal  0.56775  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0051  CDS  NC_011661  50854  51300  447  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_002352003  normal  0.596905  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0052  CDS  NC_011661  51456  52040  585  deoxycytidine triphosphate deaminase  YP_002352004  normal  0.767695  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0053  CDS  NC_011661  52042  52908  867  hypothetical protein  YP_002352005  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0054  CDS  NC_011661  52905  54293  1389  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  YP_002352006  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0055  CDS  NC_011661  54286  55317  1032  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_002352007  normal  0.726209  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0056  CDS  NC_011661  55365  56768  1404  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  YP_002352008  normal  0.10784  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0057  CDS  NC_011661  56780  58429  1650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  YP_002352009  normal  0.0512585  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0058  CDS  NC_011661  58546  59559  1014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002352010  hitchhiker  0.00233436  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0059  CDS  NC_011661  59561  60145  585  transcriptional regulator, TetR family  YP_002352011  hitchhiker  7.304e-05  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0060  CDS  NC_011661  60319  60564  246  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002352012  hitchhiker  1.60272e-05  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0061  CDS  NC_011661  60561  61577  1017  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  YP_002352013  hitchhiker  0.00188149  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0062  CDS  NC_011661  61577  62359  783  ABC-2 type transporter  YP_002352014  hitchhiker  5.66487e-05  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0063  CDS  NC_011661  62399  63418  1020  hypothetical protein  YP_002352015  hitchhiker  5.16278e-08  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0064  CDS  NC_011661  63415  64650  1236  competence/damage-inducible protein CinA  YP_002352016  unclonable  9.39052e-10  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0065  CDS  NC_011661  64736  66094  1359  metal dependent phosphohydrolase  YP_002352017  normal  0.041414  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0066  CDS  NC_011661  66091  67263  1173  amidohydrolase  YP_002352018  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0067  CDS  NC_011661  67303  68730  1428  Phosphomannomutase  YP_002352019  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0068  CDS  NC_011661  68762  69208  447  hypothetical protein  YP_002352020  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0069  CDS  NC_011661  69218  69664  447  hypothetical protein  YP_002352021  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0070  CDS  NC_011661  69661  70110  450  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_002352022  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0071  CDS  NC_011661  70179  70889  711  glycosyl transferase family 2  YP_002352023  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0072  CDS  NC_011661  70896  72128  1233  protein of unknown function DUF205  YP_002352024  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0073  CDS  NC_011661  72202  73074  873  homocysteine S-methyltransferase  YP_002352025  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0074  CDS  NC_011661  73174  73572  399  hydrogenase nickel incorporation protein  YP_002352026  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0075  CDS  NC_011661  73569  74306  738  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002352027  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0076  CDS  NC_011661  74325  76004  1680  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  YP_002352028  normal  0.75307  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0077  CDS  NC_011661  76024  76566  543  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  YP_002352029  normal  0.919997  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0078  CDS  NC_011661  76579  78003  1425  nickel-dependent hydrogenase large subunit  YP_002352030  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0079  CDS  NC_011661  78000  78422  423  hydrogenase maturation protease  YP_002352031  normal  0.882887  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0080  CDS  NC_011661  78419  80644  2226  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  YP_002352032  normal  0.442925  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0081  CDS  NC_011661  80648  83074  2427  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  YP_002352033  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0082  CDS  NC_011661  83294  85204  1911  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002352034  normal  0.5866  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0083  CDS  NC_011661  85270  86274  1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002352035  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0084  CDS  NC_011661  86303  87172  870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002352036  normal  0.726209  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0085  CDS  NC_011661  87191  88165  975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002352037  normal  0.482308  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0086  CDS  NC_011661  88182  89162  981  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002352038  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0087  CDS  NC_011661  89165  89377  213  hypothetical protein  YP_002352039  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0088  CDS  NC_011661  89559  89774  216  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  YP_002352040  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0089  CDS  NC_011661  89775  90833  1059  hydrogenase expression/formation protein HypD  YP_002352041  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0090  CDS  NC_011661  90837  91838  1002  hydrogenase expression/formation protein HypE  YP_002352042  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0091  CDS  NC_011661  91845  92678  834  hypothetical protein  YP_002352043  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0092  CDS  NC_011661  93130  94266  1137  protein of unknown function DUF362  YP_002352044  normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0093  CDS  NC_011661  94269  95339  1071  ABC-2 type transporter  YP_002352045  normal  0.154072  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0094  CDS  NC_011661  95336  96502  1167  ABC-2 type transporter  YP_002352046  decreased coverage  0.00282283  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0095  CDS  NC_011661  96499  97431  933  ABC transporter related  YP_002352047  decreased coverage  6.02484e-06  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0096  CDS  NC_011661  97483  98214  732  RNA-binding S4 domain protein  YP_002352048  normal  0.110386  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0097  CDS  NC_011661  98261  99952  1692  beta-mannanase/endoglucanase A  YP_002352049  normal  0.0700472  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0098  CDS  NC_011661  100341  100739  399  hypothetical protein  YP_002352050  normal  0.857754  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0099    NC_011661  100826  101081  256      normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0100    NC_011661  101327  101491  165      normal  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>